[发明专利]一种病原微生物检测用测序文库的构建方法在审
申请号: | 202011138869.4 | 申请日: | 2020-10-22 |
公开(公告)号: | CN112011835A | 公开(公告)日: | 2020-12-01 |
发明(设计)人: | 曾志鹏;张鹏;邢宽;谢珍;何志健;何贵伦;安雪茹;张艳英 | 申请(专利权)人: | 南京实践医学检验有限公司 |
主分类号: | C40B50/06 | 分类号: | C40B50/06 |
代理公司: | 南京瑞华腾知识产权代理事务所(普通合伙) 32368 | 代理人: | 梁金娟 |
地址: | 210000 江苏省南京市江北新区*** | 国省代码: | 江苏;32 |
权利要求书: | 查看更多 | 说明书: | 查看更多 |
摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 病原微生物 检测 序文 构建 方法 | ||
1.一种病原微生物检测用测序文库的构建方法,其特征在于:按照先后顺序包括以下步骤:
S1,从样本中提取得到DNA和RNA,共投入到一链合成反应液和一链合成酶中,对RNA进行逆转录,使RNA形成RNA/cDNA复合双链,在RNA逆转录的条件为温度不超过65℃,其时间不超过15min;
S2,往步骤S1中加入二链合成反应液和二链合成酶,使RNA/cDNA复合双链形成双链cDNA;
S3,纯化上述步骤中的双链cDNA和双链DNA的混合物;
S4,在S3得到的纯化产物中加入DNA打断修复反应液和DNA打断修复酶混合物,对产物同时进行片段化、末端修复和加A尾;
S5,不纯化,向上述片段化的溶液中直接加入接头、接头反应液和连接酶进行接头连接,得接头连接产物;
S6,接着纯化接头连接产物;
S7,文库扩增:步骤S6所得产物中加入扩增酶混合液和引物,进行PCR扩增;
S8,纯化S7中的扩增产物即可以得到原始DNA/RNA可测序的文库。
2.根据权利要求1所述的一种病原微生物检测用测序文库的构建方法,其特征在于:所述步骤S1中的所述样本为鼻咽拭子、口腔拭子、痰液、肺泡灌洗液、胸腹水、脑脊液、血清、血浆、血液、尿液或粪便。
3.根据权利要求1所述的一种病原微生物检测用测序文库的构建方法,其特征在于:所述步骤S1中的所述一链合成反应液包括:Tris-HCl 20-70mM、KCl 50-100mM、MgCl2 1-10mM、DTT 5-20mM、dNTP 20-100μM、RNase Inhibitor 1-10U、Random Primer 0.5-5μM。
4.根据权利要求1所述的一种病原微生物检测用测序文库的构建方法,其特征在于:所述步骤S1中的所述一链合成酶为具有逆转录活性的酶。
5.根据权利要求1所述的一种病原微生物检测用测序文库的构建方法,其特征在于:所述步骤S2中的所述二链合成反应液包括:Tris-HCl 30-100mM、KCl 50-100mM、MgCl2 1-10mM、DTT 5-20mM、dNTP 20-100μM、dATP 20-100μM。
6.根据权利要求1所述的一种病原微生物检测用测序文库的构建方法,其特征在于:所述步骤S2中的所述二链合成酶包括:Klenow片段0.01-0.05 U/μL、RNase H 0.01-0.1U/μL。
7.根据权利要求1所述的一种病原微生物检测用测序文库的构建方法,其特征在于:所述步骤S3中所述双链cDNA和双链DNA的混合物为0.1-100ng。
8.根据权利要求1所述的一种病原微生物检测用测序文库的构建方法,其特征在于:所述步骤S4中所述DNA打断修复反应液包括:Tris-HCl 10-50mM、MgCl2 10-50mM、DTT 1-10mM、dNTP 20-100μM、dATP 0.2-1mM、NaCl 20-80mM、BSA 0.1-1 mg/ml、TritonX-1000.1%-0.5%。
该专利技术资料仅供研究查看技术是否侵权等信息,商用须获得专利权人授权。该专利全部权利属于南京实践医学检验有限公司,未经南京实践医学检验有限公司许可,擅自商用是侵权行为。如果您想购买此专利、获得商业授权和技术合作,请联系【客服】
本文链接:http://www.vipzhuanli.com/pat/books/202011138869.4/1.html,转载请声明来源钻瓜专利网。