[发明专利]一组用于华东木犀物种的特异性叶绿体基因变异位点鉴定的DNA探针及其鉴定方法有效
申请号: | 202011397715.7 | 申请日: | 2020-12-04 |
公开(公告)号: | CN112391491B | 公开(公告)日: | 2023-05-30 |
发明(设计)人: | 汪小飞;段一凡;王贤荣;李涌福;张敏;赵昌恒;陈林;朱福远;陈沫先 | 申请(专利权)人: | 南京林业大学 |
主分类号: | C12Q1/6895 | 分类号: | C12Q1/6895;C12Q1/6827;C12Q1/6809;C12N15/11 |
代理公司: | 苏州思睿晶华知识产权代理事务所(普通合伙) 32403 | 代理人: | 阮俊敏 |
地址: | 210037 江*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一组 用于 华东 木犀 物种 特异性 叶绿体 基因 变异 鉴定 dna 探针 及其 方法 | ||
本发明涉及分子生物学领域,具体涉及12个华东木犀物种的特异性叶绿体基因变异位点,利用本发明提供的用于特异性叶绿体基因变异位点鉴定的DNA探针,可以将华东木犀和其他木犀属物种区分开,从叶绿体基因组水平上挖掘华东木犀的特异性叶绿体基因变异位点,将为华东木犀的起源和进化提供新的分子证据,以期为华东木犀的barcode研究提供可靠信息。
技术领域
本发明涉及分子生物学领域,具体涉及一组用于华东木犀物种的特异性叶绿体基因变异位点鉴定的DNA探针及其鉴定方法。
背景技术
华东木犀(Osmanthu cooperi Hemsl.)属木犀属(Osmanthus Lour.)于木犀科(Oleaceae),又称宁波木犀。其叶全缘,花冠白色,清新淡雅,花冠管与裂片几乎等长,果实蓝黑色,是优良的园林观赏植物。
随着对华东木犀的研究逐渐深入,快速且准确地鉴定华东木犀物种是亟需解决的一大难题。目前,判断一个物种是否为华东木犀的方法多是通过树势、叶片形态和着生方式、节间、花形态等传统手段,易受环境因素和人为因素影响。且华东木犀的某些形态特征与木犀属其他种类似,传统方法难以准确鉴别。
以特异性叶绿体基因变异位点为分子标记的鉴定方法可以直接检测出不同物种在DNA水平上的差异,不受生长阶段、环境和人为因素的影响,具有较高的特异性和准确性,能快速准确鉴定传统手段难以鉴定的物种。目前,还未有基于特异性叶绿体基因变异位点的快速鉴定华东木犀物种的分子标记。
发明内容
发明目的:针对现有技术中存在的不足,本发明的目的是提供一组用于华东木犀物种的特异性叶绿体基因变异位点鉴定的DNA探针,针对12个能鉴定出华东木犀物种的特异性叶绿体基因变异位点,进行分子水平的鉴定,克服以往形态学鉴定上存在的不足,提供准确可靠、简单快捷且灵敏度高的分子标记,对华东木犀的barcode研究以及华东木犀的起源和进化研究都具有重要意义。
本发明包括以下技术方案:
一组用于华东木犀物种的特异性叶绿体基因变异位点鉴定的DNA探针,所述DNA探针能够与华东木犀叶绿体基因组(GenBank: MK841488.1)完整序列中的下述特异性叶绿体基因变异位点的一个或者多个结合,所述特异性叶绿体基因变异位点按照其在基因组上的序号分别为2200、15674、22633、23897、34024、37716、44994-45005、50543、110945-110952、115953-115960、129106、132560-132567。
进一步的,上述一组用于华东木犀物种的特异性叶绿体基因变异位点鉴定的DNA探针,所述DNA探针选自SEQ ID NO.1- SEQ ID NO.12中的一种或者多种。
其中:
SEQ ID NO.1= CAGAATAGTGGAAATCACATTTTTATTTTGTT
SEQ ID NO.2= AAATCAACTGAAATGTAGAATAGTTTCT
SEQ ID NO.3= CACAAATACCTCGACGATTCCCGCTC
SEQ ID NO.4= TGAAAGTTTCCTTTCATCCGGCT
SEQ ID NO.5= TATTTCCGATTAAATCTTCTT
SEQ ID NO.6= GAAAGACAATTTTTATTTTATT
SEQ ID NO.7= TTTTAAACTGAAATTTGGATTCAATTTG
SEQ ID NO.8= GGGTAGAGTTTTTTAAATAAAGTAT
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