[发明专利]与葡萄酯类香气物质含量相关的SNP分子标记及其应用

说明书

本发明涉及分子标记辅助育种技术领域，具体涉及与葡萄酯类香气物质含量相关的SNP分子标记及其应用。该SNP分子标记位于葡萄醇酰基转移酶编码基因的编码区，以SEQ ID NO.1所示序列为参考序列，该SNP分子标记含有葡萄醇酰基转移酶编码基因第1848位、1879位、1935位、1959位、1989位和2005位的多态性分别为T或A/C/G、A/G或T/C、G或A/T/C、T或A/C/G、G或A/C/T以及G或A/C/T的核苷酸序列。该SNP分子标记与葡萄酯类香气物质含量紧密关联，可用于鉴定葡萄酯类香气物质含量高低，重复性好、准确性高且适用性广，可实现酯类香气物质含量性状的苗期早期鉴定和选择。

技术领域

本发明涉及分子标记辅助育种技术领域，具体涉及与葡萄酯类香气物质含量相关的SNP分子标记及其应用。

背景技术

葡萄作为重要的经济作物，被广泛种植和培育。香气是葡萄果实品质的重要内容，是影响果品质量和消费者选购倾向的重要因素之一，因此，培育香气浓郁的葡萄品种是近年来葡萄育种的重要方向。酯类是葡萄重要的香气物质类型之一，如乙酸乙酯、乙酸丁酯、甲酸己酯等，它们具有香甜的果香味，并且易于挥发，是葡萄草莓香型的重要物质基础。具有高含量酯类香气物质的葡萄香气浓郁，代表品种为‘巨峰’，深受消费者的喜爱。

目前，具有高含量酯类香气物质的葡萄新品种的选育是通过人工授粉在杂交后代中选择成熟果实酯类香气浓郁的优株，但葡萄具有多年生、童期长的特点，从种子萌发到开花坐果最短需要三年，并且大量的杂交苗需要较大的土地和管理成本。分子标记是与目标性状紧密关联的DNA片段。利用分子标记可实现在种子萌芽后的当年进行性状的早期预测和筛选，保留具有目标性状的杂交苗，淘汰不具有目标性状的杂交苗。分子标记辅助育种可减少育种成本，还可加快育种进程。

葡萄香气物质对应的代谢物种类众多，已经发现的酯类香气物质至少24种，并且是受内因和外因共同作用的结果。内因主要是基因型差异；外因较为复杂，包括土壤、光照、温度、水分、营养状况、生长势和负载量等等，内因和外因相互作用，导致香气性状年际间存在较大差异，这为数量性状关联分析(QTL)和全基因组关联分析(GWAS)等正向遗传学方法开发分子标记造成了极大的障碍，表现为不同群体定位结果不同，同一群体不同年际间定位结果不同，例如：对邻苯二甲酸二甲酯和邻苯二甲酸二丁酯进行QTL定位，年际间的结果完全不同(朱骏驰，2019，草莓香型葡萄香气物质QTL精细定位及相关基因的筛选，沈阳农业大学博士学位论文)，这样的分子标记准确度堪忧，难以应用于生产。因此，开发准确、高效、适用性广的葡萄酯类香气物质含量性状的分子标记，对葡萄品种选育具有重要意义。

发明内容

本发明的目的是提供一种与葡萄酯类香气物质含量相关的SNP分子标记，本发明的另一目的是提供一种高通量、高准确性和品种适用性广的检测该分子标记的引物和方法。

具体地，本发明提供如下技术方案：

本发明首先提供一种与葡萄酯类香气物质含量相关的SNP分子标记，所述SNP分子标记位于葡萄醇酰基转移酶编码基因编码区，以SEQ ID NO.1所示序列为参考序列，所述SNP分子标记含有葡萄醇酰基转移酶编码基因第1848位、1879位、1959位、1989位和2005位的多态性分别为T或A/C/G、A/G或T/C、T或A/C/G、G或A/C/T以及G或A/C/T的核苷酸序列。

本发明通过实验验证，采用含有上述5个SNP位点的分子标记能够实现葡萄酯类香气物质含量高低性状的鉴定。

优选地，所述SNP分子标记还含有葡萄醇酰基转移酶编码基因第1935位多态性为G或A/T/C的核苷酸序列。采用含有上述6个SNP位点的分子标记能够更准确地实现葡萄酯类香气物质含量高低的性状的鉴定。

本发明中，高酯类香气物质含量具体为采用固相微萃取气相质谱法对成熟期果实进行测定，以3-壬酮为内标物，酯类香气总含量≥200ng/g FW，能被人的嗅觉感知，否则为低酯类香气物质含量。