[发明专利]一种构建芜菁初级核心种质的多态性SSR引物及方法

说明书

本发明提出了一种构建芜菁初级核心种质的多态性SSR引物及方法，所述多态性SSR引物包含31对引物，所述引物的序列为SEQ ID No.1～SEQ ID No.62。本发明利用31对多态性SSR引物，对芜菁材料进行扩增，确定遗传相似系数矩阵，将遗传相似系数矩阵通过NTSYS 2.10e及PowerMarker V3.25软件进行聚类分析；采用欧式距离计算聚类分析的原始种质群体的遗传距离，选取芜菁材料的初级核心种质。本发明的芜菁初级核心种质的构建能够排除遗传冗余，使得累积贡献率明显提高。

技术领域

本发明属于农作物种质资源保护技术领域，具体地涉及一种构建芜菁初级核心种质的多态性SSR引物及方法。

背景技术

芜菁(Brassica campestris syn.B.rapa L.ssp..rapifera Matzg)又称圆根或芫根(藏语称之为妞玛)，属十字花科芸薹属芸薹种芜菁亚种两年生的草本植物。其根系生长茂盛，上部膨大形成扁圆形状的肉质块根，外形近似圆萝卜，表皮有多种颜色，肉质纯白色、细滑、味道略甜，并有稍许辛辣。自西汉时期首次传入中国以来，已经具有2100多年的栽培历史，成为在中国许多地区都很受欢迎的一种蔬菜。在中国，芜菁拥有不同的中文名称，如蔓菁、圆菜头、芫根、盘菜、布留克等。研究表明，芜菁中含有多种人体所需的生物活性成分如黄酮、三萜、多糖、皂苷、生物碱等，不仅可用于清热解毒、滋补、增强免疫力、延缓衰老，还能够抵抗突变、辐射、疲劳和缺氧等。随着新品种的培育和推广，深加工技术的不断提高和发展，芜菁已成为我国许多地区尤其是边疆地区重要的经济作物之一。研究发现，芜菁拥有最多的与根肿病抗性相关的基因资源，对其进行遗传多样性研究及核心种质构建有助于获得高抗芸薹根肿病的材料，并可由此进行根肿病种质创新的相关工作。

核心种质(core collection)，是指用最少数量的样品最大程度的代表原始种群的遗传多样性。这一概念最先由澳大利亚的研究学者Frankel为解决繁多冗杂的种质资源与其在保存、评价、鉴定利用等方面所面临的困难之间的矛盾所提出，该学者和A.H.D.Brown等人又对其做了更进一步的完善和发展研究。核心种质应能表现和包括当前物种多样性的主要及大部分类型，应具有异质性、多样性与代表性、实用性与动态性。而随着生物学等领域研究水平的不断提高，核心种质的范围已扩展到无性繁殖保存、DNA种质库建立和in situ保存等多种研究领域。据相关文献报道，目前已构建完成了25种蔬菜作物、20种果树植物、11种观赏植物还有中国茶树和世界茶树的核心(或初级核心)种质。但迄今未见芜菁核心种质构建的相关报道。

发明内容

鉴以此，本发明的目的在于建立一种构建芜菁初级核心种质的多态性SSR引物及方法，在无特殊设备要求的情况下，能达到简单，方便，高效地构建芜菁初级核心种质的目的。