[发明专利]检测产志贺毒素大肠埃希氏菌的实时荧光RAA的引物、探针、试剂盒和检测方法在审
申请号: | 202011208262.9 | 申请日: | 2020-11-03 |
公开(公告)号: | CN112159855A | 公开(公告)日: | 2021-01-01 |
发明(设计)人: | 申进玲;蒋原;赵丽娜;杨捷琳;郭德华 | 申请(专利权)人: | 上海海关动植物与食品检验检疫技术中心 |
主分类号: | C12Q1/689 | 分类号: | C12Q1/689;C12Q1/6844;C12Q1/10;C12N15/11;C12R1/19 |
代理公司: | 上海伯瑞杰知识产权代理有限公司 31227 | 代理人: | 范艳静 |
地址: | 200135 上*** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 检测 产志贺 毒素 大肠 埃希氏菌 实时 荧光 raa 引物 探针 试剂盒 方法 | ||
1.一种检测产志贺毒素大肠埃希氏菌的实时荧光RAA的引物和探针,其特征在于,所述引物由stx1基因和stx2基因的引物组成,所述探针由stx1探针和stx2探针组成;
stx1基因的上游引物序列:TTATCGCTTTGCTGATTTTTCACATGTTACC;SEQ ID NO.1;
stx1基因的下游引物序列:AAATCCAGATAAGAAGTAGTCAACGAATGGCG;SEQ ID NO.2;
stx1基因探针的序列为:CTGGTGACAGTAGCTATACCACGTTACAGCGT(FAM)-THF-T(BHQ1)-TGCAGGGATCAGTCG(3’blocker);SEQ ID NO.3;
stx2基因的上游引物序列:TTTCCATGACAACGGACAGCAGTTATACCAC;SEQ ID NO.4;
stx2基因的下游引物序列:TCATTGTATTACCACTGAACTCCATTAACGC;SEQ ID NO.5;
stx2基因探针的序列为:CTGGAACGTTCCGGAATGCAAATCAGTCGT(FAM)-C-THF-C-T(BHQ1)-CACTGGTTTCATCA(3’blocker);SEQ ID NO.6。
2.根据权利要求1所述的引物和探针,其特征在于,stx1基因中上游引物为31bp,下游引物为32bp,探针为49bp,stx1基因探针共有4个修饰基团,分别为荧光基团、四氢呋喃、淬灭基团和C3-spacer,荧光基团为FAM,淬灭基团为BHQ1,FAM和BHQ1均在T位置修饰,FAM和BHQ1中间间隔1个碱基,被四氢呋喃替换,C3-sapacer位于3’端末尾。
3.根据权利要求1所述的引物和探针,其特征在于,stx2基因中上游引物为31bp,下游引物为31bp,探针为48bp,stx2基因探针共有4个修饰基团,分别为荧光基团、四氢呋喃、淬灭基团和C3-spacer,荧光基团为FAM,淬灭基团为BHQ1,FAM和BHQ1中间间隔3个碱基,中间一个碱基被四氢呋喃替换,C3-sapacer位于3’端末尾。
4.一种检测产志贺毒素大肠埃希氏菌的实时荧光RAA的试剂盒,其特征在于,包括权利要求1-3任一项所述的引物和探针。
5.根据权利要求4所述的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒还包括缓冲液和纯化水。
6.一种检测产志贺毒素大肠埃希氏菌的实时荧光RAA的方法,其特征在于,其包括如下步骤:
(1)、提取样品DNA;
(2)、以样品DNA为模板,利用试剂盒进行重组酶介导等温核酸扩增,并在扩增过程中进行实时荧光检测;
所述试剂盒为权利要求4所述的试剂盒。
7.根据权利要求6所述的方法,其特征在于,步骤(2)中,所述重组酶介导等温核酸扩增中stx1重组酶介导等温核酸扩增的反应体系为:缓冲液为25μL,上游引物为10μmol/L、2.1μL,下游引物为10μmol/L、2.1μL,探针为10μmol/L、0.6μL,纯化水为13.7μL,总体积为43.5μL;重组酶介导等温核酸扩增中stx2重组酶介导等温核酸扩增的反应体系为:缓冲液为25μL,上游引物为10μmol/L、2.1μL,下游引物为10μmol/L、2.1μL,探针为10μmol/L、0.6μL,纯化水为13.7μL,总体积为43.5μL。
8.根据权利要求6所述的方法,其特征在于,步骤(2)中,所述重组酶介导等温核酸扩增的反应条件为:39℃反应30min。
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