[发明专利]一组检测琅琊鸡特异性遗传位点的引物组合及应用

权利要求书

1.用于琅琊鸡种鉴定的特异性遗传位点，其特征在于，包括以下所述特异性SNP位点：

LY_tag1位于鸡1号染色体53098095处，SYN3基因第6内含子，琅琊鸡基因型为AA；

LY_tag2位于鸡3号染色体11635744处，基因ETAA1与C1D之间，琅琊鸡基因型为TT；

LY_tag3位于鸡3号染色体67313160处，FOXO3基因第1内含子，琅琊鸡基因型为TT；

LY_tag4位于鸡3号染色体13563842处，基因BTBD3与LOC112532057之间，琅琊鸡基因型为TT；

LY_tag5位于鸡3染色体44507742处，PACRG基因第2内含子，琅琊鸡基因型为AA；

LY_tag6位于鸡3号染色体100351417处，基因KCNS3与RDH14之间，琅琊鸡基因型为AA；

LY_tag7位于鸡6号染色体24111197处，MFSD13A基因第1内含子，琅琊鸡基因型为TT；

LY_tag9位于鸡10号染色体11960575处，ADAMTSL3基因第2内含子，琅琊鸡基因型为CC；

LY_tag10位于鸡12染色体17101957处，PDZRN3基因第3内含子，琅琊鸡基因型为AA；

LY_tag11位于鸡19号染色体4290530处，ORAI3基因第3内含子，琅琊鸡基因型为TT；

LY_tag12位于鸡22号染色体3694766处，SNRNP200基因第29内含子，琅琊鸡基因型为CC。

2.根据权利要求1所述特异性遗传位点，其特征在于，还包括以下特异性INDEL位点：

LY_tag8位于鸡7号染色体1801362-1801368处，基因LOC112532789与ZNF804A之间，琅琊鸡基因型为--缺失GCAGAGA。

3.检测权利要求1或2所述特异性遗传位点的引物，其特征在于，用于检测所述标记LY_tag1的引物为LY_P1f和LY_P1r所示两条单链DNA：

LY_P1f：ACCTATCCTCTTCTCTATTAGC；

LY_P1r：TCTTCCATATCCAGTGTGAG；

用于检测所述标记LY_tag2的引物为LY_P2f和LY_P2r所示两条单链DNA：

LY_P2f：AGAGATGACAGACCTAATGG；

LY_P2r：AAGATTAAGAGCCTGAATGC；

用于检测所述标记LY_tag3的引物为LY_P3f和LY_P3r所示两条单链DNA：

LY_P3f：AGCACCATCCTCAGAACT；

LY_P3r：GGACTGTGTAGAACCAATAGA；

用于检测所述标记LY_tag4的引物为LY_P4f和LY_P4r所示两条单链DNA：

LY_P4f：TGGCAGTGACAACATACAT；

LY_P4r：CTCCTGAAGTCCTGAATCC；

用于检测所述标记LY_tag5的引物为LY_P5f和LY_P5r所示两条单链DNA：

LY_P5f：CAGGAACACAGCATAAGGA；

LY_P5r：GCTTGCGTTGATAGAGATG；

用于检测所述标记LY_tag6的引物为LY_P6f和LY_P6r所示两条单链DNA：

LY_P6f：GTCCAACTATCCATCCATCA；

LY_P6r：CAGTCAGATATTCTCATCAGTC；

用于检测所述标记LY_tag7的引物为LY_P7f和LY_P7r所示两条单链DNA：

LY_P7f：TCAAGTGCCATTCGGATG；

LY_P7r：ATCGGTGCCAGGATAAGT；

用于检测所述标记LY_tag8的引物为LY_P8f和LY_P8r所示两条单链DNA：

LY_P8f：CAGTAGCAGCCAGTGAAG；

LY_P8r：GTAATATCCTAGATGTGCCTCT；

用于检测所述标记LY_tag9的引物为LY_P9f和LY_P9r所示两条单链DNA：

LY_P9f：CGTCCAGCAGTAACTTGT；

LY_P9r：AGCAGAAGAGCAGAATCATA；

用于检测所述标记LY_tag10的引物为LY_P10f和LY_P10r所示两条单链DNA：

LY_P10f：GTCTGTCGCTGCTGATAC；

LY_P10r：CCTTAGTATTGTATGTGCTGAG；

用于检测所述标记LY_tag11的引物为LY_P11f和LY_P11r所示两条单链DNA：

LY_P11f：AGGAATTGAGGTCTGAATGC；

LY_P11r：GTGGAACTGGCTGGAATC；

用于检测所述标记LY_tag12的引物为LY_P12f和LY_P12r所示两条单链DNA：

LY_P12f：GAAGCAAGCAGTTGACATC；

LY_P12r：GAGCCTCTACCAGGACAA。