[发明专利]一种壳聚糖水解酶可逆抑制保护剂的筛选方法

权利要求书

1.一种用于壳聚糖水解酶的可逆抑制保护剂的筛选模型，其特征在于，所述的筛选模型的建立方法如下：

1)根据已知于壳聚糖水解酶的结构数据，确定可逆抑制保护剂的类别及对壳聚糖水解酶的抑制常数，确定训练集的化合物；

2)将步骤1)所述的训练集中的化合物与壳聚糖水解酶进行分子对接，并使用步骤1)中的可逆抑制保护剂对壳聚糖水解酶活性的抑制常数进行修正；

3)根据步骤2)获得的训练集中的化合物与壳聚糖水解酶的结合自由能和可逆抑制常数，结合步骤1)训练集中的化合物筛选结果制定筛选规则，建立筛选模型。

2.如权利要求1所述的筛选模型，其特征在于，所述的步骤1)进入训练集的组成化合物包含有2,4-二硝基苯甲醚(2,4-dinitro-1-fluorbenzene)、2-羟-5硝基苄溴(2-Hydroxy-5-nitrobenzyl bromide)、乙酸钠(Sodium acetate)、苯扎氯铵(benzalkoniumchloride)、乙酰亚胺酸乙酯(ethyl acetimidate)、乙二胺四乙酸二钠(EDTA)、葡糖胺(glucosamine)、盐酸胍(guanidinium hydrochloride)、半胱氨酸(cysteine)和碘乙酸(monoiodoacetate)。

3.如权利要求1所述的筛选模型，其特征在于，所述的步骤2)中的分子对接方法为利用REDUCE、Autodock Tools和Autodoc4共同完成。

4.如权利要求3所述的筛选模型，其特征在于，所述的步骤2)中的分子对接方法，首先为壳聚糖水解酶和抑制剂添加氢键和Gaussian电荷，再采用分子和壳聚糖水解酶活性位点区域完全柔性的对接方法。

5.如权利要求1所述的筛选模型，其特征在于，所述的步骤3)中筛选的规则如下：-6.000≤Ei≤-5.000,50≤Ki≤200。

6.如权利要求1所述的筛选模型，其特征在于，所述的筛选模型是一个有效的药效团模型，该模型具有2个疏水中心，以及3个氢键受体和5个给体。

7.一种筛选壳聚糖水解酶的可逆抑制保护剂的方法，其特征在于，所述的方法是使用权利要求1-6任一项所述的筛选模型来进行筛选。

8.如权利要求7所述的筛选方法，其特征在于，所述的方法是按照权利要求1-6任一项所述的筛选模型所制定的筛选规则对待筛选的化合物组成化合物池A，并进行排序打分，将化合物池A中的化合物按照理论结合自由能和理论可逆抑制常数重新排序，取排在前2000位的分子使用X-score打分函数联合打分，计算与靶蛋白的亲和力，取打分值大于5.0的化合物再组成化合物池B；获取化合物池B后，使用筛选模型进行拟合排序，筛选出壳聚糖水解酶的可逆抑制保护剂。