[发明专利]抗体及其制备方法和编码核酸以及工程细胞在审
申请号: | 202011506854.9 | 申请日: | 2020-12-18 |
公开(公告)号: | CN114349850A | 公开(公告)日: | 2022-04-15 |
发明(设计)人: | 蒋庆华;王平平;罗檬;周文洋;许召春;靳喜云 | 申请(专利权)人: | 蒋庆华;王平平;步志高;赵东明 |
主分类号: | C07K16/10 | 分类号: | C07K16/10;C12N15/13;C12N5/10 |
代理公司: | 北京英创嘉友知识产权代理事务所(普通合伙) 11447 | 代理人: | 耿超 |
地址: | 150001 黑龙江省哈尔滨市*** | 国省代码: | 黑龙江;23 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 抗体 及其 制备 方法 编码 核酸 以及 工程 细胞 | ||
1.一种制备抗体的方法,其特征在于,该方法包括如下步骤:
S1、获得抗原免疫后的人体或动物体的血液样本,并将所述血液样本分为第一样本和第二样本;
S2、对所述第一样本进行B细胞mRNA受体测序,得到第一测序结果;
S3、对所述第二样本进行B细胞的单细胞mRNA VDJ测序,得到第二测序结果;
S4、将所述第一测序结果和所述第二测序结果进行抗原特异性聚类,得到B细胞受体重链簇;
S5、在所述B细胞受体重链簇中根据表达量筛选来源于单细胞VDJ测序的候选中和抗体序列重链;
S6、对筛选得到的候选中和抗体序列重链查找其配对的轻链,对于多条轻链根据表达量进行筛选进行配对,得到轻-重链对;
S7、从所述轻-重链对中根据表达量、种型、CDR1/CDR2突变率、匹配注释得分、拼接质量得分、可产生性、被测序细胞完整性、全长完整度筛选出候选轻-重链对;
S8、提取候选轻-重链对的可变区域部分的序列,根据参考基因组序列添加V基因头部不变序列部分,并且添加恒定区片段形成完整的中和抗体序列;
S9、将所述中和抗体序列进行表达并通过ELISA试验进行筛选,得到目标抗体。
2.根据权利要求1所述的方法,其中,所述抗原包括病毒、细菌、小分子化合物半抗原;所述动物体包括哺乳动物、鸟类,优选包括猴、牛、羊、兔、鼠、犬。
3.根据权利要求1所述的方法,其中,所述单细胞VDJ测序采用10x Genomics ImmuneProfiling或Smart-SEQ/Smart-SEQ2协议;所述抗原特异性聚类方法采用iSMART方法或Gliph2方法。
4.根据权利要求1所述的方法,其中,所述抗原特异性聚类的筛选条件包括:(1)簇内包含来自单细胞VDJ测序的重链序列;(2)簇内所有重链CDR3区域氨基酸序列不全相同;3)簇内重链序列种型包含至少两种,且符合类型转换事件顺序。
5.根据权利要求1所述的方法,其中,所述V基因头部不变序列部分的重链为SEQ IDNO.7所示,轻链为SEQ ID NO.8所示;所述恒定区片段的序列的重链为SEQ ID NO.9所示,轻链为SEQ ID NO.10所示。
6.根据权利要求1所述的方法,其中,所述抗原免疫后的人体为传染病人,特别是严重急性呼吸综合征冠状病毒2(SARS-CoV-2)感染者。
7.一种抗严重急性呼吸综合征冠状病毒2(SARS-CoV-2)的抗体,该抗体具有轻链和重链,其特征在于,所述轻链的可变区的氨基酸序列如SEQ ID NO.1所示,所述重链的可变区的氨基酸序列如SEQ ID NO.2所示。
8.根据权利要求7所述的抗体,其特征在于,所述轻链的氨基酸序列如SEQ ID NO.3所示,所述重链的氨基酸序列如SEQ ID NO.4所示。
9.一种核酸组,其特征在于,所述核酸组包括编码权利要求8所述的抗严重急性呼吸综合征冠状病毒2(SARS-CoV-2)的抗体的轻链的第一核酸和编码权利要求8所述的抗严重急性呼吸综合征冠状病毒2(SARS-CoV-2)的抗体的重链的第二核酸,优选地,所述核酸的核苷酸序列如SEQ ID NO.5及SEQ ID NO.6所示。
10.一种工程细胞,其特征在于,该工程细胞表达权利要求8或9所述的抗严重急性呼吸综合征冠状病毒2(SARS-CoV-2)的抗体。
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