[发明专利]基于m6A相关的IncRNA网络胃癌预后的模型构建及临床应用

说明书

本发明属于分子生物学及生物医学领域，具体涉及基于m6A相关的IncRNA网络胃癌预后的模型构建及临床应用。本发明分析了m6A相关lncRNA和胃癌总体生存率之间的关系，发现了11处m6A相关lncRNA标记，并建立了预后模型以预测胃癌预后。所述预测胃癌预后的模型，含有与胃癌的预后有关的11种IncRNA。本发明提供基于m6A相关的IncRNA网络建立的预测模型来预测胃癌患者的预后，在多个数据集中验证了该模型的可行性，为分析胃癌相关LncRNA患者的预后提供了可靠的方法。该模型提供多个lncRNA作为生物标记物，提高了对于预测胃癌预后的灵敏度和准确性，对胃癌患者不良预后风险进行准确的预测和评估，对高风险患者进行重点监测和有效干预，从而降低胃癌患者的死亡率、局部复发率，改善患者的预后。

技术领域

本发明属于分子生物学及生物医学领域，具体涉及基于m6A相关的IncRNA网络胃癌预后的模型构建及临床应用。

背景技术

胃癌是最常见的恶性肿瘤之一，在所有肿瘤中胃癌的死亡率位列第三。大约80％的胃癌患者诊断时为进展期，这使很多患者预后不良。外科手术是迄今为止最适合胃癌的治疗方法，对于复发的或不可切除的晚期胃癌患者，其5年死亡率仍保持30％至50％，并没有令人满意的治疗方法。因此探索胃癌的潜在生物标记是有必要的，这有助于改善患者的预后。

长链非编码RNA(LncRNA)是指长度大于200bp的核苷酸，具有基因表达调节功能的不能编码产生蛋白质的一类RNA。LncRNA参与了胃癌的发生、发展、侵袭和转移等生物学行为，其作用方式有表观遗传调控、转录水平调节和转录后水平调节。一些证据表明，RNA修饰在基因表达的转录后调控中起着至关重要的作用。基于MODOMICS数据库，截至2017年底在所有生物体中已经发现了163种不同的RNA修饰。其中，6-甲基腺嘌呤(N6-methyladenosine，m6A)修饰是最常见的RNA修饰形式。其中，m6A修饰是最常见的RNA修饰形式之一。m6A甲基化作为一项动态可逆的过程，包含甲基转移酶复合物(写入器)，脱甲基酶(擦除器)和功能管理器(读取器)。写入器是由METTL3，METTL14，KIAA1429，WTAP，RBM15和ZC3H13组成，介导RNA甲基化修饰的过程。擦除器由FTO和ALKBH5组成，介导RNA的去甲基化过程。而读取器是负责“读取”RNA甲基化信息并参与下游RNA的翻译和降解，包括YTHDC1，YTHDC2，YTHDF1，YTHDF2和HNRNPC。m6A通过“写入器”组合RNA与甲基，并被“读取器”进一步识别以产生差异过程，例如RNA加工，核输出，翻译和衰变。最后，根据“擦除器”的作用，形成一个动态且可逆的过程，从而调节基因表达。目前，在一些肿瘤中已经发现m6A通过对LncRNA修饰进而影响肿瘤的发生发展。如有研究发现，m6A能够影响lncRNA-Malat1的剪切及丰度，从而调控细胞周期及肺癌的进展。另外RNA的m6A修饰也在多种癌症如急性髓系白血病，膀胱癌、恶性胶质细胞瘤等的调控作用也已被证实。但目前lncRNA的m6A修饰在胃癌中的作用尚不清楚。

目前，作为生物标志物的多个LncRNA对于预测胃癌的预后判定没有参考标准，也没有特异性的指标，远远不能适应对胃癌患者进行预后判定的需求。因此，寻找作为生物标志物的多个IncRNA对于预测胃癌的预后判定，以便选择最佳治疗方案，显著提高患者生存率，成为临床医学亟待解决的重要课题。

发明内容

鉴于现有技术存在的问题，本发明的目的在于提供一种基于m6A相关的IncRNA网络胃癌预后的模型构建及应用。本发明系统地分析了m6A相关lncRNA和胃癌总体生存率之间的关系，发现了11处m6A相关lncRNA标记，并建立了预后模型以预测胃癌预后。本发明提供多个lncRNA作为生物标记物，提高了对于预测胃癌预后的灵敏度和准确性，对胃癌患者不良预后风险进行准确的预测和评估，对高风险患者进行重点监测和有效干预，从而降低胃癌患者的死亡率、局部复发率，改善患者的预后。

为了实现上述目的，本发明采用以下技术方案。