[发明专利]一种鉴定萝卜花色控制基因InDel标记及应用有效
申请号: | 202011409376.X | 申请日: | 2020-12-04 |
公开(公告)号: | CN113151529B | 公开(公告)日: | 2022-03-01 |
发明(设计)人: | 严承欢;邱正明;黄燕;崔磊;邓晓辉;矫振彪;刘志雄;张振兴;朱凤娟 | 申请(专利权)人: | 湖北省农业科学院经济作物研究所 |
主分类号: | C12Q1/6895 | 分类号: | C12Q1/6895;C12N15/11 |
代理公司: | 武汉蓝宝石专利代理事务所(特殊普通合伙) 42242 | 代理人: | 高兰 |
地址: | 430000 *** | 国省代码: | 湖北;42 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 鉴定 萝卜 花色 控制 基因 indel 标记 应用 | ||
1.一种序列如SEQ ID NO .1所示的插入/缺失片段在选育或鉴别萝卜花色中的应用。
2.一种InDel分子标记引物在制备用于鉴定萝卜花色的试剂盒中的应用,其特征在于,所述InDel分子标记引物正向引物序列如SEQ ID NO .4所示,反向引物包括第一反向引物及第二反向引物,所述第一反向引物的序列如SEQ ID NO .5所示,所述第二反向引物序列如SEQ ID NO .6所示。
3.一种鉴定萝卜花色的方法,其特征在于,方法包括:
以萝卜基因组DNA为模板,采用权利要求2的InDel分子标记引物扩增,检测萝卜组织基因型中序列如SEQ ID NO .1的基因片段是插入还是缺失,判断萝卜花色呈白色还是呈紫色;
如萝卜组织基因的基因型为插入所述基因片段的纯合子,则萝卜花色呈白色;
如萝卜组织基因的基因型为缺失所述基因片段的纯合子,则萝卜花色呈紫色;
如萝卜植株组织基因的基因型为同时含有所述基因片段插入等位基因与缺失等位基因的杂合子,则萝卜花色呈紫色。
4.根据权利要求3所述的鉴定萝卜花色的方法,其特征在于,控制所述萝卜花色的基因为
5.根据权利要求3所述的鉴定萝卜花色的方法,其特征在于,所述鉴定萝卜花色基因型的方法还包括萝卜基因组DNA的提取,将萝卜叶磨碎后加入提取液提取。
6.根据权利要求3所述的鉴定萝卜花色的方法,其特征在于,扩增条件为95℃预变性3min;95℃变性20s,60℃退火20s,72℃延伸30s,进行40个循环;72℃延伸10min,10℃10min。
7.根据权利要求3所述的鉴定萝卜花色的方法,其特征在于,若只检测到328 bp的条带,表明样品的基因型为所述基因片段插入的纯合子;
若只检测到500 bp的条带,表明样品的基因型为缺失所述基因片段的纯合子;
若同时检测到500 bp和328 bp的条带,表明样品的基因型为同时含有所述基因片段插入等位基因与缺失等位基因的杂合子。
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