[发明专利]一种Ph-like急性淋巴细胞白血病融合基因及其应用和检测试剂盒

说明书

本发明提供一种Ph‑like急性淋巴细胞白血病融合基因及其应用和检测试剂盒，所述融合基因为TPR‑PDGFRB。本发明中首先发现、鉴定了急淋巴细胞白血病中存在新融合基因TPR‑PDGFRB，评估认为TPR‑PDGFRB可以作为急性淋巴细胞白血病的特异性分子标志物，进而开发了一款临床上可用于诊断、检测患者微小残留病(MRD)的试剂盒。试剂盒利用Taqman探针实时荧光PCR对白血病患者体内TPR‑PDGFRB融合基因进行绝对定量，其检测特异性好、灵敏度高、方法简便高效、成本低廉，能够满足临床上的诊疗需求。

技术领域

本发明涉及生物医学技术领域，尤其涉及一种Ph-like急性淋巴细胞白血病融合基因及其应用和检测试剂盒。

背景技术

Ph-like急性淋巴细胞白血病(Philadelphia chromosome-like AcuteLymphoblastic Leukemia)是近几年发现的一种急性淋巴细胞白血病(ALL)，在ALL中约占20％，患者生存期短，临床预后差。80％的Ph-like ALL患者存在融合基因的分子遗传学异常，因此，检测Ph-like ALL相关的融合基因对于病情诊断、治疗方案制定、疗效评价、预后评估及病变复发的监测具有重要的临床意义。

发明内容

本发明的第一个目的在于，提供一种Ph-like急性淋巴细胞白血病融合基因。

本发明的第二个目的在于，提供融合基因在制备Ph-like急性淋巴细胞白血病诊断或监测试剂盒中的应用。

本发明的第三个目的在于，提供一种检测Ph-like急性淋巴细胞白血病融合基因的试剂盒。

本发明第四个目的在于，提供一种非疾病诊断目的的检测TPR-PDGFRB融合基因的方法。

为了实现上述第一个目的，本发明提供了一种Ph-like急性淋巴细胞白血病融合基因，所述融合基因为TPR-PDGFRB。

作为一个优选方案，所述融合基因序列如SEQ ID NO.1所示。

为了实现上述第二个目的，本发明提供了融合基因在制备Ph-like急性淋巴细胞白血病诊断或监测试剂盒中的应用。部分Ph-like样的急性淋巴细胞白血病患者携带融合基因TPR-PDGFRB，其可以作为患者特异性的分子标志物，并应用于临床诊断、定期监测患者的微小残留病变。

为了实现上述第三个目的，本发明提供了一种检测Ph-like急性淋巴细胞白血病融合基因的试剂盒，所述试剂盒包括上游引物、下游引物、Taqman探针、内参、PCR反应缓冲液、阳性对照和阴性对照；

所述上游引物的核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示；

所述下游引物的核苷酸序列如SEQ ID NO.3所示；

所述Taqman探针的核苷酸序列如SEQ ID NO.4所示。

作为一个优选方案，所述Taqman探针的5’端标记有FAM基团，所述探针的3’端标记有BHQ基团。当待测样品中不存在目标DNA分子时FAM的荧光被BHQ淬灭，不发出荧光；当待测样品中存在目标DNA分子时，探针与目标DNA分子结合，随后靠Taq酶的5'→3’双链外切酶活性降解探针而释放荧光基团FAM，发出荧光。

作为一个优选方案，所述内参中包含内参上游引物，内参下游引物和内参探针；

所述内参上游引物的核苷酸序列如SEQ ID NO.5所示；

所述内参下游引物的核苷酸序列如SEQ ID NO.6所示；

所述内参探针的核苷酸序列如SEQ ID NO.7所示。