[发明专利]一种基于孔板的高通量蛋白质样品预处理方法在审
申请号: | 202011329343.4 | 申请日: | 2020-11-24 |
公开(公告)号: | CN114539345A | 公开(公告)日: | 2022-05-27 |
发明(设计)人: | 张丽华;随志刚;江波;吴玉洁;杨开广;戴忠鹏;张玉奎 | 申请(专利权)人: | 中国科学院大连化学物理研究所 |
主分类号: | C07K1/107 | 分类号: | C07K1/107;C07K1/113;C07K1/14;C12P21/06 |
代理公司: | 沈阳科苑专利商标代理有限公司 21002 | 代理人: | 马驰 |
地址: | 116023 辽宁省*** | 国省代码: | 辽宁;21 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 基于 通量 蛋白质 样品 预处理 方法 | ||
1.一种基于孔板的高通量蛋白质样品预处理方法,其特征在于:所述孔板包括:顺序使用的预处理孔板Ⅰ和预处理孔板Ⅱ;具体步骤如下:
1)生物样品首先加入预处理孔板Ⅰ中,进行蛋白质提取,变性和还原处理;
2)然后再将样品溶液转移到预处理孔板Ⅱ中进行烷基化捕获蛋白质、除盐以及酶解处理;
所述预处理孔板Ⅱ是先以多巴胺对孔板的孔内壁进行氨基(NH2)修饰,再通过共价键合方式依次修饰上树枝状亲水性化合物聚乙烯亚胺(PEI)和碘乙酸-N-琥珀酰胺酯,制备成固相烷基化试剂修饰的孔板。
2.按照权利要求1所述的方法,其特征在于:
所述预处理孔板Ⅰ为低吸附的孔板;
酶解产生的肽段可以进行质谱检测。
3.按照权利要求1所述的方法,其特征在于:
所述孔板为具有6个以上样品处理孔的孔板,优选具有24-384个样品处理孔的孔板。
4.按照权利要求1或2所述的方法,其特征在于:
预处理孔板Ⅰ采用96孔板,所述预处理孔板Ⅰ为Corning.7007或芯硅谷D3820-07-5EA;
生物样品于预处理孔板Ⅰ中处理后,从预处理孔板Ⅰ的每个样品孔中吸取蛋白质样品加入预处理孔板Ⅱ中相对应的孔中;
预处理孔板Ⅱ采用96孔板,所述预处理孔板Ⅱ为普通平底96孔板。
5.按照权利要求1、3或4所述的方法,其特征在于:采用多巴胺对普通孔板内壁进行氨基修饰时,仅需配置多巴胺溶液,将多巴胺溶液加到孔板内,反应1-12小时;其中,多巴胺的浓度5-50mg/mL;所用溶剂为5-50mM的Tris-HCl溶液或磷酸缓冲溶液度,pH值为6-9;加入体积为50-200微升;反应温度为15-50摄氏度。
6.按照权利要求1、3或4所述的的方法,其特征在于:通过共价键合的方式,先通过戊二醛将PEI修饰于孔板的内壁,再加入碘乙酸-N-琥珀酰胺酯,实现固相烷基化试剂修饰;
反应过程为:
A.加入戊二醛溶液,反应1-12小时;其中,戊二醛的浓度1-20%(V/V);
B.加入PEI溶液,反应反应1-12小时;其中,PEI的终浓度范围为1-100mg/mL;所用溶剂为5-50mM的Tris-HCl溶液或磷酸缓冲溶液度,pH值为6-9;加入体积为50-200微升;反应温度为15-50摄氏度;
C.加入碘乙酸-N-琥珀酰胺酯溶液,避光反应1-8小时;其中,碘乙酸-N-琥珀酰胺酯的浓度为0.1-5mg/mL;所用溶剂为甲醇和缓冲溶液混合体系,所用缓冲溶剂为5-50mM的Tris-HCl溶液或磷酸缓冲溶液度,pH值为6-9;甲醇与缓冲溶液体积比为1/1-9/1;反应温度为15-50摄氏度。
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