[发明专利]一种鉴定番茄杂交种纯度的SNP位点、引物组及应用有效
申请号: | 202011133310.2 | 申请日: | 2020-10-21 |
公开(公告)号: | CN112195264B | 公开(公告)日: | 2021-06-01 |
发明(设计)人: | 温常龙;张建;杨静静;张晓飞;罗江;杨明珠 | 申请(专利权)人: | 北京市农林科学院 |
主分类号: | C12Q1/6895 | 分类号: | C12Q1/6895;C12Q1/6858;C12N15/11 |
代理公司: | 北京五洲洋和知识产权代理事务所(普通合伙) 11387 | 代理人: | 刘春成;荣红颖 |
地址: | 100097 *** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 鉴定 番茄 杂交种 纯度 snp 引物 应用 | ||
1.一种鉴定番茄杂交种纯度的SNP引物组合,所述SNP引物组合用于分别扩增如下由第一SNP位点到第八SNP位点组成的SNP位点组:
第一SNP位点,所述第一SNP位点位于番茄参考基因组第9染色体第146411位核苷酸,该位点的核苷酸碱基为C或T;
第二SNP位点,所述第二SNP位点位于番茄参考基因组第1染色体第348230位核苷酸,该位点的核苷酸碱基为A或G;
第三SNP位点,所述第三SNP位点位于番茄参考基因组第6染色体第45112865位核苷酸,该位点的核苷酸碱基为A或G;
第四SNP位点,所述第四SNP位点位于番茄参考基因组第11染色体第50349769位核苷酸,该位点的核苷酸碱基为C或T;
第五SNP位点,所述第五SNP位点位于番茄参考基因组第7染色体第2872268位核苷酸,该位点的核苷酸碱基为A或T;
第六SNP位点,所述第六SNP位点位于番茄参考基因组第2染色体第21501063位核苷酸,该位点的核苷酸碱基为A或C;
第七SNP位点,所述第七SNP位点位于番茄参考基因组第4染色体第2072712位核苷酸,该位点的核苷酸碱基为C或T;
第八SNP位点,所述第八SNP位点位于番茄参考基因组第10染色体第8449453位核苷酸,该位点的核苷酸碱基为C或T;
其中,所述番茄参考基因组为番茄Heinz1706参考基因组;
所述SNP引物组合包括:
第一SNP引物组,用于扩增所述第一SNP位点;第二SNP引物组,用于扩增所述第二SNP位点;第三SNP引物组,用于扩增所述第三SNP位点;第四SNP引物组,用于扩增所述第四SNP位点;第五SNP引物组,用于扩增所述第五SNP位点;第六SNP引物组,用于扩增所述第六SNP位点;第七SNP引物组,用于扩增所述第七SNP位点;第八SNP引物组,用于扩增所述第八SNP位点。
2.根据权利要求1所述SNP引物组合,其特征在于:
所述第一SNP位点及其上下游碱基的序列如序列表中的SEQ ID NO:25所示;
所述第二SNP位点及其上下游碱基的序列如序列表中的SEQ ID NO:26所示;
所述第三SNP位点及其上下游碱基的序列如序列表中的SEQ ID NO:27所示;
所述第四SNP位点及其上下游碱基的序列如序列表中的SEQ ID NO:28所示;
所述第五SNP位点及其上下游碱基的序列如序列表中的SEQ ID NO:29所示;
所述第六SNP位点及其上下游碱基的序列如序列表中的SEQ ID NO:30所示;
所述第七SNP位点及其上下游碱基的序列如序列表中的SEQ ID NO:31所示;
所述第八SNP位点及其上下游碱基的序列如序列表中的SEQ ID NO:32所示。
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