[发明专利]基于COX10基因插入缺失多态性位点的心源性猝死易感性检测试剂盒有效
申请号: | 202011079845.6 | 申请日: | 2020-10-10 |
公开(公告)号: | CN112159841B | 公开(公告)日: | 2022-03-01 |
发明(设计)人: | 何艳;杨真真;于欢;高玉振 | 申请(专利权)人: | 苏州大学 |
主分类号: | C12Q1/6883 | 分类号: | C12Q1/6883;C12Q1/6858;C12N15/11 |
代理公司: | 苏州市中南伟业知识产权代理事务所(普通合伙) 32257 | 代理人: | 王玉仙 |
地址: | 215000 江苏*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 基于 cox10 基因 插入 缺失 多态性 心源性 猝死 感性 检测 试剂盒 | ||
本发明公开了一种基于COX10基因插入缺失多态性位点的心源性猝死易感性检测试剂盒。本发明的试剂盒中包含的特异性引物对是针对COX10基因上的rs397763766号插入缺失位点而设计,能特异性扩增出包含该位点的DNA片段并通过检测不同长度片段在毛细管电泳中的迁移率来识别不同基因型,结合病例对照研究发现,可认为被检测DNA的COX10基因上的rs397763766号插入缺失位点携带有缺失型等位基因者为SCD易感型。因此,该技术通过检测个体的COX10基因上的rs397763766号插入缺失位点的基因型,可以起到预测个体SCD的易感性的作用。
技术领域
本发明涉及一种基于COX10基因插入缺失多态性位点的心源性猝死易感性检测试剂盒,属于检测技术领域。
背景技术
心源性猝死(sudden cardiac death,SCD)是指由心脏原因引起的突发性的非预料死亡,表现为短期内发生的突发意识丧失及循环、呼吸骤停。“短期”规定为有目击者情况下小于1小时内,无目击者时则为24小时。流行病学表明,中国每年每10万人中有40.7人死于SCD,考虑到我国庞大的人口基数,SCD病例数量十分庞大。以往大量研究表明,SCD的死因多为冠状动脉粥样硬化性心脏病或致命性心律失常。前者多见于高龄人群,后者则多见于年轻人。考虑到死后的尸体解剖和组织学检查难以找到准确的死因,为了能准确诊断SCD,揭开SCD发生的分子机制、寻找SCD的遗传标记迫在眉睫。
过去针对SCD诊断领域的研究主要集中于对重要蛋白编码基因的编码区突变与猝死的关联性分析,然而相关的突变不仅数量有限,普通群体极低的基因频率难以完全解释相对而言较高的猝死发生率。随着全基因组关联研究及二代测序技术的发展,越来越多的遗传标记被发现参与SCD的调控。SCD遗传标记的识别能够进一步深入了解其潜在机制,优化SCD的风险分层,并为分子诊断和预防提供强有力的理论依据。考虑到3'UTR对基因表达起到重要的调控作用,我们把目光投向了这片区域内的遗传多态,通过病例对照研究分析相关基因中3'UTR的遗传多态性与SCD的易感性之间的关联,为建立可用于SCD风险评估的基因多态性检测体系提供了可能。
细胞色素c氧化酶组装因子血红素A:法尼基转移酶COX10(cytochrome coxidaseassembly factor heme A:farnesyltransferase COX10),是细胞核基因转录的线粒体氧化呼吸链上的功能性亚基,是血红素A辅基生成的关键酶。有研究表明其蛋白表达异常可导致体内能量生成障碍,影响心肌细胞的收缩功能,进而导致一系列的心脏功能改变。
现有技术中,并没有对rs397763766插入缺失多态与SCD相关性的研究报道,也没有通过检测COX10基因3'UTR的插入缺失多态位点来预测SCD的易感性的相关报道。
发明内容
为解决上述问题,本发明基于COX10基因上的rs397763766号插入缺失位点的多态性可用于评估个体患SCD的易感性,提供一种检测SCD易感性的试剂盒。
本发明的第一个目的是提供一种基于COX10基因插入缺失多态性位点的心源性猝死易感性检测试剂盒,所述的试剂盒用于检测COX10基因的rs397763766位点的基因型。
进一步地,所述的心源性猝死易感性检测试剂盒包括用于检测COX10基因的rs397763766位点的特异性引物对,以及用于PCR扩增和毛细管电泳的组件。
进一步地,所述特异性引物对包括有义引物和反义引物,有义引物的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示,反义引物的核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示:
SEQ ID No.1:5’-CCCCACCCCATTACTGTACC-3’;
SEQ ID No.2:5’-CCCAGCACACCCTTCTTCCT-3’。
进一步地,所述的有义引物的Tm值为62℃,所述的反义引物的Tm值为62℃。
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