[发明专利]一种基于孔板的高通量蛋白质样品预处理方法在审

专利信息
申请号: 202011329343.4 申请日: 2020-11-24
公开(公告)号: CN114539345A 公开(公告)日: 2022-05-27
发明(设计)人: 张丽华;随志刚;江波;吴玉洁;杨开广;戴忠鹏;张玉奎 申请(专利权)人: 中国科学院大连化学物理研究所
主分类号: C07K1/107 分类号: C07K1/107;C07K1/113;C07K1/14;C12P21/06
代理公司: 沈阳科苑专利商标代理有限公司 21002 代理人: 马驰
地址: 116023 辽宁省*** 国省代码: 辽宁;21
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摘要:
搜索关键词: 一种 基于 通量 蛋白质 样品 预处理 方法
【权利要求书】:

1.一种基于孔板的高通量蛋白质样品预处理方法,其特征在于:所述孔板包括:顺序使用的预处理孔板Ⅰ和预处理孔板Ⅱ;具体步骤如下:

1)生物样品首先加入预处理孔板Ⅰ中,进行蛋白质提取,变性和还原处理;

2)然后再将样品溶液转移到预处理孔板Ⅱ中进行烷基化捕获蛋白质、除盐以及酶解处理;

所述预处理孔板Ⅱ是先以多巴胺对孔板的孔内壁进行氨基(NH2)修饰,再通过共价键合方式依次修饰上树枝状亲水性化合物聚乙烯亚胺(PEI)和碘乙酸-N-琥珀酰胺酯,制备成固相烷基化试剂修饰的孔板。

2.按照权利要求1所述的方法,其特征在于:

所述预处理孔板Ⅰ为低吸附的孔板;

酶解产生的肽段可以进行质谱检测。

3.按照权利要求1所述的方法,其特征在于:

所述孔板为具有6个以上样品处理孔的孔板,优选具有24-384个样品处理孔的孔板。

4.按照权利要求1或2所述的方法,其特征在于:

预处理孔板Ⅰ采用96孔板,所述预处理孔板Ⅰ为Corning.7007或芯硅谷D3820-07-5EA;

生物样品于预处理孔板Ⅰ中处理后,从预处理孔板Ⅰ的每个样品孔中吸取蛋白质样品加入预处理孔板Ⅱ中相对应的孔中;

预处理孔板Ⅱ采用96孔板,所述预处理孔板Ⅱ为普通平底96孔板。

5.按照权利要求1、3或4所述的方法,其特征在于:采用多巴胺对普通孔板内壁进行氨基修饰时,仅需配置多巴胺溶液,将多巴胺溶液加到孔板内,反应1-12小时;其中,多巴胺的浓度5-50mg/mL;所用溶剂为5-50mM的Tris-HCl溶液或磷酸缓冲溶液度,pH值为6-9;加入体积为50-200微升;反应温度为15-50摄氏度。

6.按照权利要求1、3或4所述的的方法,其特征在于:通过共价键合的方式,先通过戊二醛将PEI修饰于孔板的内壁,再加入碘乙酸-N-琥珀酰胺酯,实现固相烷基化试剂修饰;

反应过程为:

A.加入戊二醛溶液,反应1-12小时;其中,戊二醛的浓度1-20%(V/V);

B.加入PEI溶液,反应反应1-12小时;其中,PEI的终浓度范围为1-100mg/mL;所用溶剂为5-50mM的Tris-HCl溶液或磷酸缓冲溶液度,pH值为6-9;加入体积为50-200微升;反应温度为15-50摄氏度;

C.加入碘乙酸-N-琥珀酰胺酯溶液,避光反应1-8小时;其中,碘乙酸-N-琥珀酰胺酯的浓度为0.1-5mg/mL;所用溶剂为甲醇和缓冲溶液混合体系,所用缓冲溶剂为5-50mM的Tris-HCl溶液或磷酸缓冲溶液度,pH值为6-9;甲醇与缓冲溶液体积比为1/1-9/1;反应温度为15-50摄氏度。

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