[发明专利]用于前列腺癌复发的预后的基因表达面板在审
申请号: | 202011258642.3 | 申请日: | 2015-01-16 |
公开(公告)号: | CN112322735A | 公开(公告)日: | 2021-02-05 |
发明(设计)人: | 玛丽安娜·卡拉·斯特恩;亚采克·平斯基;范建兵 | 申请(专利权)人: | 启迪公司;南加利福尼亚大学 |
主分类号: | C12Q1/6886 | 分类号: | C12Q1/6886 |
代理公司: | 北京连和连知识产权代理有限公司 11278 | 代理人: | 杨帆 |
地址: | 美国加利福*** | 国省代码: | 暂无信息 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 用于 前列腺癌 复发 预后 基因 表达 面板 | ||
1.一种用于预测个体中前列腺癌的进展的系统,所述系统包含:
装置,所述装置被配置为确定来自从所述个体采取的生物样品的核酸的表达水平;以及
硬件逻辑,所述硬件逻辑被设计或被配置为执行操作,所述操作包含:
(a)接收来自从所述个体采取的生物样品的标记基因的集合的表达水平,其中所述标记基因的集合包括CLEC4F、OAS2、PGC、UPK3B、PCBP3、EDARADD、GPR81、GLDC、RAPGEF1、DUOXA2、C2或f43、DUOX1、或NPR3;
(b)将所述表达水平应用到使所述标记基因的集合的表达水平与前列腺癌进展关联的预测模型;以及
(c)评估所述预测模型的输出以预测所述个体中前列腺癌的进展。
2.根据权利要求1所述的系统,其中所述标记基因的集合进一步包括从以下组成的组中选择的至少一个附加基因:NKX2-1、UPK1A、ADRA2C、ABCC11、MMP11、CPVL、ZYG11A、CLEC4F、OAS2、PGC、UPK3B、PCBP3、ABLIM1、EDARADD、GPR81、MYBPC1、F10、KCNA3、GLDC、KCNQ2、RAPGEF1、TUBB2B、MB、DUOXA1、C2或f43、DUOX1、PCA3和NPR3。
3.一种用于预测个体中前列腺癌的进展的系统,所述系统包含:
装置,所述装置被配置为确定来自从所述个体采取的生物样品的核酸的表达水平;以及
硬件逻辑,所述硬件逻辑被设计或被配置为执行操作,其中患者经受根治性前列腺切除术,所述操作包含:
(a)接收来自所述个体的标记基因的集合的表达水平,其中所述标记基因的集合包括CLEC4F、OAS2、PGC、UPK3B、PCBP3、EDARADD、GPR81、GLDC、RAPGEFl、DUOXA2、C2或f43、DUOX1、或NPR3;
(b)将所述表达水平应用到使所述标记基因的集合的表达水平与前列腺癌进展关联的预测模型;以及
(c)评估所述预测模型的输出以预测所述个体中前列腺癌的进展。
4.根据权利要求3所述的系统,其中所述标记基因的集合进一步包括从以下组成的组中选择的至少一个附加基因:NKX2-1、UPK1A、ADRA2C、ABCC11、MMP11、CPVL、ZYG11A、CLEC4F、OAS2、PGC、UPK3B、PCBP3、ABLIM1、EDARADD、GPR81、MYBPC1、F10、KCNA3、GLDC、KCNQ2、RAPGEF1、TUBB2B、MB、DUOXA1、C2或f43、DUOX1、PCA3和NPR3。
5.一种用于预测个体中前列腺癌的进展的系统,所述系统包含:
装置,所述装置被配置为确定来自从所述个体采取的生物样品的核酸的表达水平,其中所述生物样品包含前列腺组织样品;以及
硬件逻辑,所述硬件逻辑被设计或被配置为执行操作,所述操作包含:
(a)接收来自所述个体的标记基因的集合的表达水平,其中所述标记基因的集合包括:CLEC4F、OAS2、PGC、UPK3B、PCBP3、EDARADD、GPR81、GLDC、RAPGEF1、DUOXA2、C2或f43、DUOX1、或NPR3;
(b)将所述表达水平应用到使所述标记基因的集合的表达水平与前列腺癌进展关联的预测模型;以及
(c)评估所述预测模型的输出以预测所述个体中前列腺癌的进展。
6.根据权利要求5所述的系统,其中所述标记基因的集合进一步包括从以下组成的组中选择的至少一个附加基因:UPK1A、ADRA2C、MMP11、CPVL、ZYG11A、CLEC4F、OAS2、PGC、UPK3B、PCBP3、ABLIM1、EDARADD、GPR81、MYBPC1、F10、KCNA3、GLDC、KCNQ2、RAPGEF1、TUBB2B、MB、DUOXA1、C2或f43、DUOX1、PCA3和NPR3。
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