[发明专利]一种构建芜菁初级核心种质的多态性SSR引物及方法在审

专利信息
申请号: 202011520003.X 申请日: 2020-12-21
公开(公告)号: CN112442549A 公开(公告)日: 2021-03-05
发明(设计)人: 余小林;李荣荣;高莹莹;章艺;于淑博;刘楷文;赵坤;宋建伟 申请(专利权)人: 浙江大学;无锡迪茉得生物种业科技有限公司
主分类号: C12Q1/6895 分类号: C12Q1/6895;C12N15/11
代理公司: 杭州求是专利事务所有限公司 33200 代理人: 邱启旺
地址: 310058 浙江*** 国省代码: 浙江;33
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摘要:
搜索关键词: 一种 构建 芜菁 初级 核心 种质 多态性 ssr 引物 方法
【权利要求书】:

1.一种构建芜菁初级核心种质的多态性SSR引物,其特征在于,所述多态性SSR引物包含31对引物,所述引物1的正向引物如SEQ ID No.1所示,引物1的反向引物如SEQ ID No.2所示;所述引物2的正向引物如SEQ ID No.3所示,引物2的反向引物如SEQ ID No.4所示;所述引物3的正向引物如SEQ ID No.5所示,引物3的反向引物如SEQ ID No.6所示;所述引物4的正向引物如SEQ ID No.7所示,引物4的反向引物如SEQ ID No.8所示;所述引物5的正向引物如SEQ ID No.9所示,引物5的反向引物如SEQ ID No.10所示;所述引物6的正向引物如SEQ ID No.11所示,引物6的反向引物如SEQ ID No.12所示;所述引物7的正向引物如SEQID No.13所示,引物7的反向引物如SEQ ID No.14所示;所述引物8的正向引物如SEQ IDNo.15所示,引物8的反向引物如SEQ ID No.16所示;所述引物9的正向引物如SEQ ID No.17所示,引物9的反向引物如SEQ ID No.18所示;所述引物10的正向引物如SEQ ID No.19所示,引物10的反向引物如SEQ ID No.20所示;所述引物11的正向引物如SEQ ID No.21所示,引物11的反向引物如SEQ ID No.22所示;所述引物12的正向引物如SEQ ID No.23所示,引物12的反向引物如SEQ ID No.24所示;所述引物13的正向引物如SEQ ID No.25所示,引物13的反向引物如SEQ ID No.26所示;所述引物14的正向引物如SEQ ID No.27所示,引物14的反向引物如SEQ ID No.28所示;所述引物15的正向引物如SEQ ID No.29所示,引物15的反向引物如SEQ ID No.30所示;所述引物16的正向引物如SEQ ID No.31所示,引物16的反向引物如SEQ ID No.32所示;所述引物17的正向引物如SEQ ID No.33所示,引物17的反向引物如SEQ ID No.34所示;所述引物18的正向引物如SEQ ID No.35所示,引物18的反向引物如SEQ ID No.36所示;所述引物19的正向引物如SEQ ID No.37所示,引物19的反向引物如SEQ ID No.38所示;所述引物20的正向引物如SEQ ID No.39所示,引物20的反向引物如SEQ ID No.40所示;所述引物21的正向引物如SEQ ID No.41所示,引物21的反向引物如SEQID No.42所示;所述引物22的正向引物如SEQ ID No.43所示,引物22的反向引物如SEQ IDNo.44所示;所述引物23的正向引物如SEQ ID No.45所示,引物23的反向引物如SEQ IDNo.46所示;所述引物24的正向引物如SEQ ID No.47所示,引物24的反向引物如SEQ IDNo.48所示;所述引物25的正向引物如SEQ ID No.49所示,引物25的反向引物如SEQ IDNo.50所示;所述引物26的正向引物如SEQ ID No.51所示,引物26的反向引物如SEQ IDNo.52所示;所述引物27的正向引物如SEQ ID No.53所示,引物27的反向引物如SEQ IDNo.54所示;所述引物28的正向引物如SEQ ID No.55所示,引物28的反向引物如SEQ IDNo.56所示;所述引物29的正向引物如SEQ ID No.57所示,引物29的反向引物如SEQ IDNo.58所示;所述引物30的正向引物如SEQ ID No.59所示,引物30的反向引物如SEQ IDNo.60所示;所述引物31的正向引物如SEQ ID No.61所示,引物31的反向引物如SEQ IDNo.62所示。

2.一种权利要求1所述多态性SSR引物用于构建芜菁初级核心种质的方法,其特征在于,具体包括如下步骤:

(1)扩增获得SSR多态性条带:利用筛选的多态性SSR引物,对芜菁材料进行扩增,得到SSR多态性条带;

(2)原始种质群体的聚类分析:根据SSR多态性条带确定遗传相似系数矩阵,将遗传相似系数矩阵通过NTSYS 2.10e及PowerMarker V3.25软件采用UPGMA聚类分析方法对芜菁材料的原始种质群体进行聚类分析;

(3)取样方法:采用欧式距离计算聚类分析的原始种质群体的遗传距离,抽样方法使用多次聚类优先取样法,选取其中的15%作为芜菁材料的初级核心种质。

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