[发明专利]一种指数扩增反应触发3-D双腿DNA步行器的microRNA生物传感器在审
申请号: | 202011152187.9 | 申请日: | 2020-10-22 |
公开(公告)号: | CN112251496A | 公开(公告)日: | 2021-01-22 |
发明(设计)人: | 谢国明;杨柳;方杰 | 申请(专利权)人: | 重庆医科大学 |
主分类号: | C12Q1/6825 | 分类号: | C12Q1/6825 |
代理公司: | 暂无信息 | 代理人: | 暂无信息 |
地址: | 400016*** | 国省代码: | 重庆;50 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 指数 扩增 反应 触发 双腿 dna 步行 microrna 生物 传感器 | ||
1.制备一种指数扩增反应触发3-D双腿DNA步行器的microRNA生物传感器,按以下步骤操作:
(1)、等温指数扩增反应(EXPAR)首先,将100nM模板,各种浓度的靶标microRNA,1μL 10×CutSmart缓冲液和1μL 10×NEBuffer 2混合,并在95℃水浴中加热5分钟,然后缓慢降低至室温。然后,将0.2U的KF聚合酶,1U的Ns.BsmAI,250μM dNTP和DEPC处理水添加到混合物中,使得最终体积为10μL。扩增反应在37℃下进行30分钟。最后,通过在80℃下20分钟的酶灭活处理终止反应体系。将该溶液储存在4℃下以备将来使用。
(2)、DNA步行器探针的制备将50μL链霉亲和素包被的微球用50μL结合缓冲液洗涤两次,方法是将微球以12000rpm离心3分钟,然后弃去上清液。用50μL结合缓冲液重悬后,将5μL 20μM生物素修饰的轨道链添加到微球中。将混合物在37℃下孵育20分钟。然后将上述溶液在12000rpm下离心3分钟,除去上清液后,将剩余溶液用50μL TE缓冲液洗涤3次。最后,将微球复合物悬浮于50μL TE缓冲液中。
(3)、microRNA的荧光测量对于典型的步行器操作,反应溶液在100μL反应体积中于37℃进行20分钟,包括10μL EXPAR产品,5μL制备的微球复合物,在1×CutSmart缓冲液中的10U Nb.BbvCI内切酶。将反应溶液在12000rpm下离心3分钟后,收集上清液以测量荧光信号。
2.如权利要求1所述的基于指数扩增反应触发的3-D双腿DNA步行器的生物传感器,其制备方法步骤(1)中所用KF聚合酶浓度是0.2U/10μL。
3.如权利要求1所述的基于指数扩增反应触发的3-D双腿DNA步行器的生物传感器,其制备方法步骤(1)中EXPAR反应时间为30分钟。
4.如权利要求1所述的基于指数扩增反应触发的3-D双腿DNA步行器的生物传感器,其制备方法步骤(2)中加入轨道连的量是5μL 20μM。
5.如权利要求1所述的基于指数扩增反应触发的3-D双腿DNA步行器的生物传感器,其制备方法步骤(2)中最后用50μL TE缓冲液洗涤3次并定容。
6.如权利要求1所述的基于指数扩增反应触发的3-D双腿DNA步行器的生物传感器,其制备方法步骤(3)中反应体积是100μL。
7.如权利要求1所述的基于指数扩增反应触发的3-D双腿DNA步行器的生物传感器,其制备方法步骤(3)中37℃进行20分钟酶促反应。
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