[发明专利]一种靶向药阿帕替尼有效性的方法及试剂盒

权利要求书

1.一种靶向药阿帕替尼有效性的方法，其特征在于，步骤如下：

步骤1：准备靶向药阿帕替尼的药效样品；

步骤2：对步骤1的药效样品进行DNA分子标记，记录分子标记位点的信息；

步骤3：将DNA分子标记位点信息作为自变量，将靶向药阿帕替尼的药效信息作为因变量，建立多元线性回归数学模型；

步骤4：根据多元线性回归数学模型，计算靶向药阿帕替尼药效的有效变量的相关系数；

步骤5：步骤4获得有效变量的相关系数即为靶向药阿帕替尼药效相关的DNA分子标记的权重系数，根据权重系数确定靶向药阿帕替尼有效性。

2.根据权利要求1所述的靶向药阿帕替尼有效性的方法，其特征在于，步骤2中标记物及位点信息如下：

3.根据权利要求1所述的靶向药阿帕替尼有效性的方法，其特征在于：所述步骤2中，DNA分子标记为SNP标记。

4.根据权利要求3所述的靶向药阿帕替尼有效性的方法，其特征在于：所述步骤2中，候选SNP标记的个数为1×10⁵-9×10⁵个。

5.根据权利要求1所述的靶向药阿帕替尼有效性的方法，其特征在于：所述步骤3中，多元线性回归数学模型为Lasso和弹性网络正则化的广义线性模型。

6.根据权利要求1所述的靶向药阿帕替尼有效性的方法，其特征在于：所述FOLFOX方案药效样品的数量至少为50个，使用靶向药阿帕替尼无效的样品的数量至少为样本总数量的20％，有效的样品的数量至少为样本总数量的20％。

7.根据权利要求1所述的靶向药阿帕替尼有效性的方法，其特征在于，所述步骤5中DNA分子标记的权重系数获得方式如下：

(a)将已知FOLFOX药物药效样品定义为N_j，j为样品数量；

(b)将药效样品中候选的DNA分子标记定义为P_i的基因型，i为候选的DNA分子标记的数量；

(c)为N_j在DNA分子标记P_i处的表型赋值Ak，k＝1、2或3，表型为野生纯合型赋值A1，表型为杂合型赋值A2，表型为变异纯合型赋值A3；A1、A2和A3互不相同；建立P×N阶矩阵，定义为输入文件X；

(d)根据靶向药阿帕替尼的药效信息建立1×N阶矩阵,以定义为输入文件Y：

(e)以X作为自变量，以Y作为因变量，用基于Lasso和弹性网络正则化的广义线性模型的算法，计算出有效变量和有效变量的相关系数；有效变量的相关系数即为靶向药阿帕替尼相关的DNA分子标记的权重系数。

8.一种基于权利要求1所述的靶向药阿帕替尼有效性的方法的试剂盒，其特征在于：所述试剂盒包括用于靶向药阿帕替尼药效检测的相关的DNA分子标记的成套引物。