[发明专利]一种用于鉴别肺结节良恶性的血浆游离DNA甲基化基因组合及其应用在审
申请号: | 202011112824.X | 申请日: | 2020-10-16 |
公开(公告)号: | CN112094912A | 公开(公告)日: | 2020-12-18 |
发明(设计)人: | 顾月清;刘云龙;胡子健 | 申请(专利权)人: | 中国药科大学 |
主分类号: | C12Q1/6886 | 分类号: | C12Q1/6886;C12Q1/6883;C12Q1/6851;C12N15/11 |
代理公司: | 南京天华专利代理有限责任公司 32218 | 代理人: | 傅婷婷;徐冬涛 |
地址: | 210009*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 用于 鉴别 结节 恶性 血浆 游离 dna 甲基化 基因 组合 及其 应用 | ||
1.一种用于鉴别肺结节良恶性的血浆游离DNA甲基化基因组合,其特征在于选自SOX17、SCT、RASSF1A、SHOX2、HOXA7和CDO1中的至少任意两种。
2.根据权利要求1所述的血浆游离DNA甲基化基因组合,其特征在于所述的组合至少包含SOX17和SCT。
3.根据权利要求1所述的血浆游离DNA甲基化基因组合,其特征在于所述的组合选自以下任意一种:组合1:SOX17和SCT;组合2:SOX17、SCT和SHOX2;组合3:SCT、SHOX2、HOXA7和CDO1;组合4:SOX17、SCT、SHOX2、HOXA7;组合5:SOX17、SCT、SHOX2、HOXA7和CDO1;组合6:SOX17、SCT、RASSF1A、SHOX2、HOXA7和CDO1。
4.权利要求1~3中任一项所述的血浆游离DNA甲基化基因组合作为检测靶点在制备鉴别肺结节良恶性的试剂中的应用。
5.一种组合物,其特征在于包含实时荧光定量PCR检测权利要求1~3中任一项所述的血浆游离DNA甲基化基因组合的引物和探针。
6.根据权利要求5所述的组合物,其特征在于检测SOX17、SCT、RASSF1A、SHOX2、HOXA7和CDO1的引物和探针序列分别如下所示:
其中,TaqMan探针的5'端标记的荧光基团为有机荧光染料或无机染料中的任一种,3'端标记猝灭基团为有机染料的任一种。
7.权利要求4~6中任一项所述的组合物在制备鉴别肺结节良恶性的试剂盒中的应用。
8.一种鉴别肺结节良恶性的试剂盒,其特征在于包含权利要求4~6中任一项所述的组合物。
9.根据权利要求8所述的肺癌辅助诊断试剂盒,其特征在于所述的试剂盒还包含荧光定量PCR检测内参基因GAPDH的引物和探针;优选地,荧光定量PCR检测GAPDH基因的引物如SEQ ID NO.37、38所示,TaqMan探针如SEQ ID NO.39所示。
10.根据权利要求8所述的肺癌辅助诊断试剂盒,其特征在于所述的试剂盒中还包含:PCR反应体系、阴性质控品和阳性质控品,所述的阴性质控品为无DNA酶的水或者经亚硫酸氢盐转化后的人基因组DNA,所述的阳性质控品为依照DNA检测靶标构建的稀释到一定浓度的人工合成质粒DNA。
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