[发明专利]一种检测大口黑鲈双RNA病毒巢式PCR试剂盒及方法有效
申请号: | 202011339253.3 | 申请日: | 2020-11-25 |
公开(公告)号: | CN112322789B | 公开(公告)日: | 2023-04-18 |
发明(设计)人: | 付小哲;李宁求;罗明菊;林强;刘礼辉;牛银杰;罗霞;梁红茹 | 申请(专利权)人: | 中国水产科学研究院珠江水产研究所 |
主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/6848;C12N15/11;C12R1/93 |
代理公司: | 广州三环专利商标代理有限公司 44202 | 代理人: | 颜希文 |
地址: | 510380 广东*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 检测 大口 黑鲈双 rna 病毒 pcr 试剂盒 方法 | ||
本发明涉及双RNA病毒检测技术领域,尤其涉及一种检测大口黑鲈双RNA病毒巢式PCR试剂盒及方法。本发明的试剂盒包括两对巢式PCR引物,所述两对巢式PCR引物的序列如下:F1:5’‑CAGAAGGACCGATTCAACTCACT‑3’;R1:5’‑CTCTGGTGAGGAGGTAGTAGGCAA‑3’;F2:5’‑CCTGTCGTGCGGGCTCCTATT‑3’;R2:5’‑CTCTTTGTGGCGTTGGCTTCG‑3’。本发明针对LBBV,以其VP1基因保守序列为靶标,建立巢式PCR检测方法,为该病毒病的早期预警及有效防控提供快速灵敏的检测手段。
技术领域
本发明涉及双RNA病毒检测技术领域,尤其涉及一种检测大口黑鲈双RNA病毒巢式PCR试剂盒及方法。
背景技术
大口黑鲈(Micropterus salmoides),隶属于太阳鱼科(Centrarchidae)、黑鲈属(Micropterus)。肉质鲜美细嫩,无肌间刺,营养丰富,是一种优质淡水鱼类。发明人从发病的大口黑鲈组织中分离得到一株新型的双RNA病毒,主要临床症状为肠道充满黄色黏液、肝脏出血、有腹水;病毒无囊膜,具有二十面体结构;基因组由双节段双链RNA构成,A节段分别编码VP2、VP4、VP3四种蛋白,B节段编码VP1蛋白;基因同源性分析显示,该病毒与双RNA病毒科(Birnaviridae)的黑鱼斑点病毒属(Blosnavirus)病毒同源性较高,暂命名为大口黑鲈双RNA病毒(Largemouth bass birnavirus,LBBV)。
自19世纪以来,水产动物双RNA病毒病频繁暴发,其代表种传染性胰脏坏死病(infectious pancreatic necrosis virus,IPNV)已在我国山西、甘肃、辽宁、四川等地流行,患病稚鱼死亡率高达95%,给我国水产养殖业带来巨大损害。徐晔、Rodriguez Saint-Jean等人就曾针对水生动物双RNA病毒建立了qRT-PCR检测方法。而本发明对象为一株未知的水生动物双RNA病毒,目前为止,尚未有关于此种病毒的检测方法发表。
发明内容
本发明的目的在于克服现有技术的不足,提供一种检测大口黑鲈双RNA病毒巢式PCR试剂盒及方法。本发明针对LBBV,以其VP1基因保守序列为靶标,建立巢式PCR检测方法,为该病毒病的早期预警及有效防控提供快速灵敏的检测手段。
为实现上述目的,本发明采取的技术方案为:提供一种检测大口黑鲈双RNA病毒巢式PCR试剂盒,所述试剂盒包括两对巢式PCR引物,所述两对巢式PCR引物的序列如下:
F1:5’-CAGAAGGACCGATTCAACTCACT-3’;
R1:5’-CTCTGGTGAGGAGGTAGTAGGCAA-3’;
F2:5’-CCTGTCGTGCGGGCTCCTATT-3’;
R2:5’-CTCTTTGTGGCGTTGGCTTCG-3’。
作为本发明所述试剂盒的优选实施方式,所述试剂盒还包括dNTP、PCR buffer、Taq酶、Mg2+溶液和ddH2O。
作为本发明所述试剂盒的优选实施方式,所述引物F1/R1和F2/R2的添加量分别为4pmol。
当引物F1/R1和F2/R2的添加量分别为4pmol时,扩增产物条带最亮且无引物二聚体,当引物量大于4pmol时,引物二聚体随着引物量的增加而增加,且目的条带亮度减弱,因此最佳引物添加量为4pmol。
本发明还提供所述试剂盒检测大口黑鲈双RNA病毒的方法,包括以下步骤:
(1)取待测样品提取RNA;
(2)将RNA反转录得到cDNA;
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