[发明专利]一种乳腺癌易感基因筛查panel及其检测方法在审
申请号: | 202011260080.6 | 申请日: | 2020-11-12 |
公开(公告)号: | CN112391471A | 公开(公告)日: | 2021-02-23 |
发明(设计)人: | 彭国荣 | 申请(专利权)人: | 深圳蓝图基因科技有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6886 | 分类号: | C12Q1/6886;C12Q1/6806 |
代理公司: | 深圳市兴科达知识产权代理有限公司 44260 | 代理人: | 张德兴 |
地址: | 518116 广东省深圳市龙岗区龙城*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 乳腺癌 基因 panel 及其 检测 方法 | ||
1.一种乳腺癌易感基因筛查panel,其特征在于,所述乳腺癌易感基因筛查panel上设置有用于捕获目标DNA的探针,所述探针分别由以下引物制成:
(1)LOC101928460-LOC101929406:
TGTAGTAAACGTTATGTGAATGTGGTC;
(2)TRIM46:GCTGCCAGGGGACATAGCTCTC;
(3)MUC1:TCATACTCACAGCATTCTTCTCAGT;
(4)NR5A2:TACAGCCTGGACTGATCCTTGTAT;
(5)ETAA1:GCCATTATTTCCAAAAAGAGCCTGT;
(6)HAGLROS:TGCCCTACAAATACCATATCCGTC;
(7)LINC01117-HNRNPA3:CAACTTCGGATCACACAGTGAATC;
(8)DIRC3:AAAAGACCAGGAACTTCACAACTG;
(9)DIRC3:CAGCAGGACAACAGAACTGTGG;
(10)MECOM:CTGTTCACCCACTCAAAATTGATGA。
2.一种采用如权利要求1所述的乳腺癌易感基因筛查panel的检测方法,其特征在于,包括以下步骤:
准备基因库;
使用上述的基因panel捕获靶向DNA;
扩增靶向DNA文库;
测序并进行突变检测,分析乳腺癌基因突变情况。
3.根据权利要求2所述的乳腺癌易感基因筛查panel的检测方法,其特征在于,所述突变检测是通过对比靶向DNA序列与乳腺癌参考基因组序列来进行的,上述乳腺癌基因突变是指与乳腺癌对比参考基因组序列相比,靶向DNA序列发生了核苷酸变化,上述核苷酸变化包括核苷酸变异、核苷酸插入和缺失、拷贝数变异、基因融合、微卫星不稳定性、肿瘤突变负荷以及人类白细胞抗原分型。
4.根据权利要求2所述的乳腺癌易感基因筛查panel的检测方法,其特征在于,上述基因panel捕获靶向DNA的具体条件为:在65℃条件下与基因panel的探针杂交4-16小时,使用磁珠对捕获的靶向DNA进行分离,然后纯化;使用PCR方法扩增靶向DNA文库并进行纯化。
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