[发明专利]一种qPCR试剂盒及应用在审
申请号: | 202011306910.4 | 申请日: | 2020-11-20 |
公开(公告)号: | CN112195250A | 公开(公告)日: | 2021-01-08 |
发明(设计)人: | 徐忠法;甄亚男;杨美家;尹鸿萍;张志杰;缪应花;廖诗颖 | 申请(专利权)人: | 山东省医学科学院附属医院;江苏艾洛特生物科技有限公司;江苏艾洛特医药研究院有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6886 | 分类号: | C12Q1/6886;C12Q1/686;C12N15/11 |
代理公司: | 北京德崇智捷知识产权代理有限公司 11467 | 代理人: | 王斌 |
地址: | 250031 山*** | 国省代码: | 山东;37 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 qpcr 试剂盒 应用 | ||
1.一种qPCR试剂盒,其特征在于含有
针对CKDN-1内参基因的Forward Primer 1:GAAAGCTGACTGCCCCTATTTG,
Reverse primer 1:GAGAGGAAGTGCTGGGAACAAT;
TaqMan Probe 1序列为:5’-VIC-CTCCCCAGTCTCTTT-NFQ-MGB-3’;
针对CAR基因的上下游引物序列分别为:
Forward Primer 2:CGACATCTATATCTGGGCTC,
Reverse primer 2:AAGGGTTGCTTGAAGATG;
TaqMan Probe 2序列为:5’-VIC-AGTCCTCCTGCTGAGCCTGG-NFQ-MGB-3’。
2.根据权利要求1所述的qPCR试剂盒,其特征在于:试剂盒还有2×qPCR TaqMan ProbeMaster Mix、50×High or Low Rox、pCAR重组质粒和pCDKN-1重组质粒。
3.一种可定量检测接受CAR-T疗法病人血液中的CAR基因拷贝数的qPCR方法,其特征在于:包含以下步骤:
(1)选定人体细胞基因组中稳定表达的一单拷贝基因CKDN-1作为内参基因,根据内参基因及已知CAR基因的相应序列,设计特异性引物及探针引物,同时设计并合成分别包含CAR基因和CKDN-1基因片段序列的pCAR重组质粒和pCDKN-1重组质粒;
(2)制备qPCR反应液;
(3)以待测样本核酸、pCAR重组质粒和pCDKN-1重组质粒为模板,进行qPCR反应;
(4)采集荧光信号进行结果分析及定量计算,得出检测血样中的CAR基因拷贝数及占样本中总有核细胞的比值;
其中步骤(1)中引物,探针的序列如下:
针对CKDN-1内参基因的Forward Primer 1:GAAAGCTGACTGCCCCTATTTG,
Reverse primer 1:GAGAGGAAGTGCTGGGAACAAT;
TaqMan Probe 1序列为:5’-VIC-CTCCCCAGTCTCTTT-NFQ-MGB-3’;
针对CAR基因的上下游引物序列分别为:
Forward Primer 2:CGACATCTATATCTGGGCTC,
Reverse primer 2:AAGGGTTGCTTGAAGATG;
TaqMan Probe 2序列为:5’-VIC-AGTCCTCCTGCTGAGCCTGG-NFQ-MGB-3’。
4.根据权利要求2所述的方法,其特征在于步骤(2)所述的qPCR反应液的组成为2×qPCR TaqMan Probe Master Mix 5μL;10μmol/L的Forward Primer 1或2 0.2μL;10μmol/L的Reverse primer 1或2 0.2μL;10μmol/L的TaqMan Probe 1或2 0.1μL;50×High or LowRox 0.2μL;RNase-free Water加至9μL。
5.根据权利要求2所述的方法,其特征在于步骤(3)中待测样本核酸及两种重组质粒作为模板加入量均为1μL,qPCR反应条件为:预变性95℃ 1分钟,变性95℃ 10s,退火60℃30s,40个循环。
6.根据权利要求2所述的方法,其特征在于步骤(3)中两种重组质粒模板各根据梯度稀释的方法用水稀释得到100ng/μL--10-6ng/μL八个浓度梯度的质粒溶液。
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