[发明专利]紫菜薹SSR分子标记组合，SSR引物组合，SSR指纹图谱及应用

说明书

本发明提供了紫菜薹SSR分子标记，SSR指纹图谱及其建立方法和应用，涉及分子生物学和植物品种鉴别技术领域。本发明通过分析紫菜薹基因组序列获得了基因组SSR分子标记，并根据序列合成了30对SSR引物，构建了紫菜薹鉴定的SSR指纹图谱，利用PCR扩增技术和电泳检测技术对紫菜薹品种进行检测，可在短时间内完成紫菜薹品种鉴定与遗传多样性评价工作，可高效、准确、低成本对紫菜薹品系或其野生近缘种进行鉴定。本发明的鉴定方法可对紫菜薹真伪进行有效监控，从DNA水平揭示品种的遗传变异与遗传关系，保护了农作物品种，防止假冒伪劣产品进入市场。

技术领域

本发明涉及分子生物学和植物品种鉴别技术领域，具体涉及紫菜薹SSR分子标记，SSR指纹图谱及其建立方法和应用。

背景技术

紫菜薹(Brassica campestris L.ssp.chinensis var.utilis Tsen et Lee.)，又名红菜薹，是十字花科芸薹属小白菜的一个变种，主要分布在湘、鄂、川等长江流域地区，紫菜薹叶片绿色，叶主脉为紫红色，薹紫红色，色泽佳，菜薹肥嫩，食味甜美。近年来红菜薹作为优质高档菜引种到全国各地栽培。目前我国对紫菜薹品种进行鉴定主要方法是按照NY/T 2574-2014《植物新品种特异性、一致性和稳定性测试指南菜薹》进行田间测定来鉴定的。这种传统的鉴定方法简便、经济，但由于许多形态学性状鉴定周期长、易受环境影响，不能精确、快捷地为新品种侵权案件提供鉴定依据，同时也常出现不同测试人员对某些性状的认识存在偏差，导致判定结果不一致的问题。

随着生物技术的发展，基于分子标记技术而建立起来的DNA指纹图谱(fingerprint)在品种、品系鉴别方面发挥着重要作用。品种DNA指纹数据库的构建在紫菜薹品种纯度及真实性鉴定、品种审定及产权登记保护、真假种辨别、品种纠纷等方面具有重要应用价值。当前用于构建作物DNA指纹图谱的标记技术主要有RFLP、RAPD、AFLP、EST、ISSR、SSR等。DNA指纹图谱能够从DNA水平上鉴定出品种间的差异或遗传相似性。

简单重复序列(Simple sequence repeat，SSR，又称微卫星)是由1-6个核苷酸组成的短序列串联重复多次而组成的一段DNA，由于微卫星重复单元的重复次数不同，因而扩增出的微卫星序列的长度呈现多态性。微卫星序列具有多态性较高，重复性和稳定性好等特点，是十分有效的分子标记，被广泛应用于品种鉴定、指纹图谱构建等领域。为了有效保护我国菜薹品种知识产权，有必要在我国开展紫菜薹开发微卫星标记开发，并应用于紫菜薹优良品种“分子身份证”构建的研究。

发明内容

有鉴于此，本发明致力于提供一种通过分析紫菜薹基因组序列获得了基因组SSR分子标记，并根据序列合成核心基因组SSR引物，构建了紫菜薹鉴定的SSR指纹图谱，可高效、准确、低成本对紫菜薹品系或其野生近缘种进行鉴定。