[发明专利]SARS-CoV-2 RBD中和核酸适体的筛选方法及核酸适体在审
申请号: | 202010995577.6 | 申请日: | 2020-09-21 |
公开(公告)号: | CN114250221A | 公开(公告)日: | 2022-03-29 |
发明(设计)人: | 杨朝勇;宋彦龄;孙淼;魏心语;朱琳;宋婷 | 申请(专利权)人: | 厦门大学 |
主分类号: | C12N15/10 | 分类号: | C12N15/10;C12N15/115;G01N33/569;A61K31/7088;A61P31/14 |
代理公司: | 厦门市首创君合专利事务所有限公司 35204 | 代理人: | 张松亭;游学明 |
地址: | 361000 *** | 国省代码: | 福建;35 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | sars cov rbd 中和 核酸 筛选 方法 | ||
1.一种SARS-CoV-2RBD中和核酸适体的筛选方法,包括如下步骤:
1)化学合成一个60-120个碱基的DNA初始文库;取初始文库溶于结合缓冲液中,进行变性处理;
2)将至少两种源表达的重组SARS-CoV-2RBD蛋白作为适体筛选的交叉靶标;
3)将预处理的DNA文库与第一种源表达的重组SARS-CoV-2RBD蛋白共孵育;产物进行PCR扩增;PCR产物用于筛选;
4)先通过SELEX方法以保证第一种源表达的SARS-CoV-2RBD蛋白与DNA链的多个拷贝结合;
5)从步骤4)筛选之后,使用至少第二种源表达的SARS-CoV-2RBD蛋白与DNA孵育,以获得与至少两种源表达的RBD都能结合的序列;
6)引入ACE2竞争;之后收集与ACE2竞争的序列。
2.根据权利要求1所述的一种SARS-CoV-2RBD中和核酸适体的筛选方法,其特征在于:
交叉靶标包括人源表达的重组SARS-CoV-2RBD蛋白以及通过昆虫表达的重组SARS-CoV-2RBD蛋白。
3.根据权利要求1所述的一种SARS-CoV-2RBD中和核酸适体的筛选方法,其特征在于:
步骤4),在SELEX方法筛选过程中,采用反筛靶标,反筛压力逐轮增加。
4.根据权利要求1所述的一种SARS-CoV-2RBD中和核酸适体的筛选方法,其特征在于:
步骤5)中,利用His-tag RBD修饰的Ni琼脂糖微球来监测富集的过程。
5.根据权利要求1至4任一项所述的一种SARS-CoV-2RBD中和核酸适体的筛选方法筛选得到的序列。
6.SARS-CoV-2RBD中和核酸适体,其特征在于:其包括如下序列中的至少一种:
SEQ ID NO:1-SEQ ID NO:15。
7.根据权利要求6所述的SARS-CoV-2RBD中和核酸适体在制备新冠病毒SARS-CoV-2感染的检测试剂、预防形病毒感染药物或治疗药物中的用途。
8.根据权利要求6所述的SARS-CoV-2RBD中和核酸适体在用于中和环境中的新冠病毒SARS-CoV-2中的用途。
9.根据权利要求6所述的SARS-CoV-2RBD中和核酸适体,其特征在于:其包括如下序列中的至少一种:
1)17-13:ATCCAGAGTGACGCAGCACCCAAGAACAAGGACTGCTTAGGATTGCGATAGGTTCGGGGGACACGGTGGCTTAGTA;
2)17-13C3:CGCAGCACCCAAGAACAAGGACTGCTTAGGATTGCGATAGGTTCGG。
10.根据权利要求9所述的SARS-CoV-2RBD中和核酸适体在制备预防和/或治疗新冠病毒SARS-CoV-2感染药物中的用途。
11.SARS-CoV-2RBD中和核酸适体,其特征在于:为SEQ ID NO:1-SEQ ID NO:15所示序列的突变体或截短序列。
12.如权利要求11所述的SARS-CoV-2RBD中和核酸适体,其特征在于:所述的突变体,为和SEQ ID NO:1-SEQ ID NO:15所示序列具有80%以上同源性的序列。
13.如权利要求11所述的SARS-CoV-2RBD中和核酸适体,其特征在于:所述的突变体,为和SEQ ID NO:1-SEQ ID NO:15所示序列具有90%以上同源性的序列。
14.根据权利要求11至13任一项所述的SARS-CoV-2RBD中和核酸适体在制备新冠病毒SARS-CoV-2感染的检测试剂、预防形病毒感染药物或治疗药物、或中和环境中的新冠病毒中的用途。
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