[发明专利]伊立替康个体化用药基因的指导方法及试剂盒在审

专利信息
申请号: 202011601073.8 申请日: 2020-12-29
公开(公告)号: CN112553339A 公开(公告)日: 2021-03-26
发明(设计)人: 陈涛;张静;袁昕昕;林金飞 申请(专利权)人: 广东南芯医疗科技有限公司
主分类号: C12Q1/6886 分类号: C12Q1/6886;C12Q1/6858;C12N15/11
代理公司: 上海上谷知识产权代理有限公司 31342 代理人: 蔡继清
地址: 510700 广东省*** 国省代码: 广东;44
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摘要:
搜索关键词: 伊立替康 个体化 用药 基因 指导 方法 试剂盒
【权利要求书】:

1.一种伊立替康个体化用药基因的指导试剂盒,其特征在于,所述试剂盒包括PCR扩增引物对组,所述PCR扩增引物对组包括特异性扩增选自下组的SNP位点的引物对:rs6072249、rs9351963、rs2032582、rs1128503、rs1045642、rs1801133、rs4148323、rs2306283、rs1051266、rs562和rs425215。

2.如权利要求1所述的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒还包括单碱基延伸引物组。

3.如权利要求1所述的试剂盒,其特征在于,所述PCR扩增引物对组中:

特异性扩增rs6072249的引物对如SEQ ID NO.1至SEQ ID NO.2所示;

特异性扩增rs9351963的引物对如SEQ ID NO.3至SEQ ID NO.4所示;

特异性扩增rs2032582的引物对如SEQ ID NO.5至SEQ ID NO.6所示;

特异性扩增rs1128503的引物对如SEQ ID NO.7至SEQ ID NO.8所示;

特异性扩增rs1045642的引物对如SEQ ID NO.9至SEQ ID NO.10所示;

特异性扩增rs1801133的引物对如SEQ ID NO.11至SEQ ID NO.12所示;

特异性扩增rs4148323的引物对如SEQ ID NO.13至SEQ ID NO.14所示;

特异性扩增rs2306283的引物对如SEQ ID NO.15至SEQ ID NO.16所示;

特异性扩增rs1051266的引物对如SEQ ID NO.17至SEQ ID NO.18所示;

特异性扩增rs562的引物对如SEQ ID NO.19至SEQ ID NO.20所示;和/或

特异性扩增rs425215的引物对如SEQ ID NO.21至SEQ ID NO.22所示。

4.如权利要求2所述的试剂盒,其特征在于,所述单碱基延伸引物组中:

针对rs6072249的延伸引物如SEQ ID NO.23所示;

针对rs9351963的延伸引物如SEQ ID NO.24所示;

针对rs2032582的延伸引物如SEQ ID NO.25所示;

针对rs1128503的延伸引物如SEQ ID NO.26所示;

针对rs1045642的延伸引物如SEQ ID NO.27所示;

针对rs1801133的延伸引物如SEQ ID NO.28所示;

针对rs4148323的延伸引物如SEQ ID NO.29所示;

针对rs2306283的延伸引物如SEQ ID NO.30所示;

针对rs1051266的延伸引物如SEQ ID NO.31所示;

针对rs562的延伸引物如SEQ ID NO.32所示;和/或

针对rs425215的延伸引物如SEQ ID NO.33所示。

5.如权利要求2所述的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒包括第一容器,所述第一容器内含有所述PCR扩增引物对组;和/或

所述试剂盒包括第二容器,所述第二容器内含有所述单碱基延伸引物组。

6.一种基于多重PCR飞行时间质谱检测伊立替康个体化用药基因SNP基因突变位点的方法,其特征在于,包括以下步骤:

(1)以待测样品外周血基因组DNA为模板,进行PCR扩增,得扩增产物;

(2)应用虾碱式磷酸酶对步骤(1)的扩增产物进行SAP处理;

(3)使用延伸引物对步骤(2)纯化后的产物进行单碱基延伸反应,得延伸产物;

(4)脱盐树脂纯化延伸产物;

(5)质谱平台检测分析,判断是否存在基因变异。

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