[发明专利]伊立替康个体化用药基因的指导方法及试剂盒

说明书

本发明提供了伊立替康个体化用药基因的指导方法及试剂盒，具体的本发明考虑不同癌症患者用药疗效的差异性，筛选出与伊立替康个体化用药相关基因的SNP位点的组合，利用核酸质谱仪对伊立替康相关的遗传学标识进行广泛(高通量检测位点、高通量检测样本)筛查和检验。通过本发明的方法检出成功率高、技术重现性好、性价比高，可实现单个小样本多基因的检测，满足小样本最大化使用；本发明的方法具有高准确性、高灵敏性的技术优势，检测结果稳定，提高了检测阳性率。

技术领域

本发明属于生物技术领域，具体地说，本发明涉及一种用于伊立替康个体化用药基因的指导方法及试剂盒。

背景技术

单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism，SNPs)是一种遗传标记，是指基因组水平上由于单核苷酸的变异，而引起的DNA序列的多态性。在人群中的发生频率大于1％，包括单碱基的转换、颠倒以及单碱基的插入或缺失等形式表现，是一种新的遗传标志，可以为疾病的预测、诊断、治疗以及新型药物的研制提供可靠的有效的科学根据。

SNP发生在编码区，能够影响蛋白功能，从而影响人体健康或药物代谢，主要表现在疾病易感性方面的个体差异、同一药物治疗疗效的个体差异、同一药物的不良反应的个体差异。药物遗传学或药物基因组学方法对于解决药物疗效的个体差异非常重要，尤其是在精密医学时代。

伊立替康是喜树碱的一种半合成衍生物，属于第一个特异性拓扑异构酶Ⅰ抑制剂。伊立替康是近年来治疗多种恶性肿瘤的新型化疗药物，主要用于晚期转移性大肠癌的一线治疗，也可用于其他肿瘤的辅助治疗，如：非小细胞肺癌、胃癌、胰腺癌、宫颈癌和卵巢癌等。研究表明，约20％-30％患者在接受已伊立替康为基础的联合化疗时发生3-4级迟发性腹泻和中性粒细胞减少，导致患者生活质量下降而延迟治疗，严重者导致死亡。美国FDA已经在伊立替康药品说明书上加入警示，在使用伊立替康前需检测患者是否携带有UGT1A1突变。UGT1A1*6可以作为生物标志物，预测伊立替康的重症不良反应，若该位点突变则严重的中性粒细胞减少症在伊立替康高、中、低剂量组均会发生。因此，研究伊立替康在临床用药中用药指导方法以及确认其使用安全性具有重要的意义。目前临床指导伊立替康用药的检测方法和指标比较单一，因此亟需建立一种高灵敏，经济，简单的分子技术筛查方法，预测毒性，推荐合理起始剂量，有效缩短剂量调整周期，规避严重不良反应发生风险。

发明内容

本发明的目的在于提供一种伊立替康个体化用药基因的指导方法及试剂盒。

本发明的第一方面，提供了一种伊立替康个体化用药基因的指导试剂盒，所述试剂盒包括PCR扩增引物对组，所述PCR扩增引物对组包括特异性扩增选自下组的SNP位点的引物对：rs6072249、rs9351963、rs2032582、rs1128503、rs1045642、rs1801133、rs4148323、rs2306283、rs1051266、rs562和rs425215。

在另一优选例中，所述试剂盒基于多重PCR飞行时间质谱检测伊立替康个体化用药基因SNP基因突变位点。

在另一优选例中，所述试剂盒还包括单碱基延伸引物组。

在另一优选例中，所述PCR扩增引物对组中，特异性扩增rs6072249的引物对如SEQID NO.1至SEQ ID NO.2所示。

在另一优选例中，所述PCR扩增引物对组中，特异性扩增rs9351963的引物对如SEQID NO.3至SEQ ID NO.4所示。

在另一优选例中，所述PCR扩增引物对组中，特异性扩增rs2032582的引物对如SEQID NO.5至SEQ ID NO.6所示。

在另一优选例中，所述PCR扩增引物对组中，特异性扩增rs1128503的引物对如SEQID NO.7至SEQ ID NO.8所示。