[发明专利]一种鸡传染性贫血病病毒绝对荧光定量PCR检测方法在审

专利信息
申请号: 202011574377.X 申请日: 2020-12-28
公开(公告)号: CN112522447A 公开(公告)日: 2021-03-19
发明(设计)人: 叶建强;张俊;马莉;李拓凡;万志敏;邵红霞;秦爱建 申请(专利权)人: 扬州大学
主分类号: C12Q1/70 分类号: C12Q1/70;C12Q1/6851;C12N15/11;C12R1/93
代理公司: 扬州苏中专利事务所(普通合伙) 32222 代理人: 沈志海
地址: 225009 *** 国省代码: 江苏;32
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摘要:
搜索关键词: 一种 传染性 贫血病 病毒 绝对 荧光 定量 pcr 检测 方法
【权利要求书】:

1.一种鸡传染性贫血病病毒绝对荧光定量PCR检测方法,其特征在于,包括以下步骤:

(1)鸡传染性贫血病病毒基因组DNA的提取:鸡传染性贫血病病毒基因组DNA的提取通过使用Axygen公司的DNA小提试剂盒AxyPrepTM Multisource Genomic DNA完成;

(2)引物的设计与合成:根据鸡传染性贫血病病毒VP1基因的高度保守区,设计并合成了扩增片段大小为140bp的上下游引物,引物序列如下:上游引物为VP1-F:5′-GCCCCGGTACGTATAGTGTG-3′;下游引物为VP1-R:5′-CCCGTACATGTGGTCTGCAT-3′;引物使用前,用超纯水溶解,使用浓度为10pmol,-20℃保存备用;

(3)绝对荧光定量PCR方法的建立:通过使用TaKaRa公司的TB Green™ Premix Ex Taq™ II试剂来进行绝对荧光定量PCR方法的建立,反应体系为20μL:A液:模板2μL,双蒸水6μL;B液:TB Green Premix Ex Taq II(2×)10μL,上下游引物各0.8μL,ROX Reference DyeⅡ(50×)0.4μL;加样时先在八联管反应管里加入B液,后加A液,上机前离心处理;反应程序如下:先95 ℃预变性30s,然后95 ℃变性5s,最后60 ℃退火34s,反应程序共40个循环;

(4)标准曲线的绘制:将实验室已经成功制备的pcDNA3.1-VP1质粒作为阳性标准品备用;将阳性标准品质粒换算拷贝数后,进行连续的10倍倍比稀释,从1∶10到1∶10 9 共设置9个浓度梯度,每个梯度设置3个重复,于ABI 7500型荧光定量PCR仪中进行扩增,同时设置去离子水为阴性对照;扩增结束后收集数据,根据扩增曲线图、CT值情况,得出最佳的检测区域,并绘制标准曲线;

(5)绝对荧光定量PCR方法的灵敏度和特异性试验:通过标准曲线的绘制显示可检测到仅含10个病毒DNA拷贝数的鸡传染性贫血病病毒,体现出绝对荧光定量PCR方法的灵敏度;将实验室已有的禽腺病毒FAdV、禽白血病病毒ALV和网状内皮组织增生症病毒REV提取相应核酸,按照扩增体系运行程序;同时设鸡传染性贫血病病毒阳性对照及去离子水的阴性对照,检测结果体现出绝对荧光定量PCR方法的特异性。

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