[发明专利]一种鸡传染性贫血病病毒绝对荧光定量PCR检测方法在审
申请号: | 202011574377.X | 申请日: | 2020-12-28 |
公开(公告)号: | CN112522447A | 公开(公告)日: | 2021-03-19 |
发明(设计)人: | 叶建强;张俊;马莉;李拓凡;万志敏;邵红霞;秦爱建 | 申请(专利权)人: | 扬州大学 |
主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/6851;C12N15/11;C12R1/93 |
代理公司: | 扬州苏中专利事务所(普通合伙) 32222 | 代理人: | 沈志海 |
地址: | 225009 *** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 传染性 贫血病 病毒 绝对 荧光 定量 pcr 检测 方法 | ||
1.一种鸡传染性贫血病病毒绝对荧光定量PCR检测方法,其特征在于,包括以下步骤:
(1)鸡传染性贫血病病毒基因组DNA的提取:鸡传染性贫血病病毒基因组DNA的提取通过使用Axygen公司的DNA小提试剂盒AxyPrepTM Multisource Genomic DNA完成;
(2)引物的设计与合成:根据鸡传染性贫血病病毒VP1基因的高度保守区,设计并合成了扩增片段大小为140bp的上下游引物,引物序列如下:上游引物为VP1-F:5′-GCCCCGGTACGTATAGTGTG-3′;下游引物为VP1-R:5′-CCCGTACATGTGGTCTGCAT-3′;引物使用前,用超纯水溶解,使用浓度为10pmol,-20℃保存备用;
(3)绝对荧光定量PCR方法的建立:通过使用TaKaRa公司的TB Green™ Premix Ex Taq™ II试剂来进行绝对荧光定量PCR方法的建立,反应体系为20μL:A液:模板2μL,双蒸水6μL;B液:TB Green Premix Ex Taq II(2×)10μL,上下游引物各0.8μL,ROX Reference DyeⅡ(50×)0.4μL;加样时先在八联管反应管里加入B液,后加A液,上机前离心处理;反应程序如下:先95 ℃预变性30s,然后95 ℃变性5s,最后60 ℃退火34s,反应程序共40个循环;
(4)标准曲线的绘制:将实验室已经成功制备的pcDNA3.1-VP1质粒作为阳性标准品备用;将阳性标准品质粒换算拷贝数后,进行连续的10倍倍比稀释,从1∶10到1∶10 9 共设置9个浓度梯度,每个梯度设置3个重复,于ABI 7500型荧光定量PCR仪中进行扩增,同时设置去离子水为阴性对照;扩增结束后收集数据,根据扩增曲线图、CT值情况,得出最佳的检测区域,并绘制标准曲线;
(5)绝对荧光定量PCR方法的灵敏度和特异性试验:通过标准曲线的绘制显示可检测到仅含10个病毒DNA拷贝数的鸡传染性贫血病病毒,体现出绝对荧光定量PCR方法的灵敏度;将实验室已有的禽腺病毒FAdV、禽白血病病毒ALV和网状内皮组织增生症病毒REV提取相应核酸,按照扩增体系运行程序;同时设鸡传染性贫血病病毒阳性对照及去离子水的阴性对照,检测结果体现出绝对荧光定量PCR方法的特异性。
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