[发明专利]一种用于检测抗稻瘟病Pik基因的SNP分子标记及其应用

权利要求书

1.一种SNP分子标记，所述SNP分子标记的多态性位于MSU7.0基因组版本中水稻第11号染色体第27998933位点处碱基为T/C。

2.用于扩增权利要求1所述SNP分子标记的引物，其特征在于，所述引物的序列如下所示：

特异性引物：

Primer X：5’-GCCCACAATATTCATATCAGGT-3’（SEQ ID NO.1）；

Primer Y：5’-CCCACAATATTCATATCAGGC-3’（SEQ ID NO.2）；

通用引物：

Primer C：5’-ACCTTGATTGTAGGCAGCTT-3’（SEQ ID NO.3）。

3.一种试剂盒，其特征在于，包含权利要求2所述引物。

4.权利要求1所述分子标记在辅助鉴定抗稻瘟病Pik基因和/或辅助育种中的应用。

5.权利要求2所述引物或权利要求3所述试剂盒在检测抗稻瘟病Pik基因和/或辅助育种中的应用。

6.一种检测抗稻瘟病Pik基因型的方法，其特征在于，包括如下步骤：

S1：采用权利要求2所述引物或权利要求3所述试剂盒对水稻样品基因组进行KASP反应检测；其中，两条特异性引物分别连接不同的荧光接头序列；

S2：若只检测到引物Primer Y所连荧光接头序列对应的荧光信号，则判断水稻样品为具有抗稻瘟病的纯合Pik基因型；若只检测到引物Primer X所连荧光接头序列对应的荧光信号，则判断水稻样品为不具有抗稻瘟病的纯合pik基因型；若同时检测到两种荧光，则判断水稻样品为具有抗稻瘟病的杂合Pik基因型。

7.权利要求1所述分子标记或权利要求2所述引物或权利要求3所述试剂盒在水稻种质资源改良中的应用。

8.权利要求1所述分子标记或权利要求2所述引物或权利要求3所述试剂盒在水稻稻瘟病的抗性改良中的应用。

9.权利要求1所述分子标记或权利要求2所述引物或权利要求3所述试剂盒在培育具有抗稻瘟病能力水稻中的应用。