[发明专利]一种用马来氏网结合高通量测序调查昆虫多样性的方法有效
申请号: | 202011177924.0 | 申请日: | 2020-10-29 |
公开(公告)号: | CN112293381B | 公开(公告)日: | 2022-07-26 |
发明(设计)人: | 杨晓飞;曹权;胡安捷;莫育盆 | 申请(专利权)人: | 贵州大学 |
主分类号: | G16B30/00 | 分类号: | G16B30/00;A01M1/20;A01M1/10 |
代理公司: | 昆明合盛知识产权代理事务所(普通合伙) 53210 | 代理人: | 龙燕 |
地址: | 55002*** | 国省代码: | 贵州;52 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 马来 结合 通量 调查 昆虫 多样性 方法 | ||
1.一种用马来氏网结合高通量测序调查昆虫多样性的方法,其特征在于,具体包括以下步骤:
(1)针对实施地点面积布点,每个样点安放一个马来氏网;在马来氏网的收集瓶内装3/4的无水乙醇,14天收集一次昆虫;
(2)收集来的昆虫编写测序编号送去高通量测序;
(3)高通量测序数据处理:识别并剔除疑问序列,利用FLASH软件进行质量检验;使用UPARSE软件对序列配对连接及去除嵌合体,并按97%的序列相似度归并和划分OTU,将丰度值低于全体样本测序总量0.001%的OTU去除,以得到处理后的OTU序列;
(4)使用QIIME软件,对OTU丰度矩阵中每个样本的序列总数在不同深度下随机抽样,以每个深度下抽取到的序列数及其对应的OTU数绘制稀疏曲线图和各样本的丰度等级曲线图,以确定测序深度是否合理;
(5)在测序深度合理,可保证后续分析结果准确可靠的前提下,对各OTU所对应的序列进行NCBI Blast比对,从而对各OTU进行鉴定,即昆虫鉴定;后使用QIIME软件,分析各样本在门、纲、目、科、属五个分类水平上的组成和丰度分布情况,使用R软件绘制成图,以展示各分类水平上的昆虫组成;
(6)通过Alpha多样性分析、Beta多样性分析,得到不同马来氏网安放点昆虫种群间的结构差异和多样性,从而可进一步查阅文献分析害虫及其天敌的动态;
步骤(2)高通量测序PCR过程中,扩增基因选用线粒体DNAbarcoding片段;上游引物为mlCOIintF,上游引物序列:
GGWACWGGWTGAACWGTWTAYCCYCC;下游引物为HCO2198,下游引物序列:TAAACTTCAGGGTGACCAAAAAATCA;该基因片段能够实现对各昆虫物种的准确鉴定。
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