[发明专利]一种检测miRNA的方法及一种用于检测miRNA的生物探针在审
申请号: | 202011428912.0 | 申请日: | 2020-12-09 |
公开(公告)号: | CN112538521A | 公开(公告)日: | 2021-03-23 |
发明(设计)人: | 王乾龙;罗培;青琳森;刘兰聪;杨艺;陈肖依;周华 | 申请(专利权)人: | 澳门科技大学 |
主分类号: | C12Q1/682 | 分类号: | C12Q1/682;C12Q1/6886;C12N15/11 |
代理公司: | 成都华风专利事务所(普通合伙) 51223 | 代理人: | 杜朗宇 |
地址: | 中国澳门氹*** | 国省代码: | 澳门;82 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 检测 mirna 方法 用于 生物 探针 | ||
1.一种检测miRNA的方法,其特征在于:包括如下步骤:
(1)制备PEG修饰的AuNPs,得AuNPs-PEG;
(2)根据待测miRNA的序列合成与之序列完全配对的DNA片段,所述DNA片段5’端连接有亲和素,3’端依次连接含有3-10个碱基序列及linker、-SH,形成目标miRNA的DNA探针,linker含有至少一个亚甲基;
(3)将上述步骤中的DNA探针与AuNPs-PEG反应,得PEG-AuNPs-DNA probe;
(4)将含有或不含有目标miRNA的样本、DSNbuffer、DSN、RNase抑制剂、PEG-AuNPs-DNAprobe进行反应;
(5)终止反应,向反应系统中加入链霉亲和素包被的磁性颗粒,进行磁分离,收集磁分离后的溶液,定量检测AuNPs的含量。
2.如权利要求1所述的方法,其特征在于:步骤(1)中,AuNPs采用柠檬酸钠还原法制备;AuNPs-PEG的制备方法为:硅基材料经羟基活化、氨基化之后,与AuNPs溶液反应,去除未结合的AuNPs,与HS-PEG-COOH溶液反应,去除多余的HS-PEG-COOH,超声洗涤,即得AuNPs-PEG。
3.如权利要求1所述的方法,其特征在于:步骤(2)中,3’端连接5个相同的碱基序列,linker为3~6个亚甲基。
4.如权利要求1所述的方法,其特征在于:步骤(4)中,针对以下反应体系:总反应体积100μL:10nM PEG-AuNPs-DNA,1xDSN buffer,4U RNAase抑制剂,10pM目标miRNA,0.4U DSN,反应体系的温度为45~55℃,DSN浓度为0.4~0.5U,反应时间为80~100min,链霉亲和素磁珠体积为10~20μL。
5.如权利要求1所述的方法,其特征在于:步骤(5)中,采用ICP-MS方法检测。
6.一种用于检测目标miRNA的生物探针,其特征在于:其包括如下结构:
(1)一段DNA片段,其能与目标miRNA的序列完全配对;
(2)与上述DNA片段一端相连的亲和素,
(3)与上述DNA片段另一端依次相连的3-10个碱基序列及与其相连的linker、-SH片段,linker含有至少一个亚甲基;
(4)与-SH相连的AuNPs。
7.如权利要求6所述的生物探针,其特征在于:亲和素连接在DNA片段的5’端,3-10个碱基序列、linker、-SH片段依次连接在DNA片段的3’端,linker为3-6个亚甲基。
8.如权利要求6-7所述的探针,其特征在于:AuNPs上有PEG修饰。
9.如权利要求6-8所述的生物探针在检测生物样本中目标miRNA的应用。
10.一种用于检测MiR-155的生物探针,其特征在于:其包括如下结构:
(1)5’-SEQ NO.1-3’-linker-SH,所述linker为3-6个亚甲基;
(2)与-SH相连的AuNPs。
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