[发明专利]一种番茄斑萎属病毒核酸标准物质的制备方法在审
申请号: | 202011579953.X | 申请日: | 2020-12-28 |
公开(公告)号: | CN112553220A | 公开(公告)日: | 2021-03-26 |
发明(设计)人: | 李旻 | 申请(专利权)人: | 昆明海关技术中心 |
主分类号: | C12N15/40 | 分类号: | C12N15/40;C12N15/70;C12N15/10 |
代理公司: | 北京知汇林知识产权代理事务所(普通合伙) 11794 | 代理人: | 董涛 |
地址: | 650034 云*** | 国省代码: | 云南;53 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 番茄 斑萎属 病毒 核酸 标准 物质 制备 方法 | ||
1.一种番茄斑萎属病毒的核酸标准物质的制备方法,其特征在于,包括以下步骤:
1)选择番茄斑萎属病毒的基因保守区域序列为扩增靶区,如序列表中SEQ ID N0.1所示,所述基因为TSWV复制酶基因中的一段序列;
2)设计合成对该基因选定区域的上下游引物;
3)获取复制酶基因DNA片段,所述基因序列如序列表中SEQ ID N0.1所示;
4)经鉴定后获得的重组菌株进行大量培养,提取pGEM-R质粒DNA;
5)将获得的质粒DNA进行BsaI酶切线性化,用Promega反转录试剂盒进行反转录获得RNA序列,序列如序列表中SEQ ID N0.2所示;
6)纯化获得的RNA分子,并加入DNase消化模板DNA,最后用无RNA酶的灭菌水稀释定量RNA;
7)定量RNA浓度及拷贝数,将最终纯化产物进行稀释定量后,分装于EP管中,-80℃保存。
2.根据权利要求1所述的制备方法,其特征在于,复制酶基因DNA片段,具体过程如下:
提取病毒粒子的RNA序列或者病毒侵染的植物样本组织,用随机引物做反转录,获得cDNA序列,再用设计的复制酶基因特异性引物扩增目标片段,所述一对特异性引物为:
RdRp-F:5’-GCAACTAACGCCACACCTGAC-3’
RdRp-R:5’-GGTCTCGTAACAAGTGAATCAATTATTCTTTC-3’;
预期扩增产物为TSWV的复制酶基因的566bp,并用SacII/SpeI双酶切后回收纯化。
3.根据权利要求1所述的制备方法,其特征在于,定量RNA浓度及拷贝数具体步骤为,取纯化后的体外转录物RNA分子,用不含RNase的灭菌水进行梯度稀释,10、20、30、40、50和100倍,测定不同浓度样品的OD260和OD280,根据目标序列的核苷酸长度,经过计算,最终获得RNA分子在单位体积内的数量,用pmol表示。
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