[发明专利]一种新型冠状病毒荧光qRT-PCR法快速检测体系有效
申请号: | 202010981591.0 | 申请日: | 2020-09-17 |
公开(公告)号: | CN112159868B | 公开(公告)日: | 2022-07-01 |
发明(设计)人: | 李丹;董晋涛;秦资;李芳敏;祝君;巫益鸣;陈才夫;熊磊 | 申请(专利权)人: | 上海思路迪医学检验所有限公司 |
主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/686;C12N15/11;C12R1/93 |
代理公司: | 北京市兰台律师事务所 11354 | 代理人: | 张峰 |
地址: | 200120 上海市浦*** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 新型 冠状病毒 荧光 qrt pcr 快速 检测 体系 | ||
本发明涉及一种新型冠状病毒荧光qRT‑PCR法快速检测体系,通过优化靶向新型冠状病毒ORF1ab基因、N基因的引物探针及扩增体系的酶混合液(逆转录酶、DNA聚合酶和UNG酶)、镁离子浓度等,实现了扩增体系和扩增程序的优化,进而使扩增时间缩短至30min内,极大的缩短了检测时间,同时保证了对新型冠状病毒检测的灵敏度、特异性、重复性及准确性。
技术领域
本发明涉及分子生物学检测技术领域,尤其涉及一种新型冠状病毒荧光qRT-PCR法快速检测体系。
背景技术
2019新型冠状病毒(SARS-CoV-2)属于乙型冠状病毒属病毒,其基因特征与SARS-CoV和MERS-CoV有明显区别。SARS-CoV-2感染后引起的肺炎主要经飞沫、接触传播,人群普遍易感。SARS-CoV-2感染的一般症状有:发热、乏力、干咳,逐渐出现呼吸困难,部分患者起病症状轻微,甚至可无明显发热。严重症状有:急性呼吸窘迫综合征、脓毒性休克、难以纠正的代谢性酸中毒、出凝血功能障碍。除上述症状,还有可能具有如下不典型症状:如轻度纳差、乏力、恶心呕吐、腹泻、头痛等。从目前的收治的病例情况看,多数患者预后良好,少数患者病情危重,甚至与其它基础性疾病并发导致死亡。由于SARS-CoV-2传播性快,易造成大规模流行,因此及时、准确检测新型冠状病毒,对于对疫情监测以及预防具有重要意义。
目前用qRT-PCR检测SARS-CoV-2的核酸检测试剂盒,市面上已有销售,但是检测扩增时长都不少于60min。市售的快速的核酸检测试剂盒(30min),检测方法均为恒温扩增方法,灵敏度和特异性均达不到qRT-PCR检测方法。因此迫切需要一种能够快速并准确检测新型冠状病毒的试剂盒,且实现良好的灵敏度和特异性。
发明内容
为解决现有技术的不足,本发明提出一种新型冠状病毒荧光qRT-PCR法快速检测体系,扩增时间为半小时内,但是对于SARS-CoV-2检测的灵敏度、特异性方面均达到了市售的标准qRT-PCR的检测水平。
为实现以上目的,本发明所采用的技术方案包括:
引物探针组合物,其特征在于,包括选自如下的引物探针组:
用于检测新型冠状病毒ORF1ab基因的引物探针组A,所述引物探针组A包括SEQ IDNO.1所示的正向引物,SEQ ID NO.2所示的反向引物,SEQ ID NO.3所示的探针;
用于检测新型冠状病毒N基因的引物探针组B,所述引物探针组B包括SEQ ID NO.4所示的正向引物,SEQ ID NO.5所示的反向引物,SEQ ID NO.6所示的探针;
用于检测内标的引物探针组C,所述引物探针组C包括SEQ ID NO.7所示的正向引物,SEQ ID NO.8所示的反向引物,SEQ ID NO.9所示的探针。
一种用于新型冠状病毒检测的试剂盒,包括如上所述的引物探针组合物。
进一步地,所述引物探针组A和B的引物在RT-PCR反应体系中的终浓度均为0.8μM,所述引物探针组A和B的探针在RT-PCR反应体系中的终浓度均为0.4μM,所述探针组C的引物在RT-PCR反应体系中的终浓度为0.4μM,所述探针组C的引物在RT-PCR反应体系中的终浓度为0.2μM;所述RT-PCR(Reverse Transcription PCR)反应体系即逆转录PCR反应体系,RT-PCR反应中,首先经逆转录酶作用,RNA链被逆转录成为cDNA,再以所述cDNA为模板,在DNA聚合酶作用下扩增合成目的片段。
进一步地,所述试剂盒还包括Tris缓冲液、镁离子、dA/G/C/UTPs、DNA聚合酶、逆转录酶、Anti-Taq、BSA、UNG酶、RNasin。
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