[发明专利]一种噬菌体活性现场快速检测试方法在审
申请号: | 202011429096.5 | 申请日: | 2020-12-07 |
公开(公告)号: | CN112538549A | 公开(公告)日: | 2021-03-23 |
发明(设计)人: | 徐旭凌;丛郁;何四龙;乔欢;费文斌;黄杰;陈海;胡怿林;刘墨;谢晓莉 | 申请(专利权)人: | 菲吉乐科(南京)生物科技有限公司 |
主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/686;C12Q1/6806;C12N15/11 |
代理公司: | 南京瑞华腾知识产权代理事务所(普通合伙) 32368 | 代理人: | 梁金娟 |
地址: | 210000 江苏省南京市江*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 噬菌体 活性 现场 快速 检测 方法 | ||
1.一种噬菌体活性现场快速检测试方法,其特征在于:按照先后顺序包括以下步骤:
S1:RNA提取:采用RNA提取液对待测样本进行RNA提取,得到RNA备用;
S2:采用反转录试剂盒对上述步骤得到的RNA进行反转录,得到cDNA备用;
S3:利用primer 5.0设计引物,引物序列为:
SEQ ID NO.1:5,-TACCGTCCTTTTTCGGCTT-3,;
SEQ ID NO.2:3,-TGGTGGACGATACGCTGGC-5,;
S4:使用PCR反应液配置PCR反应体系,同时设置阳性对照和阴性对照,即获得阳性对照管、待测管和阴性对照管;
S5:将上述阳性对照管、待测管和阴性对照管放入到PCR仪中设定PCR参数,进行PCR扩增;
S6:取上述扩增结束的PCR液2μL,进行琼脂糖凝胶电泳,将待测管中与阳性对照管对应的条带进行回收测序,为所需条带序列,则选用步骤S2中的引物序列为实时定量的引物;
S7:利用上述噬菌体的cDNA为模板,加入实时定量试剂进行实时定量实验,来检测噬菌体的活性。
2.根据权利要求1所述的一种噬菌体活性现场快速检测试方法,其特征在于:所述步骤S1中的RNA提取液包括氯仿、异丙醇、乙醇和DEPC H2O,且氯仿、异丙醇、乙醇和DEPC H2O采用不同的试剂瓶盛装。
3.根据权利要求1所述的一种噬菌体活性现场快速检测试方法,其特征在于:所述步骤S4中PCR反应液包括13μM Taq DNA聚合酶50μL、150μM dNTP 100μL、SyBr染料200μL、15μM尿嘧啶糖基化酶50μL。
4.根据权利要求3所述的一种噬菌体活性现场快速检测试方法,其特征在于:所述步骤S4中PCR反应体系为20μL,包括所述PCR反应液15μL、所述引物SEQ ID NO.1 1μL、所述引物SEQ ID NO.2 1μL以及噬菌体cDNA3μL。
5.根据权利要求1所述的一种噬菌体活性现场快速检测试方法,其特征在于:所述步骤S5中PCR反应循环参数为:
94℃,2min;进入循环阶段:94℃变性15-30s,50-60℃退火1min,72℃延伸20s,35个循环;10℃停止。
6.根据权利要求1所述的一种噬菌体活性现场快速检测试方法,其特征在于:所述步骤S1中RNA提取的具体步骤为取少量待测样本2-4μL,加入相应5倍体积的RNA提取液,均匀混合后置于水浴锅中,水浴锅的温度为60℃,放置30-50min,取出后涡旋震荡仪震荡5-10min,然后再放入65℃的水浴锅中20min,取出后加入等体积的异丙醇,室温放置5min,12000rpm离心5min后弃上清,然后静置1-2h,使其溶液挥发,加入20μL无菌水溶解制得所述样品RNA。
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