[发明专利]一种病原微生物检测用测序文库的构建方法在审

专利信息
申请号: 202011138869.4 申请日: 2020-10-22
公开(公告)号: CN112011835A 公开(公告)日: 2020-12-01
发明(设计)人: 曾志鹏;张鹏;邢宽;谢珍;何志健;何贵伦;安雪茹;张艳英 申请(专利权)人: 南京实践医学检验有限公司
主分类号: C40B50/06 分类号: C40B50/06
代理公司: 南京瑞华腾知识产权代理事务所(普通合伙) 32368 代理人: 梁金娟
地址: 210000 江苏省南京市江北新区*** 国省代码: 江苏;32
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摘要:
搜索关键词: 一种 病原微生物 检测 序文 构建 方法
【权利要求书】:

1.一种病原微生物检测用测序文库的构建方法,其特征在于:按照先后顺序包括以下步骤:

S1,从样本中提取得到DNA和RNA,共投入到一链合成反应液和一链合成酶中,对RNA进行逆转录,使RNA形成RNA/cDNA复合双链,在RNA逆转录的条件为温度不超过65℃,其时间不超过15min;

S2,往步骤S1中加入二链合成反应液和二链合成酶,使RNA/cDNA复合双链形成双链cDNA;

S3,纯化上述步骤中的双链cDNA和双链DNA的混合物;

S4,在S3得到的纯化产物中加入DNA打断修复反应液和DNA打断修复酶混合物,对产物同时进行片段化、末端修复和加A尾;

S5,不纯化,向上述片段化的溶液中直接加入接头、接头反应液和连接酶进行接头连接,得接头连接产物;

S6,接着纯化接头连接产物;

S7,文库扩增:步骤S6所得产物中加入扩增酶混合液和引物,进行PCR扩增;

S8,纯化S7中的扩增产物即可以得到原始DNA/RNA可测序的文库。

2.根据权利要求1所述的一种病原微生物检测用测序文库的构建方法,其特征在于:所述步骤S1中的所述样本为鼻咽拭子、口腔拭子、痰液、肺泡灌洗液、胸腹水、脑脊液、血清、血浆、血液、尿液或粪便。

3.根据权利要求1所述的一种病原微生物检测用测序文库的构建方法,其特征在于:所述步骤S1中的所述一链合成反应液包括:Tris-HCl 20-70mM、KCl 50-100mM、MgCl2 1-10mM、DTT 5-20mM、dNTP 20-100μM、RNase Inhibitor 1-10U、Random Primer 0.5-5μM。

4.根据权利要求1所述的一种病原微生物检测用测序文库的构建方法,其特征在于:所述步骤S1中的所述一链合成酶为具有逆转录活性的酶。

5.根据权利要求1所述的一种病原微生物检测用测序文库的构建方法,其特征在于:所述步骤S2中的所述二链合成反应液包括:Tris-HCl 30-100mM、KCl 50-100mM、MgCl2 1-10mM、DTT 5-20mM、dNTP 20-100μM、dATP 20-100μM。

6.根据权利要求1所述的一种病原微生物检测用测序文库的构建方法,其特征在于:所述步骤S2中的所述二链合成酶包括:Klenow片段0.01-0.05 U/μL、RNase H 0.01-0.1U/μL。

7.根据权利要求1所述的一种病原微生物检测用测序文库的构建方法,其特征在于:所述步骤S3中所述双链cDNA和双链DNA的混合物为0.1-100ng。

8.根据权利要求1所述的一种病原微生物检测用测序文库的构建方法,其特征在于:所述步骤S4中所述DNA打断修复反应液包括:Tris-HCl 10-50mM、MgCl2 10-50mM、DTT 1-10mM、dNTP 20-100μM、dATP 0.2-1mM、NaCl 20-80mM、BSA 0.1-1 mg/ml、TritonX-1000.1%-0.5%。

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