[发明专利]与葡萄酯类香气物质含量相关的SNP分子标记及其应用有效
申请号: | 202011324942.7 | 申请日: | 2020-11-23 |
公开(公告)号: | CN112301148B | 公开(公告)日: | 2022-05-20 |
发明(设计)人: | 冀晓昊;王海波;刘凤之;刘培培;王宝亮;王志强;王孝娣;史祥宾;王小龙;王莹莹;张艺灿;李鹏;刘畅;杨兴旺 | 申请(专利权)人: | 中国农业科学院果树研究所 |
主分类号: | C12Q1/6895 | 分类号: | C12Q1/6895;C12N15/11 |
代理公司: | 北京路浩知识产权代理有限公司 11002 | 代理人: | 商秀玲 |
地址: | 125100 辽宁*** | 国省代码: | 辽宁;21 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 葡萄 香气 物质 含量 相关 snp 分子 标记 及其 应用 | ||
1.与葡萄酯类香气物质含量相关的SNP分子标记,其特征在于,所述SNP分子标记位于葡萄醇酰基转移酶编码基因编码区,为SEQ ID NO.1所示序列,所述SNP分子标记为葡萄醇酰基转移酶编码基因第1848位、1879位、1959位、1989位和2005位的多态性分别为T或A/C/G、A/G或T/C、T或A/C/G、G或A/C/T以及G或A/C/T的核苷酸序列。
2.根据权利要求1所述的SNP分子标记,其特征在于,所述SNP分子标记还含有葡萄醇酰基转移酶编码基因第1935位多态性为G或A/T/C的核苷酸序列。
3.根据权利要求1或2所述的SNP分子标记,其特征在于,所述SNP分子标记的多态性位点基因型为AA或Aa,对应于高酯类香气物质含量,所述SNP分子标记的基因型为aa,对应于低酯类香气物质含量;
其中,A基因型对应于第1848位、1879位、1935位、1959位、1989位和2005位核苷酸序列分别为T、A/G、G、T、G和G;
a基因型对应于第1848位、1879位、1935位、1959位、1989位和2005位核苷酸序列分别为A/C/G、T/C、A/T/C、A/C/G、A/C/T、A/C/T。
4.用于检测权利要求1-3任一项所述的SNP分子标记的引物或探针在鉴定葡萄酯类香气物质含量性状中的应用。
5.用于扩增权利要求1-3任一项所述的SNP分子标记的引物,其特征在于,所述引物为如SEQ ID NO.5-6所示的引物。
6.含有权利要求5所述的引物的试剂或试剂盒。
7.权利要求1-3任一项所述的SNP分子标记或权利要求5所述的引物或权利要求6所述的试剂或试剂盒在鉴定葡萄酯类香气物质含量性状中的应用。
8.权利要求1-3任一项所述的SNP分子标记或权利要求5所述的引物或权利要求6所述的试剂或试剂盒在葡萄酯类香气物质含量性状早期筛选中的应用。
9.权利要求1-3任一项所述的SNP分子标记或权利要求5所述的引物或权利要求6所述的试剂或试剂盒在葡萄酯类香气物质含量性状分子标记辅助育种中的应用。
10.一种鉴定葡萄酯类香气物质含量性状的方法,其特征在于,包括如下步骤:
(1)提取待测葡萄的DNA;
(2)以所述待测葡萄的DNA为模板,利用权利要求5所述的引物进行PCR扩增;
(3)分析PCR扩增产物中权利要求1-3任一项所述的SNP分子标记的基因型,根据基因型判断待测葡萄的葡萄酯类香气物质含量性状;
若所述SNP分子标记的基因型为AA或Aa,则待测葡萄具有高酯类香气物质含量;若所述SNP分子标记的基因型为aa,则待测葡萄具有低酯类香气物质含量;
其中,A基因型对应于SEQ ID NO.1所示序列的第1848位、1879位、1935位、1959位、1989位和2005位的核苷酸序列分别为T、A/G、G、T、G和G;
a基因型对应于SEQ ID NO.1所示序列的第1848位、1879位、1935位、1959位、1989位和2005位的核苷酸序列分别为A/C/G、T/C、A/T/C、A/C/G、A/C/T、A/C/T。
11.根据权利要求10所述的方法,其特征在于,所述SNP分子标记的基因型的分析采用Miniseq高通量测序方法。
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