[发明专利]与大白菜基因共分离的根肿病分子标记syau3008、引物及应用

说明书

本发明属于生物技术领域，具体涉及一种与大白菜基因共分离的根肿病分子标记syau3008、引物及应用。所述syau3008的核苷酸序列为SEQ ID NO.1或者为SEQ ID NO.2。所述分子标记syau3008的变异稳定存在于植株中，避免了因为复杂性和特异性导致的后续分析模糊。特异引物syau3008‑F/R检测含有QS_B3.1抗病基因，无论该基因为纯合还是杂合都表现出抗病，为今后大白菜抗病育种提供了抗病基因辅助选择的分子标记。通过本发明的特异引物syau3008‑F/R可对待测植株进行苗期鉴定，检测成本低、准确性高，大大提高育种效率，缩短育种进程。

技术领域

本发明属于生物技术领域，具体涉及一种与大白菜基因共分离的根肿病分子标记syau3008、引物及应用。

背景技术

大白菜(Brassica rapa ssp.pekinesis)作为十字花科芸薹属重要的蔬菜作物之一，在我国甚至世界都占有十分重要的地位，种植面积大，营养价值极高。近年来，根肿病(Clubroot)在我国很多地区，例如东北地区、西南地区、长江中上游等地均有发现，并且面积有扩大的趋势。现在已成为我国十字花科芸薹属作物的主要病害之一，其中大白菜受到的危害最为严重。根肿病是由芸薹根肿菌(Plasmodiophora brassicae)侵染引起的一种传染性非常强的土传病害。根肿菌专性寄生在芸薹属、萝卜属以及拟南芥等十字花科活体植物的根部。一般认为根肿菌属于原生动物界、丝足虫门、植物寄生黏菌纲、根肿菌目、根肿菌科的一种有害菌。在世界各地每年因为根肿病的危害导致芸薹属作物减产多达10％-15％，发病严重时可导致作物绝收。

面对大白菜根肿病发病区域日益扩大的严峻形势，现有的生物防治、化学防治、农业防治措施虽然可以在一定程度上减轻根肿病的危害，但同时存在土壤、环境污染，生产成本高等诸多问题。仍不能从根本上解决大白菜栽培所面临的严重问题。抗病育种是防控根肿病危害最经济和有效的途径之一。分子标记由于与植物性状紧密连锁，所以常作为抗病育种的辅助手段。

自从1961年Thoday首次利用一对侧翼标记定位一个QTL以来，数量性状尤其是经济性状的QTL研究取得了巨大进展。然而QTL的初步定位在染色体上是一个比较宽的区间，精细定位就是在完成初定位的基础上，通过在QTL区域内加密标记并结合作图群体的表型差异分析，将目标QTL锁定在一个更小的区域。QTL精细定位需要大量的染色体片段的重组，可靠的表型测定以及高密度的分子标记。用于精细定位的群体可以是F₂、回交群体、重组自交系和近等基因系等群体。其中，近等基因系由于只在少数几个甚至一个区段存在彼此差异，而其他遗传背景完全相同。其基因组中只存在一个或几个QTL，可以消除其它背景干扰和消除微效QTL的影响，特别适合于进行QTL精细定位的群体。紧密连锁标记的开发直接影响到精细定位的效果。虽然大白菜抗根肿病育种取得了一定的进展，但于根肿菌的变异以及土壤中多个生理小种混生，导致抗病品种在种植3-5年后丧失抗性。根肿菌群体结构及致病力的分化给抗病育种带来了新的挑战。

因此，利用1个主效抗病基因(Clubroot resistance,CR)进行抗病育种已经面临严峻挑战，需要在以抗地区优势生理小种作为主要育种目标的同时聚合抗更多生理小种的抗病基因。从而借助分子标记辅助选择(marker-assisted selection，MAS)技术进行聚合抗病基育种。因此，目前迫切需要在挖掘和定位更多的抗根肿病基因基础上，开发精准的高通用性抗病基因连锁标记。

发明内容

为了解决上述技术问题，本发明提供了一种与大白菜基因共分离的根肿病分子标记syau3008、引物及应用。

本发明提供了一种与大白菜基因共分离的根肿病分子标记syau3008，所述syau3008的核苷酸序列为SEQ ID NO.1或者为SEQ ID NO.2，其中SEQ ID NO.1是与大白菜抗根肿病QS_B3.1基因共分离的分子标记，SEQ ID NO.2存在于感病个体中。