[发明专利]一种基于TP0136蛋白异质性建立的密螺旋体属分子分型方法在审

专利信息
申请号: 202011289213.2 申请日: 2020-11-17
公开(公告)号: CN112342285A 公开(公告)日: 2021-02-09
发明(设计)人: 柯吴坚;魏然;塔依尔·吐尔洪 申请(专利权)人: 柯吴坚
主分类号: C12Q1/6869 分类号: C12Q1/6869;C12Q1/689;C12Q1/04;C12R1/01
代理公司: 上海思牛达专利代理事务所(特殊普通合伙) 31355 代理人: 丁剑
地址: 510009 *** 国省代码: 广东;44
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摘要:
搜索关键词: 一种 基于 tp0136 蛋白 异质性 建立 螺旋体 分子 方法
【权利要求书】:

1.一种基于TP0136蛋白异质性建立的密螺旋体属分子分型方法,其特征在于,所述方法利用密螺旋体属TP0136蛋白异质性建立。

2.根据权利要求1所述的一种基于TP0136蛋白异质性建立的密螺旋体属分子分型方法,其特征在于,具体步骤为:

取待分型密螺旋体属菌株,培养,分离螺旋体;

取所述分离螺旋体扩增其TP0136 DNA序列,测序;

(3)将所述测序结果与密螺旋体属分型的序列进行比对,即成;

所述密螺旋体属分型的序列为SEQ ID NO.1-10任一所示的氨基酸序列。

3.根据权利要求2所述的一种基于TP0136蛋白异质性建立的密螺旋体属分子分型方法,其特征在于,所述的密螺旋体属包括9株梅毒苍白密螺旋体、3株不引起人类性病的雅司苍白密螺旋体、1株未分类的类人猿密螺旋体、1株地方密螺旋体和广东省内23株梅毒苍白密螺旋体临床分离株。

4.根据权利要求2所述的一种基于TP0136蛋白异质性建立的密螺旋体属分子分型方法,其特征在于,步骤(1)中所述的密螺旋体属菌株培养中所用到的1 X细胞裂解缓冲液中包含10 mM Tris,0.1 M EDTA,0.5%SDS;2X细胞裂解缓冲液中包含20mM Tris-HCl, 0.2MEDTA, 1% SDS。

5.根据权利要求2所述的一种基于TP0136蛋白异质性建立的密螺旋体属分子分型方法,其特征在于,步骤(2)中所述扩增时所用到的引物对序列如SEQ ID NO:11和12所示或SEQ ID NO:13和14所示的核苷酸序列。

6.根据权利要求2所述的一种基于TP0136蛋白异质性建立的密螺旋体属分子分型方法,其特征在于,步骤(2)中所述扩增的反应体系为:每50μL PCR扩增反应试剂含5μL 待检测DNA样本、200μM dNTPs、5μL 10 ×Go Taq PCR缓冲液、1.5 mM MgCl2、0.6μM TP0136引物、0.5 U热启动Taq PCR聚合酶。

7.根据权利要求2所述的一种基于TP0136蛋白异质性建立的密螺旋体属分子分型方法,其特征在于,步骤(2)中所述扩增的条件为:95℃变性10 min;95℃1 min、60℃2 min、72℃1 min,共45个循环;最后72℃延伸10 min。

8.根据权利要求2所述的一种基于TP0136蛋白异质性建立的密螺旋体属分子分型方法,其特征在于,步骤(2)中所述测序采用双向DNA测序法。

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