[发明专利]伊立替康个体化用药基因的指导方法及试剂盒在审
申请号: | 202011601073.8 | 申请日: | 2020-12-29 |
公开(公告)号: | CN112553339A | 公开(公告)日: | 2021-03-26 |
发明(设计)人: | 陈涛;张静;袁昕昕;林金飞 | 申请(专利权)人: | 广东南芯医疗科技有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6886 | 分类号: | C12Q1/6886;C12Q1/6858;C12N15/11 |
代理公司: | 上海上谷知识产权代理有限公司 31342 | 代理人: | 蔡继清 |
地址: | 510700 广东省*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 伊立替康 个体化 用药 基因 指导 方法 试剂盒 | ||
1.一种伊立替康个体化用药基因的指导试剂盒,其特征在于,所述试剂盒包括PCR扩增引物对组,所述PCR扩增引物对组包括特异性扩增选自下组的SNP位点的引物对:rs6072249、rs9351963、rs2032582、rs1128503、rs1045642、rs1801133、rs4148323、rs2306283、rs1051266、rs562和rs425215。
2.如权利要求1所述的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒还包括单碱基延伸引物组。
3.如权利要求1所述的试剂盒,其特征在于,所述PCR扩增引物对组中:
特异性扩增rs6072249的引物对如SEQ ID NO.1至SEQ ID NO.2所示;
特异性扩增rs9351963的引物对如SEQ ID NO.3至SEQ ID NO.4所示;
特异性扩增rs2032582的引物对如SEQ ID NO.5至SEQ ID NO.6所示;
特异性扩增rs1128503的引物对如SEQ ID NO.7至SEQ ID NO.8所示;
特异性扩增rs1045642的引物对如SEQ ID NO.9至SEQ ID NO.10所示;
特异性扩增rs1801133的引物对如SEQ ID NO.11至SEQ ID NO.12所示;
特异性扩增rs4148323的引物对如SEQ ID NO.13至SEQ ID NO.14所示;
特异性扩增rs2306283的引物对如SEQ ID NO.15至SEQ ID NO.16所示;
特异性扩增rs1051266的引物对如SEQ ID NO.17至SEQ ID NO.18所示;
特异性扩增rs562的引物对如SEQ ID NO.19至SEQ ID NO.20所示;和/或
特异性扩增rs425215的引物对如SEQ ID NO.21至SEQ ID NO.22所示。
4.如权利要求2所述的试剂盒,其特征在于,所述单碱基延伸引物组中:
针对rs6072249的延伸引物如SEQ ID NO.23所示;
针对rs9351963的延伸引物如SEQ ID NO.24所示;
针对rs2032582的延伸引物如SEQ ID NO.25所示;
针对rs1128503的延伸引物如SEQ ID NO.26所示;
针对rs1045642的延伸引物如SEQ ID NO.27所示;
针对rs1801133的延伸引物如SEQ ID NO.28所示;
针对rs4148323的延伸引物如SEQ ID NO.29所示;
针对rs2306283的延伸引物如SEQ ID NO.30所示;
针对rs1051266的延伸引物如SEQ ID NO.31所示;
针对rs562的延伸引物如SEQ ID NO.32所示;和/或
针对rs425215的延伸引物如SEQ ID NO.33所示。
5.如权利要求2所述的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒包括第一容器,所述第一容器内含有所述PCR扩增引物对组;和/或
所述试剂盒包括第二容器,所述第二容器内含有所述单碱基延伸引物组。
6.一种基于多重PCR飞行时间质谱检测伊立替康个体化用药基因SNP基因突变位点的方法,其特征在于,包括以下步骤:
(1)以待测样品外周血基因组DNA为模板,进行PCR扩增,得扩增产物;
(2)应用虾碱式磷酸酶对步骤(1)的扩增产物进行SAP处理;
(3)使用延伸引物对步骤(2)纯化后的产物进行单碱基延伸反应,得延伸产物;
(4)脱盐树脂纯化延伸产物;
(5)质谱平台检测分析,判断是否存在基因变异。
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