[发明专利]水稻稻瘟病抗性基因Pi5的SNP分子标记及其应用

权利要求书

1.一种用于检测SNP K_090502的引物组，其特征在于：所述引物组包括特异性引物和通用引物，其中，所述特异性引物包括Primer Seq Allele X和Primer Seq Allele Y，所述Primer Seq Allele X的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示；所述Primer Seq Allele Y的核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示；所述通用引物的核苷酸序列如SEQ ID NO.3所示；所述K_090502的多态性为T或C，位于水稻基因组MSU7.0版本中Chr9.9644545处。

2.如权利要求1所述的引物组在稻瘟病抗性水稻育种中的应用。

3.一种SNP的检测方法，其特征在于：所述检测方法包括如下步骤：

S1、从水稻叶片中提取基因组DNA；

S2、以步骤S1中提取的基因组DNA为模板，利用如权利要求1所述的引物组，对SNP K_090502进行检测；

S3、若K_090502的SNP位点碱基为T，判定测试的水稻样品为纯合的不抗病Pi5基因型；若检测位点碱基为C，判定测试的水稻样品为纯合的抗病的Pi5基因型；若检测位点同时检测到C、T，判断待测水稻为杂合的抗病Pi5基因型。

4.如权利要求3所述的检测方法，其特征在于：步骤S2中，用KASP技术对SNP位点进行检测。

5.一种试剂盒，其特征在于：所述试剂盒包括核苷酸序列如SEQ ID NO.1-3所示的引物。

6.一种基因芯片，其特征在于：所述基因芯片包括核苷酸序列如SEQ ID NO.1-3所示的引物。