[发明专利]一种基于基因编辑的检测新冠病毒的方法和胶体金试纸条在审
申请号: | 202011607927.3 | 申请日: | 2021-05-28 |
公开(公告)号: | CN113156124A | 公开(公告)日: | 2021-07-23 |
发明(设计)人: | 赵大海;叶静;沈兵;许小锋 | 申请(专利权)人: | 安徽医科大学第二附属医院 |
主分类号: | G01N33/577 | 分类号: | G01N33/577;G01N33/569;G01N33/558;G01N33/543;G01N33/532;C12N15/113 |
代理公司: | 杭州君度专利代理事务所(特殊普通合伙) 33240 | 代理人: | 马聪 |
地址: | 230000 安徽省*** | 国省代码: | 安徽;34 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 基于 基因 编辑 检测 病毒 方法 胶体 试纸 | ||
1.一种检测新冠病毒的胶体金试纸条,该层析试纸条包括底板(1),在所述底板(1)上自左至右依次分布有样品垫(2)、金标垫(3)、层析垫(4)和吸收垫(5);其特征在于,所述层析垫(4)内含有FAM单抗,所述层析垫(4)包括粘贴在所述底板(1)的硝酸纤维素膜(6)、检测线(7)与质控线(8),所述质控线(8)平行排布于检测线(7)的左侧,所述质控线(8)内抗体为易包被的大分子生物素单抗,所述检测线(7)内抗体为羊抗鼠IgG。
2.根据权利要求1所述的一种检测新冠病毒的胶体金试纸条,其特征在于,所述底板(1)的材料为PVC或PS;所述样品垫(2)的材料为玻璃纤维素膜,其长度为15~20mm;所述金标垫(3)的材料为聚酯纤维素膜,其长度为5~8mm;所述层析垫(4)长度为25~30mm;所述吸收垫(5)的材料为吸水纸,其长度为15~20mm。
3.根据权利要求1所述的一种检测新冠病毒的胶体金试纸条,其特征在于,所述金标垫(3)、吸收垫(5)分别与层析垫(4)两端边缘上下交叠,边缘上下交叠部分中金标垫(3)、吸收垫(5)位于层析垫(4)上方;所述金标垫(3)与层析垫(4)重叠1mm-1.5mm;所述吸收垫(5)与层析垫(4)重叠2mm。
4.根据权利要求1所述的一种检测新冠病毒的胶体金试纸条,其特征在于,所述样品垫(2)与金标垫(3)边缘上下交叠,边缘上下交叠部分中金标垫(3)位于样品垫(2)与底板(1)之间。
5.一种使用如权利要求1-4任一所述的胶体金试纸条进行新冠病毒检测的方法,其特征在于,包括如下步骤:
1)N和ORF基因目标片段扩增
采用人工合成的含有新冠病毒N基因和ORF基因序列的质粒,取2*P6High-fidelitypremix试剂盒,在引物带领下,使用PCR仪对测试基因N和ORF目标片段进行扩增;
2)crRNA转录模板退火
根据Cas12a识别富含T的特性,针对靶标N和ORF DNA序列,设计一段在PAM序列后的20-23bp的靶点序列;
利用T7启动子(TAATACGACTCACTATAGG)+AsCas12a的scaffold序列(TAATTTCTACTCTTGTAGAT)+靶点序列(靶标DNA PAM序列后的20-23bp)构成crRNA-F,反向互补为crRNA-R,合成靶向N基因和ORF基因的crRNA-F/R两条寡核苷酸链,退火合成双链DNA;
3)体外转录crRNA
将crRNA-F/R退火合成双链DNA,体外转录并纯化获得N-crRNA、ORF-crRNA;
4)构建新冠病毒检测体系
取体外转录并纯化的N-crRNA和ORF-crRNA,N和ORF稀释成1nM和10nM,与AsCas12a250nM、ssDNA-FQ 500nM、crRNA 500nM置于缓冲液中;
5)检测分析
对测试基因N和ORF进行检测:将步骤4构建的新冠病毒检测体系,加入到去RNase的PCR中,CRISPR产物用PBS或者纯水稀释到80μl,滴加到胶体金试纸条的样品垫上,等待5-10min,观察并分析检测结果。
6.根据权利要求5所述的一种基于基因编辑的检测新冠病毒的方法,其特征在于,步骤1中N和ORF基因目标片段扩增引物名称与引物序列为:
N-target-PF-2:AAGGCCAACAACAACAAGGC
N-target-PR-2:TTTAGGCTCTGTTGGTGGGA
ORF-target-PF-2:ATCCTTTGGTGGTGCATCGT
ORF-target-PR-2:TTTAGCAAAACCAGCTACT。
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