[发明专利]一种鉴定西瓜种质真实性的SNP位点引物组合及应用

说明书

本发明属于分子标记及其检测领域，具体涉及一种鉴定西瓜种质资源真实性的核心SNP位点、引物组合，基于SNP位点的DNA指纹数据库、数据库构建方法，以及基于SNP位点的西瓜种质真实性的鉴定方法、应用。所述SNP位点选自第一SNP位点到第三十二SNP位点中的任1到32种。本发明建立了基于高通量测序鉴定西瓜种质真实性的DNA指纹数据库。本发明提供的方法既可以对未知西瓜种质资源进行鉴定，也可以对已知西瓜种质资源的真实性进行鉴定。本发明提供的方法具有高通量、准确、低成本、操作简单、节约人力、物力等优点，具有十分广阔的应用前景。

技术领域

本发明属于分子标记及其检测领域，具体涉及一种鉴定西瓜种质真实性的核心SNP位点、引物组合，基于SNP位点的DNA指纹数据库、数据库构建方法，以及基于SNP位点的西瓜种质真实性的鉴定方法、应用。

背景技术

种质资源是种业的基础。《种子法》第九十二条指出，种质资源是指选育植物新品种的基础材料，包括各种植物的栽培种、野生种的繁殖材料以及利用上述繁殖材料人工创造的各种植物的遗传材料。种质资源由自然演化和人工创造而形成的一种重要的自然资源，积累了极其丰富的遗传变异，是人类用于选育新品种和发展农业生产的物质基础。种质资源的发现和利用决定了现代作物育种工作能否取得突破性进展的关键。所以，在鉴定真伪、优化来源方面，和具体的品种相比，种质资源的鉴定和保护工作更加重要。然而，目前绝大部分种质资源的鉴定和保护工作却处于空白状态。

西瓜隶属于葫芦科西瓜属，是西瓜属中唯一的栽培种。FAO(联合国粮食及农业组织)多年数据显示，我国一直是西瓜的第一生产和消费国家，其中2018年达到6280万吨。西瓜起源非洲，具有4000多年的驯化和人工选择历史。公元1100年前，西瓜被引入到中国，上个世纪50年代和90年代分别引入美洲类型和小型西瓜(红瓤和黄瓤小型西瓜)，形成了我国特色的西瓜种质资源库。西瓜种质资源具有某些稀有的、独特的性状，例如风味性状和抗病性状，故其是良种选育的基础。我国对西瓜种质资源收集不足，上个世纪过程中流失了很多西瓜种质。改革开发以后，更注重商业化资源，忽视了地方种的保护和利用。随着育种代数增加，西瓜遗传背景越来越狭窄，遗传冲刷风险增加。现有的西瓜种质资源库管理存在多方不足。其一，库中种质资源极其相似，增加了维护种质库成本。其二，田间鉴定困难，缺乏有效鉴定手段，种质库遗传背景模糊，资源挖掘和共享效率非常低。其三，西瓜种质资源盗用现象时有发生，造成了品种同种异名和同名异种现象发生，扰乱了西瓜市场的秩序。鉴于此，科研和实践中均急需开发一套适用于西瓜种质鉴定的SNP位点组合，建立西瓜种质资源鉴定的方法。

发明内容

本发明提供了一种鉴定西瓜种质的核心SNP位点、引物组合，以及基于SNP位点的DNA指纹数据库、数据库构建方法，基于SNP位点的西瓜种质的鉴定方法、应用。

本发明是通过以下的技术方案实现的：