[发明专利]利用特异性SNPs和/或INDELs位点鉴定白耳黄鸡的方法在审
申请号: | 202011408303.9 | 申请日: | 2020-12-04 |
公开(公告)号: | CN112680528A | 公开(公告)日: | 2021-04-20 |
发明(设计)人: | 王克华;郭军;韩威;李国辉;曲亮;胡玉萍 | 申请(专利权)人: | 江苏省家禽科学研究所;雪亿科技(成都)有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6888 | 分类号: | C12Q1/6888;C12N15/11 |
代理公司: | 成都东恒知盛知识产权代理事务所(特殊普通合伙) 51304 | 代理人: | 何健雄;廖祥文 |
地址: | 225125 江*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 利用 特异性 snps indels 鉴定 白耳黄鸡 方法 | ||
1.一种白耳黄鸡的鉴定方法,其特征在于,利用特异性SNPs和/或INDELs位点进行鉴定;所述特异性SNPs位点包括以下任意一个或几个:
BE_tag2位于鸡1号染色体190447715处,基因CCDC90B第2内含子,白耳黄鸡基因型为TT;
BE_tag4位于鸡3号染色体31115624处,基因ABCC10第2内含子,白耳黄鸡基因型为GG;
BE_tag5位于鸡5号染色体58105433处,基因NIN第29外显子,白耳黄鸡基因型为TT;
BE_tag6位于鸡6号染色体24835856处,基因SH3PXD2A第3内含子,白耳黄鸡基因型为GG;
BE_tag7位于鸡7号染色体31856227处,基因LRP1B第1内含子,白耳黄鸡基因型为TT;
BE_tag9位于鸡12号染色体1737573处,基因PRKCD的UTR5区域,白耳黄鸡基因型为GG;
BE_tag10位于鸡14号染色体6552214处,基因TBL3第21内含子,白耳黄鸡基因型为GG;
BE_tag11位于鸡18号染色体2826699处,基因HS3ST3B1与基因METRNL之间,白耳黄鸡基因型为CC;
BE_tag12位于鸡19号染色体6892943处,基因LOC101749175第2内含子,白耳黄鸡基因型为TT;
BE_tag13位于鸡23号染色体5353166处,基因LOC112530206的UTR5区域,白耳黄鸡基因型为CC;
BE_tag14位于鸡24号染色体5226317处,基因SIDT2的UTR5区域,白耳黄鸡基因型为CC;
BE_tag15位于鸡Z染色体70634838处,基因CORO2A与基因LOC101748661之间,白耳黄鸡基因型为AA。
2.根据权利要求1所述的鉴定方法,其特征在于,所述特异性INDELs位点包括以下任意一个或几个:
BE_tag1位于鸡1号染色体66034245处,基因SOX5第9内含子,白耳黄鸡基因型为TT/TT,突变基因型为缺失TT;
BE_tag3位于鸡2号染色体16154066处,基因APBB1IP第1内含子,白耳黄鸡基因型为插入TCAGG//TCAGG,插入片段TCAGG;
BE_tag8位于鸡10号染色体4305866处,基因TBC1D2B第11内含子,白耳黄鸡基因型为--(缺失片段DNA片段为TGTT)。
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