[发明专利]一组与小麦白粉病抗性显著关联的SNP位点及其在遗传育种中的应用

权利要求书

1.一组与小麦白粉病抗性显著关联的SNP位点，其特征在于：所述的SNP位点包括58个SNP位点，编号分别为SNP01～SNP58，它们的信息如下：

表中物理位置以中国春基因组IWGSC reference genome v1.1 (IWGSC, 2018)为参考序列；

表中所列序列见序列表SEQ ID NO.1～SEQ ID NO.116。

2.根据权利要求1所述的一组与小麦白粉病抗性显著关联的SNP位点在小麦白粉病抗性鉴定中的应用。

3.根据权利要求1所述的一组与小麦白粉病抗性显著关联的SNP位点在制备小麦白粉病抗性鉴定试剂盒中的应用。

4.根据权利要求1所述的一组与小麦白粉病抗性显著关联的SNP位点在制备单个可检测的SNP标记或基因芯片中的应用。

5.根据权利要求1所述的一组与小麦白粉病抗性显著关联的SNP位点在制备与抗白粉病基因位点qPm6A.3共分离的KASP标记k6A86486中的应用。

6.根据权利要求1所述的一组与小麦白粉病抗性显著关联的SNP位点在小麦白粉病抗性鉴定检测方法中的应用。

7.根据权利要求6所述的检测方法中的应用，其特征在于，所述检测方法包括以下步骤：

根据SNP位点设计KASP引物，根据包含SNP位点上下游各50bp的DNA短序列设计KASP引物；具体利用网站http://www.polymarker.info/ 进行引物设计，采用网站默认的参数设置；引物前加接头，FAM序列为“GAAGGTGACCAAGTTCATGCT”，HEX序列为“GAAGGTCGGAGTCAACGGATT”；

引物设计合成后，可以利用分离群体或者自然群体进行有效性检测，验证通过GWAS鉴定到的QTL是否存在，其使用方法分别如下：

（1）以小麦DNA为PCR扩增模板，以设计合成的KASP引物，进行PCR扩增，反应体系为6μL；上述反应体系具体包括：20-50ng/μL的DNA 3μL，2×KASP Master mix 3μL,KASP Assaymix 上下游引物混合液 0.0825μL；置于384孔PCR仪扩增；

（2）PCR扩增程序为:94℃预变性15min；94℃变性20s，65-57℃复性60s；每循环降低0.8℃；10个循环；94℃变性20s，57℃复性60s，30个循环；10℃保存；

（3）PCR结束后，置于Omega SNP分型仪检测PCR分型结果；

（4）分析鉴定，根据分型结果分析基因型。