[发明专利]用于银龙鱼性别鉴定的SNP分子标记及其应用有效
申请号: | 202011564604.0 | 申请日: | 2020-12-25 |
公开(公告)号: | CN114686596B | 公开(公告)日: | 2023-04-28 |
发明(设计)人: | 牟希东;刘奕;刘超;杨叶欣;宋红梅;汪学杰;徐猛;顾党恩;房苗;胡隐昌 | 申请(专利权)人: | 中国水产科学研究院珠江水产研究所 |
主分类号: | C12Q1/6888 | 分类号: | C12Q1/6888;C12Q1/6879;C12Q1/6869;C12N15/11 |
代理公司: | 广州润禾知识产权代理事务所(普通合伙) 44446 | 代理人: | 林伟斌 |
地址: | 510000 广东*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 用于 银龙鱼 性别 鉴定 snp 分子 标记 及其 应用 | ||
1.一种用于银龙鱼性别鉴定的SNP分子标记,其特征在于,所述分子标记的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示,其中该序列第243位为C或T。
2.根据权利要求1所述的用于银龙鱼性别鉴定的SNP分子标记,其特征在于,当第243位碱基为C/C纯合时,样品为雄性,为C/T杂合时,样品为雌性。
3.一种用于鉴定或辅助鉴定银龙鱼性别的引物对,其特征在于,包括上游引物F和下游引物R,所述上游引物F的核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示,所述下游引物R的核苷酸序列如SEQ ID NO.3所示。
4.一种用于鉴定或辅助鉴定银龙鱼性别的试剂盒,其特征在于,含有权利要求3所述的引物对、dNTP以及DNA聚合酶。
5.一种银龙鱼性别鉴定方法,其特征在于,包括以下步骤:
(1)提取待测银龙鱼的基因组DNA;
(2)以待测银龙鱼的基因组DNA为模板,利用权利要求3所述上游引物F和下游引物R,进行PCR扩增反应;
(3)反应完成后进行分析,确定样品基因型,鉴定性别;当SEQ ID NO.1核苷酸序列中第243位碱基为C/C纯合时,样品为雄性,为C/T杂合时,样品为雌性。
6.根据权利要求5所述的银龙鱼性别鉴定方法,其特征在于,步骤(2)中PCR扩增反应时采用的反应体系为40μl,包括2*Taq MasterMix 20μl、Primer F 1.6μl、Primer R 1.6μl、ddH2O15.8μl、基因组DNA1μl。
7.根据权利要求5所述的银龙鱼性别鉴定方法,其特征在于,步骤(2)中PCR扩增反应时PCR扩增程序为:94℃2min;然后进行35个循环,包括94℃30s,56℃30s,72℃20s;然后72℃保持5min结束。
8.根据权利要求5所述的银龙鱼性别鉴定方法,其特征在于,步骤(3)中结合Sanger测序进行分析,确定样品基因型,鉴定性别。
9.权利要求1~2任一项所述用于银龙鱼性别鉴定的SNP分子标记、权利要求3所述引物对、权利要求4所述试剂盒和/或权利要求5~8任一项所述方法在银龙鱼性别鉴定中的应用。
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