[发明专利]一种乳腺癌易感基因筛查panel及其检测方法在审

专利信息
申请号: 202011260080.6 申请日: 2020-11-12
公开(公告)号: CN112391471A 公开(公告)日: 2021-02-23
发明(设计)人: 彭国荣 申请(专利权)人: 深圳蓝图基因科技有限公司
主分类号: C12Q1/6886 分类号: C12Q1/6886;C12Q1/6806
代理公司: 深圳市兴科达知识产权代理有限公司 44260 代理人: 张德兴
地址: 518116 广东省深圳市龙岗区龙城*** 国省代码: 广东;44
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摘要:
搜索关键词: 一种 乳腺癌 基因 panel 及其 检测 方法
【权利要求书】:

1.一种乳腺癌易感基因筛查panel,其特征在于,所述乳腺癌易感基因筛查panel上设置有用于捕获目标DNA的探针,所述探针分别由以下引物制成:

(1)LOC101928460-LOC101929406:

TGTAGTAAACGTTATGTGAATGTGGTC;

(2)TRIM46:GCTGCCAGGGGACATAGCTCTC;

(3)MUC1:TCATACTCACAGCATTCTTCTCAGT;

(4)NR5A2:TACAGCCTGGACTGATCCTTGTAT;

(5)ETAA1:GCCATTATTTCCAAAAAGAGCCTGT;

(6)HAGLROS:TGCCCTACAAATACCATATCCGTC;

(7)LINC01117-HNRNPA3:CAACTTCGGATCACACAGTGAATC;

(8)DIRC3:AAAAGACCAGGAACTTCACAACTG;

(9)DIRC3:CAGCAGGACAACAGAACTGTGG;

(10)MECOM:CTGTTCACCCACTCAAAATTGATGA。

2.一种采用如权利要求1所述的乳腺癌易感基因筛查panel的检测方法,其特征在于,包括以下步骤:

准备基因库;

使用上述的基因panel捕获靶向DNA;

扩增靶向DNA文库;

测序并进行突变检测,分析乳腺癌基因突变情况。

3.根据权利要求2所述的乳腺癌易感基因筛查panel的检测方法,其特征在于,所述突变检测是通过对比靶向DNA序列与乳腺癌参考基因组序列来进行的,上述乳腺癌基因突变是指与乳腺癌对比参考基因组序列相比,靶向DNA序列发生了核苷酸变化,上述核苷酸变化包括核苷酸变异、核苷酸插入和缺失、拷贝数变异、基因融合、微卫星不稳定性、肿瘤突变负荷以及人类白细胞抗原分型。

4.根据权利要求2所述的乳腺癌易感基因筛查panel的检测方法,其特征在于,上述基因panel捕获靶向DNA的具体条件为:在65℃条件下与基因panel的探针杂交4-16小时,使用磁珠对捕获的靶向DNA进行分离,然后纯化;使用PCR方法扩增靶向DNA文库并进行纯化。

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