[发明专利]一种检测肿瘤相关基因谱表达量的方法及其用途在审
申请号: | 202011549398.6 | 申请日: | 2020-12-24 |
公开(公告)号: | CN114672554A | 公开(公告)日: | 2022-06-28 |
发明(设计)人: | 刘春芳;马展;刘杰;吕元 | 申请(专利权)人: | 复旦大学附属华山医院 |
主分类号: | C12Q1/6886 | 分类号: | C12Q1/6886;C12N15/11 |
代理公司: | 上海元一成知识产权代理事务所(普通合伙) 31268 | 代理人: | 吴桂琴 |
地址: | 200031 上*** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 检测 肿瘤 相关 基因 谱表 方法 及其 用途 | ||
1.一种检测肿瘤相关基因谱表达量的方法,其特征在于,检测结直肠癌相关基因组癌基因/抑癌基因的基因表达产物得表达量的改变,分析所述基因组与结直肠癌变的相关性;
所述基因组,包括:KRT23,KRT80,CA9,FOXQ1,CDH3,KIAA1199,CLDN2,KLK10,CLDN1,GRIN2D,NKD1,C6ORF223,MMP3,MMP11,TRIM29,TESC,GYLTL1B,NKD2,PRSS22,VWA2,REG1A,DPEP1,FABP6,CEL,CELP,CPNE7,RPL13AP20,TNFRSF6B,CYP19A1,RPLP0P2,GUCA2B,AQP8,CA1,GUCA2A,CA2,CLCA4,H19,FAP,NAT1中的单个或二种及以上任意组合基因。
2.按权利要求1所述的方法,其特征在于,所述的基因表达产物包括:蛋白质和RNA。
3.按权利要求1所述的方法,其特征在于,所述的基因表达产物包括:肿瘤细胞中的,和进入体液中的游离的RNA、蛋白及外泌体中的RNA、蛋白,包括完整和片段RNA、蛋白;蛋白质和RNA。
4.权利要求1所述的方法,其特征在于,所述方法中,通过多种基因联合形成阵列,再与提取、检测结直肠病变组织中蛋白质如,免疫比浊、胶体金、免疫化学发光,或RNA如,RT-PCR、荧光定量PCR、RNA array、RNA Sequencing相结合,检测肿瘤相关基因谱的表达量。
5.权利要求1的检测肿瘤相关基因谱表达量的方法在制备用于预测结直肠是否发生癌变、癌症分类、分子分型、耐药性、药物筛选、肿瘤恶性程度、病人预后评估制品中的用途。
6.按权利要求5所述的用途,其特征在于,所述的制品中,通过检测相关基因谱的表达量的改变,分析预测结直肠是否发生癌变、癌症分类、分子分型、耐药性、药物筛选、肿瘤恶性程度、病人预后评估;其中,
单独利用所述基因表达量改变预测结直肠癌变、癌症分类、分子分型、肿瘤恶性程度或病人预后;或,
联合所述基因中2个及2个以上的任意组合表达量改变预测结直肠癌变、癌症分类、分子分型、肿瘤恶性程度、病人预后;或,
所述单个基因或任意组合后再与其它指标相结合,预测结直肠癌变、癌症分类、分子分型、肿瘤恶性程度或病人预后。
7.按权利要求6所述的用途,其特征在于,所述结肠癌(Colon adenocarcinoma,COAD)和结肠癌(Rectum adenocarcinoma,READ)的组织学分类包括Adenocarcinoma和Mucinousadenocarcinoma。
8.按权利要求6所述的用途,其特征在于,所述检测对象包括:结直肠病变组织包括癌变、增生、癌前病变、体液包括血液、尿液、穿刺液、穿刺组织、大便、肠道分泌物。
9.按权利要求5或6所述的用途,其特征在于,所述恶性分级及预后判断包括:肿瘤类型、分子分型、恶性程度、转移能力、耐药性、靶向药物的选择、生存期评估。
10.权利要求5或6所述的用途,其特征在于,所述的基因的表达量包括:与自身内参的比较、和自身内参的比较后再与癌旁组织、和自身内参的比较后再与正常组织相比较。
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