[发明专利]一种合成On-DNA 2-羧基-3-氨基芳并噻吩化合物的方法

权利要求书

1.一种合成On-DNA 2-羧基-3-氨基芳并噻吩化合物的方法，其特征在于：所述方法是以On-DNA邻位卤素芳基甲腈化合物和巯基乙酸/巯基乙酸酯为原料，在碱的存在下反应得到On-DNA产物；其中，On-DNA邻位卤素芳基甲腈化合物的结构式为巯基乙酸/巯基乙酸酯的结构式为所述On-DNA产物的结构式为

其中，结构式中DNA包含由人工修饰的和/或未修饰的核苷酸单体聚合得到的单链或双链的核苷酸链，该核苷酸链通过一个或多个化学键或基团与Ar相连；

X选自氟；

所述Ar选自以下基团：R₁为氢、卤素、烷基、烷氧基中的任意一种或多种的随机组合，Ar上有一个或多个R₁基团，

所述烷基为C₁-C₁₂的直链或支链烷基或C₃-C₈环烷基；所述的烷氧基为C₁-C₁₂的直链或支链烷氧基；

所述的R选自氢或C₁-C₁₂的直链或支链烷基；

所述方法是：将On-DNA邻位卤素芳基甲腈化合物溶解到pH＝9.4的硼酸缓冲液中，向摩尔当量为1，摩尔浓度为0.1～5mM的On-DNA邻位卤素芳基甲腈化合物溶液中，依次加入20～1000倍摩尔当量的巯基乙酸/巯基乙酸酯、20～1000倍摩尔当量的碱，在10℃～100℃下反应0.5～24小时。

2.根据权利要求1所述的方法，其特征在于：所述碱选自硼酸钠、氢氧化锂、氢氧化钠、氢氧化钾、氢氧化铯、碳酸钠、碳酸钾、碳酸铯、磷酸钠、磷酸钾、磷酸氢钠、磷酸氢钾、N-甲基吗啉、三乙胺、二异丙基乙基胺、1,8-二氮杂二环十一碳-7-烯、4-二甲氨基吡啶、2,6-二甲基吡啶或N-甲基咪唑。

3.根据权利要求1所述的方法，其特征在于：所述反应在溶剂中进行，溶剂为水、甲醇、乙醇、乙腈、二甲亚砜、DMA、无机盐缓冲液、有机酸缓冲液、有机碱缓冲液中任意一种或几种的含水混合溶剂。

4.根据权利要求1所述的方法，其特征在于：所述反应的反应温度为20℃、30℃、40℃、50℃或60℃。

5.根据权利要求1所述的方法，其特征在于：所述反应的反应时间为0.5小时、1小时、2小时、3小时、4小时、6小时或8小时。

6.根据权利要求1所述的方法，其特征在于：所述方法中On-DNA邻位卤素芳基甲腈化合物的摩尔当量为1，巯基乙酸/巯基乙酸酯的摩尔当量为20当量、40当量、100当量、200当量、400当量、800当量、1000当量；碱的摩尔当量为20当量、40当量、100当量、200当量、400当量、800当量、1000当量。

7.根据权利要求1所述的方法，其特征在于：所述反应碱分两次加入：第一次加入1/3当量的碱后于30℃反应2小时，第二次加入2/3当量的碱后于60℃反应2小时。

8.根据权利要求1-7任一所述的方法，其特征在于，所述方法用于批量的多孔板操作。

9.根据权利要求1-7任一所述的方法，其特征在于，所述方法用于多孔板的DNA编码化合物库的合成。