[发明专利]一种DNA连接反应与滚环扩增联用的生物传感器检测结构特异性核酸酶FEN1的方法有效

专利信息
申请号: 202011472708.9 申请日: 2020-12-15
公开(公告)号: CN112575067B 公开(公告)日: 2023-03-28
发明(设计)人: 李昺之;张幸;夏安祺;吉峙润;谢思盈;锁缇莹;罗毅轩 申请(专利权)人: 南京师范大学
主分类号: C12Q1/6844 分类号: C12Q1/6844
代理公司: 南京苏高专利商标事务所(普通合伙) 32204 代理人: 柏尚春
地址: 210046 *** 国省代码: 江苏;32
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摘要:
搜索关键词: 一种 dna 连接 反应 扩增 联用 生物 传感器 检测 结构 特异性 核酸酶 fen1 方法
【权利要求书】:

1.一种DNA连接反应与滚环扩增联用的生物传感器检测结构特异性核酸酶FEN1的方法,其特征在于,具体包括如下步骤:

(a)将带有5’端序列片段的哑铃状DNA探针、测试样品、反应缓冲液进行混合,在35-40℃下孵育20-40min;所述带有5’端序列片段的哑铃状DNA探针的序列从5’至3’为TTAACGACCATTCAAACGCACTGATGGTTGCCAACCACAAACGGCAA;TTAACG为游离的5’末端序列,带下划线的字母表示引物的结合区域;

(b)将T4DNA连接酶及(a)中所述的反应缓冲液添加到(a)所得的最终溶液中,在20-25℃下孵育35-45min;

(c)将引物和滚环扩增混合物滴入(b)所得的最终溶液中以启动滚环扩增反应;引物的序列从5’至3’为CAGTGCGTT;

(d)将(c)中所得的最终溶液在读板仪上进行快速和高通量检测,在450-550nm之间进行激发和发射;

(e)将(c)中所得的最终溶液用荧光光谱仪测量荧光;

(f)重复上述步骤,检测不同浓度的测试样品的荧光值,通过绘制关系图,计算FEN1浓度与荧光强度之间的关系;

(g)将待测样品作为测试样品,进行步骤(a)-(e),将测得的荧光值与步骤(f)获得的关系图进行对比,计算待测样品中FEN1的浓度;

所述方法为非疾病的诊断目的。

2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,步骤(a)中哑铃状DNA探针浓度范围为5-15nM。

3.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,步骤(a)中反应缓冲液为含有KCl、Tris-HCl、(NH4)2SO4、MgSO4的溶液。

4.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,步骤(b)中T4DNA连接酶的浓度范围为3-7U/μL。

5.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,步骤(c)中RCA混合物中含有phi29 DNA聚合酶、dNTPs、phi29反应缓冲液和SGI。

6.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,步骤(d)中分别在497nm和530nm处进行激发和发射。

7.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,步骤(e)中荧光光谱仪在λ=497nm的波长下测量荧光。

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