[发明专利]一种端粒相对长度检测试剂盒在审
申请号: | 202011223112.5 | 申请日: | 2020-11-05 |
公开(公告)号: | CN112322710A | 公开(公告)日: | 2021-02-05 |
发明(设计)人: | 孙国祝;肖君华;陈烨;路萌 | 申请(专利权)人: | 东华大学 |
主分类号: | C12Q1/686 | 分类号: | C12Q1/686;C12N15/11 |
代理公司: | 上海泰能知识产权代理事务所(普通合伙) 31233 | 代理人: | 魏峯;黄志达 |
地址: | 201620 上海市*** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 端粒 相对 长度 检测 试剂盒 | ||
本发明涉及一种端粒相对长度检测试剂盒。所述试剂盒包括:端粒基因引物序列,如SEQ ID NO.1‑2所示;内参基因引物序列,如SEQ ID NO.3‑4所示;探针序列,如SEQ ID NO.5所示;内参基因:多拷贝序列作为内参基因序列;标准品:永生化细胞系DNA。该试剂盒进行端粒长度检测效果稳定,原料廉价易得,实验操作简单、易行。
技术领域
本发明属于分子生物学和医学检测技术领域,特别涉及一种端粒相对长度检测试剂盒。
背景技术
端粒是真核染色体末端的特殊末端封端结构,由TTAGGG重复序列和多种蛋白(如庇护素和端粒酶)组成。端粒可确保染色体稳定性,并保护末端免于降解以及与其他染色体融合。由于DNA聚合酶不能将DNA复制到线性染色体的末端,它们起到防止DNA复制过程中重要遗传信息丢失的保护作用。
真核端粒通常以3'单链DNA突出端终止,这对于端粒的维持和加帽至关重要。该3'单链重复DNA回环并退火为双链,形成一个大的物理环结构,称为端粒环(T环)。T环可能提供一种掩盖端粒末端免受细胞活动的一般机制,而细胞活动可以作用于DNA末端并调节端粒的延长和缩短。在T环结构中,在与C链配对并置换G链的基础上,提出了3'突出端侵入双链端粒DNA,形成D环(置换环)。链侵入发生在距端粒物理末端一定距离的地方,因此导致大的T环结构。
目前,常用的端粒长度检测方法主要包括:端粒末端限制性片段分析(TRF)、荧光定量PCR(qPCR)、定量荧光原位杂交(Q-FISH)、流式荧光原位杂交(Flow-FISH)等。其中,TRF方法通过限制性内切酶消化基因组DNA而端粒片段不会被切割,消化产物通过Southernblotting方法检测端粒长度。虽然TRF分析被视为TL测量的“黄金标准”,可测量端粒涂片的强度,从而通常确定平均TL,可以在Southern印迹上成像各种端粒大小,但最短的端粒无法显示。Q-FISH与FLOW FISH均采用荧光标记探针(CCCTAA)3与细胞悬液杂交,通过检测端粒荧光信号进行端粒长度分析。其中,FLOW-FISH技术通过流式细胞仪进行端粒荧光信号分析,能精确获得每个细胞的平均端粒长度,敏感性、重复性较好。但是,由于探针杂交的限制,Q-FISH方法无法在端粒重复低于PNA探针杂交阈值的染色体末端的端粒上检测荧光信号(所谓的无端粒末端)。所有Q-FISH技术的另一个缺点是,该探针还可能与一些间质端粒序列(ITS)结合,该序列由脊椎动物中远离染色体末端的端粒重复序列组成,从而产生一定的假阳性结果。也有人担心某些非常明亮的Q-FISH信号可能代表非常接近的几个端粒的簇,并且不知道它们如何在定量分析中反映出来。
qPCR方法因具备DNA用量少,操作简单、仪器设备易得等优点,特别适用于端粒长度的检测分析。现有的qPCR方法通过设计引物,扩增端粒基因片段与内参基因片段,通过T/S比值来计算端粒相对长度。实验中,由于不同人员、或使用不同批次试剂进行操作,会造成检测结果的批间差异,很难做到对端粒长度的持续动态监测与准确对比分析。
发明内容
本发明所要解决的技术问题是提供一种端粒相对长度检测试剂盒,以克服现有技术中对端粒长度检测准确性不高等缺陷。
本发明提供一种端粒相对长度检测试剂盒,所述试剂盒包括:
端粒基因引物序列,如SEQ ID NO.1-2所示:
正向引物:GTTTGGGTTTGGGTTTGGGTTTGGGTTTGGGTT,
反向引物:GGCTTGCCTTACCCTTACCCTTACCCTTACCCTTACCCT;
内参基因引物序列,如SEQ ID NO.3-4所示,所述内参基因为YH-1:
正向引物:CGCACAGAGTAGTAAG-GAAAGTGAAGTAGGCCGGGC,
反向引物:GTGCTGGGATTACAGGCGTGAG;
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