[发明专利]一种适用于拟盾壳霉FS482的CRISPR/Cas9载体及其构建方法和应用有效
申请号: | 202011456823.7 | 申请日: | 2020-12-10 |
公开(公告)号: | CN112553238B | 公开(公告)日: | 2022-06-07 |
发明(设计)人: | 叶伟;章卫民;徐诗航;李赛妮;陈书帅;刘昭明;张维阳;许丽琼 | 申请(专利权)人: | 广东省微生物研究所(广东省微生物分析检测中心) |
主分类号: | C12N15/80 | 分类号: | C12N15/80;C12N15/66;C12R1/645 |
代理公司: | 广州科粤专利商标代理有限公司 44001 | 代理人: | 朱双;刘明星 |
地址: | 510070 广东省广*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 适用于 拟盾壳霉 fs482 crispr cas9 载体 及其 构建 方法 应用 | ||
1.一种适用于拟盾壳霉FS482的CRISPR/Cas9基因敲除载体的构建方法,其特征在于,包括以下步骤:
a.采用限制性内切酶PacI对pFC332载体进行酶切,对酶切后的pFC332载体进行回收;
b.以 pG-F:CATCTAGAGGGCCGCTTAATGAGGACCGCTCGTCCCCTAT和PG-R:CTAGTAATGCGTAGAGGTGCGTCTGCCATGGTGATGGGAC 为引物,以埃德菌FS110基因组DNA为模板,扩增并回收得到pG启动子片段;
c.将pG启动子片段采用同源重组插入至酶切后的pFC332载体,菌液PCR和测序验证pG启动子的插入,构建得到pG-pFC332载体;
d.在所述的pG-pFC332载体的基础上,以P450基因的靶点序列5'-tcagttgatcgagaagatag-3',设计并扩增5SrRNA片段和含靶点序列的sgRNA片段,然后以5SrRNA片段和含靶点序列的sgRNA片段为模板,进行融合PCR得到5SrRNA-P450-sgRNA片段;
e.用限制性内切酶PacI和BglII双酶切pG-pFC332载体、5SrRNA-P450-sgRNA片段,然后用T4 DNA连接酶将5SrRNA-P450-sgRNA片段连接至pG-pFC332载体中,连接产物转化至DH5α感受态细胞,Amp抗性筛选,扩增5SrRNA-P450-sgRNA片段进行验证,由此获得适用于拟盾壳霉FS482的CRISPR/Cas9基因敲除载体;
所述的丝状真菌为拟盾壳霉FS482,所述的5SrRNA片段的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示,所述的含靶点序列的sgRNA片段的核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示。
2.按照权利要求1所述的构建方法构建得到的适用于拟盾壳霉FS482的CRISPR/Cas9基因敲除载体。
3.一种CRISPR/Cas9载体应用于拟盾壳霉FS482中P450基因敲除的方法,其特征在于,将权利要求2所述的适用于拟盾壳霉FS482的CRISPR/Cas9基因敲除载体通过原生质体转化法导入拟盾壳霉FS482原生质体中,对目标基因进行敲除。
4.根据权利要求3所述的方法,其特征在于,以拟盾壳霉FS482基因组为模板扩增P450基因的上下游同源臂,然后进行融合PCR,得到含有P450基因的上下游同源臂的基因片段;通过PEG介导法将所述的适用于拟盾壳霉FS482的CRISPR/Cas9基因敲除载体和所述基因片段导入拟盾壳霉FS482原生质体,用潮霉素抗性PDA平板筛选阳性克隆,挑取克隆扩大培养提取基因组DNA验证重组载体的导入,并通过同源臂两端引物验证目标基因的敲除。
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