[发明专利]一种基于TP0136蛋白异质性建立的密螺旋体属分子分型方法在审
申请号: | 202011289213.2 | 申请日: | 2020-11-17 |
公开(公告)号: | CN112342285A | 公开(公告)日: | 2021-02-09 |
发明(设计)人: | 柯吴坚;魏然;塔依尔·吐尔洪 | 申请(专利权)人: | 柯吴坚 |
主分类号: | C12Q1/6869 | 分类号: | C12Q1/6869;C12Q1/689;C12Q1/04;C12R1/01 |
代理公司: | 上海思牛达专利代理事务所(特殊普通合伙) 31355 | 代理人: | 丁剑 |
地址: | 510009 *** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 基于 tp0136 蛋白 异质性 建立 螺旋体 分子 方法 | ||
1.一种基于TP0136蛋白异质性建立的密螺旋体属分子分型方法,其特征在于,所述方法利用密螺旋体属TP0136蛋白异质性建立。
2.根据权利要求1所述的一种基于TP0136蛋白异质性建立的密螺旋体属分子分型方法,其特征在于,具体步骤为:
取待分型密螺旋体属菌株,培养,分离螺旋体;
取所述分离螺旋体扩增其TP0136 DNA序列,测序;
(3)将所述测序结果与密螺旋体属分型的序列进行比对,即成;
所述密螺旋体属分型的序列为SEQ ID NO.1-10任一所示的氨基酸序列。
3.根据权利要求2所述的一种基于TP0136蛋白异质性建立的密螺旋体属分子分型方法,其特征在于,所述的密螺旋体属包括9株梅毒苍白密螺旋体、3株不引起人类性病的雅司苍白密螺旋体、1株未分类的类人猿密螺旋体、1株地方密螺旋体和广东省内23株梅毒苍白密螺旋体临床分离株。
4.根据权利要求2所述的一种基于TP0136蛋白异质性建立的密螺旋体属分子分型方法,其特征在于,步骤(1)中所述的密螺旋体属菌株培养中所用到的1 X细胞裂解缓冲液中包含10 mM Tris,0.1 M EDTA,0.5%SDS;2X细胞裂解缓冲液中包含20mM Tris-HCl, 0.2MEDTA, 1% SDS。
5.根据权利要求2所述的一种基于TP0136蛋白异质性建立的密螺旋体属分子分型方法,其特征在于,步骤(2)中所述扩增时所用到的引物对序列如SEQ ID NO:11和12所示或SEQ ID NO:13和14所示的核苷酸序列。
6.根据权利要求2所述的一种基于TP0136蛋白异质性建立的密螺旋体属分子分型方法,其特征在于,步骤(2)中所述扩增的反应体系为:每50μL PCR扩增反应试剂含5μL 待检测DNA样本、200μM dNTPs、5μL 10 ×Go Taq PCR缓冲液、1.5 mM MgCl2、0.6μM TP0136引物、0.5 U热启动Taq PCR聚合酶。
7.根据权利要求2所述的一种基于TP0136蛋白异质性建立的密螺旋体属分子分型方法,其特征在于,步骤(2)中所述扩增的条件为:95℃变性10 min;95℃1 min、60℃2 min、72℃1 min,共45个循环;最后72℃延伸10 min。
8.根据权利要求2所述的一种基于TP0136蛋白异质性建立的密螺旋体属分子分型方法,其特征在于,步骤(2)中所述测序采用双向DNA测序法。
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