[发明专利]一种检测肿瘤相关基因谱表达量的方法及其用途

说明书

本发明属生物和医学检验技术领域，涉及检测肿瘤相关基因产物表达量的一种分子生物学方法，该方法可用于提供鉴别结直肠癌变、结直肠癌分类/型、预后评估等的参考。所涉及的基因包括：KRT23,KRT80,CA9,FOXQ1,CDH3,KIAA1199，CLDN2,KLK10,CLDN1,GRIN2D,NKD1,C6ORF223，MMP3,MMP11,TRIM29,TESC,GYLTL1B,NKD2,PRSS22,VWA2,REG1A,DPEP1,FABP6,CEL,CELP,CPNE7,RPL13AP20,TNFRSF6B,CYP19A1,RPLP0P2，GUCA2B,AQP8,CA1,GUCA2A,CA2,CLCA4，H19,FAP,NAT1等。上述基因(单个或任意组合)的联合应用有助于提供对结直肠癌的鉴定、分类/型、预后评估等参考；联合应用上述基因鉴别结直肠癌和正常结直肠组织，在特异性100％时，灵敏度可达97％。

技术领域

本发明属生物和医学检验技术领域，涉及检测肿瘤相关基因谱表达量的方法及其用途。具体涉及检测肿瘤相关基因谱(单个或任意组合)表达量(蛋白质、RNA)的一种分子生物学方法，通过检测的相关基因谱的改变提供鉴别结直肠癌变、结直肠癌分类/型、预后评估等的参考。所涉及的基因包括：KRT23,KRT80,CA9,FOXQ1,CDH3,KIAA1199，CLDN2,KLK10,CLDN1,GRIN2D,NKD1,C6ORF223，MMP3,MMP11,TRIM29,TESC,GYLTL1B,NKD2,PRSS22,VWA2,REG1A,DPEP1,FABP6,CEL,CELP,CPNE7,RPL13AP20,TNFRSF6B,CYP19A1,RPLP0P2，GUCA2B,AQP8,CA1,GUCA2A,CA2,CLCA4,H19,FAP,NAT1等。

背景技术

临床实践显示，结直肠癌是常见消化道肿瘤，其已成为重要的健康和生命的杀手。迄今为止，结直肠的早期诊断、分子分型、预后评估是尽早发现结直肠癌、根据分子分型采取相应的个性化精准治疗是目前对抗结直肠癌的有力手段。病理形态学是诊断结直肠癌的金标准，然而近年来病理医生紧缺而且病理诊断耗时长、主观性强；而且病理上的改变往往滞后于在分子生物学上的改变。因此，寻找早期、快速鉴别结直肠癌的分子生物学方法迫在眉睫。

基于现有技术的研究基础与现状，本申请的发明人拟提供检测肿瘤相关基因谱表达量的方法及其用途。具体涉及检测肿瘤相关基因谱(单个或任意组合)表达量(蛋白质、RNA)的一种分子生物学方法，通过检测的相关基因谱的改变提供鉴别结直肠癌变、结直肠癌分类/型、预后评估等的参考。

发明内容

本发明的目的在于为“快速、高效的鉴别结直肠癌、组织分型、分子分型及预后评估等”问题，提供一种检测肿瘤相关基因谱表达量的方法及其用途。本发明利用肿瘤相关基因表达谱改变，为辅助结直肠癌的鉴别、分类、分子分型及预后评估的提供参考。

本发明基于大规模结直肠癌相关癌基因/抑癌基因表达谱的分析，筛查出与正常结直肠组织相比基因表达差异显著的、与结直肠癌组织分类及预后等相关的一组基因，包括：KRT23,KRT80,CA9,FOXQ1,CDH3,KIAA1199，CLDN2,KLK10,CLDN1,GRIN2D,NKD1,C6ORF223，MMP3,MMP11,TRIM29,TESC,GYLTL1B,NKD2,PRSS22,VWA2,REG1A,DPEP1,FABP6,CEL,CELP,CPNE7,RPL13AP20,TNFRSF6B,CYP19A1,RPLP0P2，GUCA2B,AQP8,CA1,GUCA2A,CA2,CLCA4，H19,FAP,NAT1等基因。经实验证实，所述的结直肠癌鉴别、分类、分子分型及预后评估与上述基因组在结直肠组织癌变前后出现表达量改变具有相关，本发明方法的检测结果为预测结直肠癌是否发生癌变、癌症分类、分子分型、耐药性、药物筛选、病人预后评估等提供了有价值的参考。