[发明专利]一种用于评估胃癌风险的生物标志物及其应用在审
申请号: | 202011604592.X | 申请日: | 2020-12-30 |
公开(公告)号: | CN112522413A | 公开(公告)日: | 2021-03-19 |
发明(设计)人: | 杨承刚;宋宏涛 | 申请(专利权)人: | 北京泱深生物信息技术有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6886 | 分类号: | C12Q1/6886;G01N33/574;G01N33/68;G16B25/10 |
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地址: | 100176 北京市大兴区荣*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 用于 评估 胃癌 风险 生物 标志 及其 应用 | ||
1.检测样本中生物标志物的试剂在制备诊断胃腺癌的产品中的应用,其特征在于,所述生物标志物包括CLDN3和MEP1B;
优选地,所述生物标志物包括CLDN3、MEP1B和CHGA;
优选地,所述生物标志物包括CLDN3、MEP1B和CXCL10;
优选地,所述生物标志物包括CLDN3、MEP1B、CHGA和CXCL10。
2.根据权利要求1所述的应用,其特征在于,所述产品包括通过测序技术、核酸杂交技术、核酸扩增技术、蛋白免疫技术检测基因标志物水平的试剂。
3.根据权利要求2所述的应用,其特征在于,所述试剂选自:
特异性识别所述生物标志物的探针;或
特异性扩增所述生物标志物的引物;或
特异性结合所述生物标志物编码的蛋白的结合剂。
4.根据权利要求1-3任一项所述的应用,其特征在于,所述样本选自组织、血液。
5.一种诊断胃腺癌的产品,其特征在于,所述产品包括检测样本中生物标志物的试剂,所述生物标志物包括CLDN3和MEP1B;
优选地,所述生物标志物包括CLDN3、MEP1B和CHGA;
优选地,所述生物标志物包括CLDN3、MEP1B和CXCL10;
优选地,所述生物标志物包括CLDN3、MEP1B、CHGA和CXCL10。
6.根据权利要求5所述的产品,其特征在于,所述产品包括试剂盒、芯片、试纸;
优选地,所述试剂盒包括qPCR试剂盒、免疫印迹检测试剂盒、免疫层析检测试剂盒、流式细胞分析试剂盒、免疫组化检测试剂盒、ELISA试剂盒和电化学发光检测试剂盒;
优选地,所述试剂盒还包括评估受试者是否患有或易患胃腺癌的说明书。
7.根据权利要求5或6所述的产品,其特征在于,所述产品还包括处理样本的试剂。
8.生物标志物在构建预测胃腺癌的计算模型或者嵌入了所述计算模型的系统中的应用,其特征在于,所述生物标志物包括CLDN3和MEP1B;
优选地,所述生物标志物包括CLDN3、MEP1B和CHGA;
优选地,所述生物标志物包括CLDN3、MEP1B和CXCL10;
优选地,所述生物标志物包括CLDN3、MEP1B、CHGA和CXCL10;
优选地,所述计算模型以生物标志物的水平作为输入变量,通过生物信息学方法进行运算,输出疾病的风险概率。
9.一种系统,其特征在于,包括:
(1)胃腺癌评估装置,其包括控制单元和存储单元,用于评估受试者是否患有胃腺癌;和
(2)彼此通信地连接的信息通信终端装置,其提供关于来自受试者的样本中权利要求1中所述的生物标志物的水平的数据;
其中,所述胃腺癌评估装置的控制单元包括:
1)数据接收单元,其接收从所述信息通信终端设备传输的关于所述样本的所述生物标志物的水平的数据;
2)判别值计算单元,其基于由所述数据接收单元接收的所述样本中所述生物标志物的水平以及具有存储在所述存储单元中的作为解释变量的所述生物标志物的水平的判别来计算判别值;
3)判别值基准评价单元,其基于由所述判别值计算单元计算的判别值,对所述受试者中的胃腺癌的情况进行评价;以及
4)评估结果发送单元,其将由所述判别值基准评估单元获得的所述受试者的评估结果发送到所述信息通信终端装置。
10.一种用于鉴定和评估药剂和/或手术治疗和/或物理治疗对胃腺癌的效果的方法,其特征在于,所述方法包括:
(1)收集患有胃腺癌的受试者提供第一样本;
(2)从所述第一样本获得基因表达谱;
(3)对所述受试者或在所述受试者上施用一种或多种候选药物和/或进行一种或多种物理或手术治疗;
(4)提供来自步骤(3)中的所述受试者的第二样本;
(5)从所述第二样本中获得基因表达谱;
(6)将步骤(2)和(5)中获得的所述基因表达谱与参考基因表达谱进行比较;以及
(7)基于步骤(6)中的所述比较,评估所述一种或多种候选药物和/或治疗是否有效对抗胃腺癌;
优选地,步骤(2)和步骤(5)中的基因为权利要求1中所述的生物标志物。
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