[发明专利]检测紫外照射后微生物基因组损伤的方法在审
申请号: | 202011578566.4 | 申请日: | 2020-12-28 |
公开(公告)号: | CN112538522A | 公开(公告)日: | 2021-03-23 |
发明(设计)人: | 不公告发明人 | 申请(专利权)人: | 至微生物智能科技(厦门)有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6851 | 分类号: | C12Q1/6851 |
代理公司: | 北京华创智道知识产权代理事务所(普通合伙) 11888 | 代理人: | 彭随丽 |
地址: | 361000 福建省厦门市*** | 国省代码: | 福建;35 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 检测 紫外 照射 微生物 基因组 损伤 方法 | ||
1.一种检测紫外照射后微生物基因组损伤的方法,其特征在于,包括以下步骤:
获取培养后的微生物,取部分微生物进行不同时长的紫外照射,照射后作为检测样本,未进行紫外照射的另一部分微生物作为对照样本;
裂解所述检测样本和所述对照样本;
分别对裂解后的所述检测样本和所述对照样本离心处理,获得上清,作为荧光定量PCR的模板;
取等量作为模板的上清加入两个PCR反应体系中,一个扩增短片段,另一个扩增长片段;
得到所述对照样本的CT差值为:ΔCTCK=CT长-CT短,所述检测样本的CT差值为:ΔCTuv=CT长-CT短,采用ΔΔCT=ΔCTuv-ΔCTCK判断紫外对DNA的损伤。
2.根据权利要求1所述的检测紫外照射后微生物基因组损伤的方法,其特征在于,获得检测方法的检测限为所述对照样本标准偏差的3倍;
所述对照样本标准偏差为按照裂解,离心获得上清,以及将上清加入两个PCR反应体系中扩增短片段和长片段的步骤对所述对照样本进行20次相同的荧光定量PCR反应后得到。
3.根据权利要求2所述的检测紫外照射后微生物基因组损伤的方法,其特征在于,采用裂解液A裂解所述检测样本和所述对照样本,裂解时间为2分钟;
所述裂解液A的组成包括:
PH=8.0的Tris-HCL 10mM
Triton X-100 1%。
4.根据权利要求3所述的检测紫外照射后微生物基因组损伤的方法,其特征在于,所述离心处理的离心速度为6000rpm,离心时间为2min。
5.根据权利要求4所述的检测紫外照射后微生物基因组损伤的方法,其特征在于,所述PCR反应体系中具有:PCR反应液B、PCR反应液C和酶液D;
所述PCR反应液B的组成包括:
溶剂为灭菌水;
所述PCR反应液C的组成包括:
溶剂为灭菌水;
所述酶液D的成分为DNA聚合酶。
6.根据权利要求5所述的检测紫外照射后微生物基因组损伤的方法,其特征在于,所述PCR反应体系中的PCR反应液B或者PCR反应液C的体积为17.7ul,酶液D的体积为0.3ul,上清的体积为2ul。
7.根据权利要求6所述的检测紫外照射后微生物基因组损伤的方法,其特征在于,所述PCR反应体系中的荧光定量PCR反应程序为:
第2-4步循环35次。
8.根据权利要求1至7中任一项所述的检测紫外照射后微生物基因组损伤的方法,其特征在于,还包括将作为模板的阳性对照E和阴性对照F加入两个PCR反应体系中;
所述阳性对照E的成分为基因组DNA;
所述阴性对照F为所述裂解液A。
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